RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000022708.6

Trim52-201, Transcript of Tripartite motif-containing 52, mousemouse

APPRIS P1 BASIC

Gene Trim52, Length 3,075 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim52-201ENSMUST00000022708 Nfatc2ipO09130 412 aa16■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Dync1i1O88485 628 aa16■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Taf3Q5HZG4 932 aa16■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 BcanQ61361 883 aa16■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Ttc19Q8CC21 365 aa16■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Tmc2Q8R4P4 888 aa16■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Krt25Q8VCW2 446 aa16■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Robo1O89026 1612 aa16■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Gm29094F6Q785 221 aa16■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Ppp4r3aQ6P2K6 820 aa16■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 SdsQ8VBT2 327 aa16■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 MthfsQ9D110 203 aa16■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Stard3nlQ9DCI3 235 aa16■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 LyarQ08288 388 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 IncenpQ9WU62 880 aa16■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Usp42B2RQC2 1324 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Zbtb40Q6PCS8 1258 aa15.99■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Slc5a1Q8C3K6 665 aa15.99■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Trim59Q922Y2 403 aa15.99■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Vmn2r23E9PXI5 849 aa15.99■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Cdca8Q8BHX3 289 aa15.99■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 L1td1Q587J6 782 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Ift57Q8BXG3 429 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Flad1Q8R123 492 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Luzp1Q8R4U7 1068 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Fbxl16A2RT62 479 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Myd88P22366 296 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Adam1aQ60813 791 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Ehd2Q8BH64 543 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Atad2Q8CDM1 1040 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Otud6bQ8K2H2 294 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Ddx60E9PZQ1 1711 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Ncoa5Q91W39 579 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Cwc25Q9DBF7 416 aa15.98■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Zbtb21E9Q444 1094 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Ankib1Q6ZPS6 1085 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Xpo4Q9ESJ0 1151 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Pcdh10E9PXQ7 1057 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Znf568E9PYI1 671 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Eya2O08575 532 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Slc4a1P04919 929 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 ZyxQ62523 564 aa15.97■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Mrps25Q9D125 171 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 TnksQ6PFX9 1320 aa15.96■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Zhx1P70121 873 aa15.96■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 4930572O03RikQ8C5Y0 211 aa15.96■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 CenpqQ9CPQ5 267 aa15.96■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Dnajc14Q921R4 703 aa15.96■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Tbc1d7Q9D0K0 293 aa15.96■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Ltb4r2Q9JJL9 360 aa15.96■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 Col14a1Q80X19 1797 aa15.96■□□□□ 0.15
Trim52-201ENSMUST00000022708 CebpaP53566 359 aa15.96■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Nbr1P97432 988 aa15.96■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Gsdma2Q32M21 443 aa15.96■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Morc2aQ69ZX6 1030 aa15.96■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Ncaph2Q8BSP2 607 aa15.96■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Ddx27Q921N6 760 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Elf2Q9JHC9 593 aa15.96■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Sos2Q02384 1333 aa15.95■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Anxa1P10107 346 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Sec62Q8BU14 398 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Eif3bQ8JZQ9 803 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Sptlc2P97363 560 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Shisa4Q8CA71 197 aa15.95■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Smc4Q8CG47 1286 aa15.95■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Frat2Q8K025 231 aa15.95■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Gm21680A0A0G2JGR8 267 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Samsn1P57725 372 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Gas2l3Q3UWW6 683 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 RgmbQ7TQ33 436 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Cep55Q8BT07 462 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Gigyf1Q99MR1 1044 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Tcof1O08784 1320 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Asap2Q7SIG6 958 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Tmem59lQ7TNI2 337 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Dnaaf4Q8R368 420 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Rdm1Q9CQK3 281 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Mei1Q9D4I2 1268 aa15.94■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Prdm1Q60636 856 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Lrrc2Q8VDB8 371 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Naa16Q9DBB4 864 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Stxbp4Q9WV89 557 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Surf1P09925 306 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Card10P58660 1021 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Itga6Q61739 1091 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Acnat2Q8BGG9 420 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Fam102bQ8BQS4 339 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Zfp202Q8C879 641 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 CerkQ8K4Q7 531 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 4930548H24RikQ9D496 437 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Dnajc25A2ALW5 357 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Fam170aQ66LM6 333 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Fsd2Q8BZ52 692 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Sil1Q9EPK6 465 aa15.93■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Prl3d2F6R3P9 224 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Anks1aP59672 1150 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Kiaa1524Q8BWY9 907 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Tmem266Q8BZB3 538 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Pde3aQ9Z0X4 1141 aa15.92■□□□□ 0.14
Trim52-201ENSMUST00000022708 Shank2Q80Z38 1476 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 49.4 ms