RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000278833.3

ROM1-201, Transcript of retinal outer segment membrane protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ROM1, Length 1,878 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1-201ENST00000278833 DUX4L2P0CJ85 424 aa22.11■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 DUX4L3P0CJ86 424 aa22.11■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 DUX4L4P0CJ87 422 aa22.11■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 DUX4L5P0CJ88 424 aa22.11■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 DUX4L6P0CJ89 424 aa22.11■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 DUX4L7P0CJ90 424 aa22.11■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 PPP1R1AQ13522 171 aa22.11■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 OPN5Q6U736 354 aa22.11■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 HOGA1Q86XE5 327 aa22.11■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 PDZD9Q8IXQ8 264 aa22.11■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 ARRDC1Q8N5I2 433 aa22.11■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 OR14K1Q8NGZ2 314 aa22.11■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 PHB2Q99623 299 aa22.11■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 ZNF700Q9H0M5 742 aa22.11■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 PARD6AQ9NPB6 346 aa22.11■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 DUX4Q9UBX2 424 aa22.11■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 KCNK7Q9Y2U2 307 aa22.11■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 A0A0A6YYD4 124 aa22.1■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 CDC14BO60729 498 aa22.1■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 ZNF806P0C7X5 589 aa22.1■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 HRH1P35367 487 aa22.1■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 CBX5P45973 191 aa22.1■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 HIST1H3AP68431 136 aa22.1■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 EXT1Q16394 746 aa22.1■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa22.1■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa22.1■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 HIST2H3AQ71DI3 136 aa22.1■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 GVQW1Q8N7I0 195 aa22.1■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 OR1S1Q8NH92 325 aa22.1■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 PHYHIPLQ96FC7 376 aa22.1■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 SELENOIQ9C0D9 397 aa22.1■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 TMEM185BQ9H7F4 350 aa22.1■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 COMMD9Q9P000 198 aa22.1■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 DBX1A6NMT0 343 aa22.09■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 SULT2B1O00204 365 aa22.09■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 GNB3P16520 340 aa22.09■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 CDAP32320 146 aa22.09■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 NKPD1Q17RQ9 610 aa22.09■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 CD163Q86VB7 1156 aa22.09■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 COQ8AQ8NI60 647 aa22.09■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 ST8SIA2Q92186 375 aa22.09■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 FBXW5Q969U6 566 aa22.09■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 ANGPTL4Q9BY76 406 aa22.09■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 CFAP54Q96N23 3096 aa22.09■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa22.09■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 A0A0U1RQV5 110 aa22.09■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 OR2AT4A6NND4 320 aa22.09■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 EFSO43281 561 aa22.09■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 BCL2L11O43521 198 aa22.09■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 LRP3O75074 770 aa22.09■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 VAMP5O95183 116 aa22.09■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 THBS4P35443 961 aa22.09■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 PRKXP51817 358 aa22.09■■□□□ 1.13
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ROM1-201ENST00000278833 C17orf107Q6ZR85 190 aa22.09■■□□□ 1.13
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ROM1-201ENST00000278833 IMMP1LQ96LU5 166 aa22.09■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 OCSTAMPQ9BR26 566 aa22.09■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 DNTTIP1Q9H147 329 aa22.09■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 PPA2Q9H2U2 334 aa22.09■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 SH2D2AQ9NP31 389 aa22.09■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 ZNF319Q9P2F9 582 aa22.09■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa22.08■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 A0A0B4J2A0 478 aa22.08■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 MFNGO00587 321 aa22.08■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 RER1O15258 196 aa22.08■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 RAMP1O60894 148 aa22.08■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 HPP00738 406 aa22.08■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 ABOP16442 354 aa22.08■■□□□ 1.13
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ROM1-201ENST00000278833 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa22.08■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 OR52W1Q6IF63 320 aa22.08■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 ZNF101Q8IZC7 436 aa22.08■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 OR56B1Q8NGI3 324 aa22.08■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 M1APQ8TC57 530 aa22.08■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 C10orf35Q96D05 121 aa22.08■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 TMEM59Q9BXS4 323 aa22.08■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 RASL12Q9NYN1 266 aa22.08■■□□□ 1.13
ROM1-201ENST00000278833 SHPKQ9UHJ6 478 aa22.08■■□□□ 1.13
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ROM1-201ENST00000278833 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
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ROM1-201ENST00000278833 BVESQ8NE79 360 aa22.07■■□□□ 1.12
ROM1-201ENST00000278833 CCDC120Q96HB5 630 aa22.07■■□□□ 1.12
ROM1-201ENST00000278833 NELFAQ9H3P2 528 aa22.07■■□□□ 1.12
ROM1-201ENST00000278833 OCIAD1Q9NX40 245 aa22.07■■□□□ 1.12
ROM1-201ENST00000278833 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ROM1-201ENST00000278833 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa22.07■■□□□ 1.12
ROM1-201ENST00000278833 V9GYS6 101 aa22.07■■□□□ 1.12
ROM1-201ENST00000278833 LNP1A1A4G5 178 aa22.07■■□□□ 1.12
ROM1-201ENST00000278833 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ROM1-201ENST00000278833 BET1O15155 118 aa22.07■■□□□ 1.12
ROM1-201ENST00000278833 GFRA3O60609 400 aa22.07■■□□□ 1.12
ROM1-201ENST00000278833 CA11O75493 328 aa22.07■■□□□ 1.12
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