RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561524.5

KIFC3-208, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 577 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	SOX14	O95416	240 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	HLA-DPB1	P04440	258 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	GRK5	P34947	590 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	RPS27	P42677	84 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	SLC15A1	P46059	708 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	RAD23A	P54725	363 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF154	Q13106	437 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF404	Q494X3	552 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	MOGAT3	Q86VF5	341 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	KLB	Q86Z14	1044 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF511	Q8NB15	262 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	NIPSNAP1	Q9BPW8	284 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	THTPA	Q9BU02	230 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	TOR3A	Q9H497	397 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	MARCH7	Q9H992	704 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	MMP26	Q9NRE1	261 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	ANK2	Q01484	3957 aa		13.97	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	XRCC2	O43543	280 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	CYB5R3	P00387	301 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	APOC1	P02654	83 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	SPARC	P09486	303 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	IRF2	P14316	349 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	FPR2	P25090	351 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	DDOST	P39656	456 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF92	Q03936	586 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	SPERT	Q8NA61	448 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	SPSB4	Q96A44	273 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	COPS4	Q9BT78	406 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	SP140L	Q9H930	580 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	NTN4	Q9HB63	628 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	AUP1	Q9Y679	476 aa		13.96	□□□□□ -0.17
KIFC3-208	ENST00000561524	DHRS12	A0PJE2	317 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	TRIM77	I1YAP6	450 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	GYPB	P06028	91 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	PSKH1	P11801	424 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	PMEL	P40967	661 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	PAX8	Q06710	450 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	TAF13	Q15543	124 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	OR8G1	Q15617	311 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	ZNF771	Q7L3S4	317 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	KIRREL3-AS3	Q8N7Y1	241 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	OR11L1	Q8NGX0	322 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	MRI1	Q9BV20	369 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	YY1AP1	Q9H869	796 aa		13.95	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	GGT3P	A6NGU5	568 aa		13.94	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524		H3BN98	237 aa		13.94	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	GNGT2	O14610	69 aa		13.94	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	GYG2	O15488	501 aa		13.94	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	GLCE	O94923	617 aa		13.94	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	CLU	P10909	449 aa		13.94	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	PAX2	Q02962	417 aa		13.94	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	MZT1	Q08AG7	82 aa		13.94	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		13.94	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		13.94	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		13.94	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	SHF	Q7M4L6	423 aa		13.94	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	NLRC3	Q7RTR2	1065 aa		13.94	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		13.94	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	INTS14	Q96SY0	518 aa		13.94	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	CENPM	Q9NSP4	180 aa		13.94	□□□□□ -0.18
KIFC3-208	ENST00000561524	NUP50	Q9UKX7	468 aa		13.94	□□□□□ -0.18

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