RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 DCKP27707 260 aa15.89■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 ENTPD1P49961 510 aa15.89■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 BSPH1Q075Z2 132 aa15.89■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 ST3GAL4Q11206 333 aa15.89■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 MEP1BQ16820 701 aa15.89■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 FAM27BQ5VT28 67 aa15.89■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 ADAM5Q6NVV9 412 aa15.89■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 SHFQ7M4L6 423 aa15.89■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 P2RY8Q86VZ1 359 aa15.89■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 ZNF611Q8N823 705 aa15.89■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP15.89■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 MYDGFQ969H8 173 aa15.89■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 JAM3Q9BX67 310 aa15.89■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 YIPF3Q9GZM5 350 aa15.89■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 NPAP1Q9NZP6 1156 aa15.89■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 DSCAMO60469 2012 aa15.89■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 CADP27708 2225 aa15.88■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 RAD51DO75771 328 aa15.88■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 CD3EP07766 207 aa15.88■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 LYNP07948 512 aa15.88■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 B4GALT1P15291 398 aa15.88■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 ZNF823P16415 610 aa15.88■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 TGFBR3Q03167 851 aa15.88■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 SGCAQ16586 387 aa15.88■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 SHEQ5VZ18 495 aa15.88■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 ZNF813Q6ZN06 617 aa15.88■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 SLC22A24Q8N4F4 322 aa15.88■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 OR10H5Q8NGA6 315 aa15.88■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 OR1K1Q8NGR3 316 aa15.88■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 HTRA1Q92743 480 aa15.88■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 MUCL1Q96DR8 90 aa15.88■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 TMEM80Q96HE8 168 aa15.88■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 BOD1Q96IK1 185 aa15.88■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 MNTQ99583 582 aa15.88■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 EMC7Q9NPA0 242 aa15.88■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa15.88■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 CIB4A0PJX0 185 aa15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 SEC14L2O76054 403 aa15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 RAB36O95755 333 aa15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 HTR1AP08908 422 aa15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 ADRA2AP08913 450 aa15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 OR2T7P0C7T2 308 aa15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 OR8G3PP0DMU2 310 aa15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 PSKH1P11801 424 aa15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 ACTC1P68032 377 aa15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 ACTA1P68133 377 aa15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 MVKQ03426 396 aa15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 GABRA6Q16445 453 aa15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 Q5PR19 223 aa15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 C9orf135Q5VTT2 229 aa15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 OTPQ5XKR4 325 aa15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 ANKRD16Q6P6B7 361 aa15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 SSX8Q7RTT4 187 aa15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 PRSS48Q7RTY5 328 aa15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 DPY19L4Q7Z388 723 aa15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 SLC35F2Q8IXU6 374 aa15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 STX19Q8N4C7 294 aa15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 ACBD7Q8N6N7 88 aa15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 OR6N2Q8NGY6 317 aa15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 OR2T27Q8NH04 317 aa15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 OTOSQ8NHW6 89 aa15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 NEUROG1Q92886 237 aa15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 ZNF416Q9BWM5 594 aa15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 INPP5EQ9NRR6 644 aa15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 ERVK-18Q9QC07 812 aa15.87■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 C12orf71A8MTZ7 269 aa15.86■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 RGS10O43665 173 aa15.86■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 FARS2O95363 451 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 CST2P09228 141 aa15.86■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 PIGFQ07326 219 aa15.86■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 RNLSQ5VYX0 342 aa15.86■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 KLHL24Q6TFL4 600 aa15.86■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 ZNF454Q8N9F8 522 aa15.86■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 KBTBD8Q8NFY9 601 aa15.86■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 OR10H4Q8NGA5 316 aa15.86■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 OR52N5Q8NH56 324 aa15.86■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 PERPQ96FX8 193 aa15.86■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 CDCA4Q9BXL8 241 aa15.86■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 GSX2Q9BZM3 304 aa15.86■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 SLC25A15Q9Y619 301 aa15.86■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 LHFPL6Q9Y693 200 aa15.86■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa15.86■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 TMCC2O75069 709 aa15.85■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 SPARCP09486 303 aa15.85■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 FOSL1P15407 271 aa15.85■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 PAX1P15863 534 aa15.85■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 ALOX5APP20292 161 aa15.85■□□□□ 0.13
PTX4-201ENST00000293922 RPS27P42677 84 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.1 ms