RNA–Protein interactions for RNA: YMR320W

YMR320W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YMR320W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR320WYMR320W UBC9P50623 157 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
YMR320WYMR320W FHN1P53279 174 aa3.09□□□□□ -1.91
YMR320WYMR320W CWC24P53769 259 aa3.09□□□□□ -1.91
YMR320WYMR320W SVF1Q05515 481 aa3.09□□□□□ -1.91
YMR320WYMR320W PRC1P00729 532 aa3.08□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W ERG11P10614 530 aa3.08□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W TOP3P13099 656 aa3.08□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W DAL7P21826 554 aa3.08□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W NMD2P38798 1089 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W SFB3P38810 929 aa3.08□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W ATG4P53867 494 aa3.08□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W LRS4Q04087 347 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W GAD1Q04792 585 aa3.08□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W YCL002CP25565 263 aa3.07□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W PET10P36139 283 aa3.07□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W YBR284WP38150 797 aa3.07□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W XBP1P40489 647 aa3.07□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W MSD1P15179 658 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W SPC29P33419 253 aa3.06□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W FMO1P38866 432 aa3.06□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W LYS9P38999 446 aa3.06□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W MEP2P41948 499 aa3.06□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W NNF1P47149 201 aa3.06□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W NIT3P49954 291 aa3.06□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W TAD1P53065 400 aa3.06□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W SUB1P54000 292 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W SLK19Q08581 821 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W STE4P18851 423 aa3.05□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W CDC11P32458 415 aa3.05□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W PHO11P35842 467 aa3.05□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W EMC3P36039 253 aa3.05□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W PHO12P38693 467 aa3.05□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W SPF1P39986 1215 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W NUG1P40010 520 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W MAD1P40957 749 aa3.05□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W MTL1P53214 551 aa3.05□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W MLH3Q12083 715 aa3.05□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W CCR4P31384 837 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W MVD1P32377 396 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W SCT1P32784 759 aa3.04□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W YBR184WP38299 523 aa3.04□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W NUP60P39705 539 aa3.04□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W ALR2P43553 858 aa3.04□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W OSW7P43611 510 aa3.04□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W ATG36P46983 293 aa3.04□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W MTR3P48240 250 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W VPS72Q03388 795 aa3.04□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W GEP3Q08622 556 aa3.04□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W HBN1Q96VH4 193 aa3.04□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W THR1P17423 357 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W SWE1P32944 819 aa3.03□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W SET5P38890 526 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W RSP5P39940 809 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W UTP8P53276 713 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W RTS3P53289 263 aa3.03□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W YPL068CQ02749 293 aa3.03□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W FMP25Q08023 583 aa3.03□□□□□ -1.92
YMR320WYMR320W NUP1P20676 1076 aa3.02□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W FUB1P25659 250 aa3.02□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W SAP190P36123 1033 aa3.02□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W NAB3P38996 802 aaKnown RBP RIP-Chip data3.02□□□□□ -1.93not detected
YMR320WYMR320W GYP8P43570 497 aa3.02□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W CTK1Q03957 528 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W YBR182C-AQ8TGU6 64 aa3.02□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W MBR1P23493 339 aa3.01□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W SET3P36124 751 aa3.01□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W GMH1P36125 273 aa3.01□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W YHR112CP38716 378 aa3.01□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W NOP2P40991 618 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W ZIP2P53061 704 aa3.01□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W FMP30Q02883 468 aa3.01□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W NOP1P15646 327 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W RPA135P22138 1203 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W APN1P22936 367 aa3□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W FPR3P38911 411 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W PRP31P49704 494 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W TDA5Q06417 326 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W UBX5Q06682 500 aa3□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W USV1Q12132 391 aa3□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W HRP1Q99383 534 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W ADE2P21264 571 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W APL2P36000 726 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W HXT16P47185 567 aa2.99□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W HFD1Q04458 532 aa2.99□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W REH1Q06709 432 aa2.99□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W GIN4Q12263 1142 aa2.99□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W ERG6P25087 383 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W SAT4P25333 603 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W KCC4P25389 1037 aa2.98□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W TOM20P35180 183 aa2.98□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W RRP14P36080 434 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W TRZ1P36159 838 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W YMC2P38087 329 aa2.98□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W MIT1P40002 666 aa2.98□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W UBP6P43593 499 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W YBP2P53169 641 aa2.98□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W ARG5,6Q01217 863 aa2.98□□□□□ -1.93
YMR320WYMR320W ZRT2Q12436 422 aa2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 93.3 ms