RNA–Protein interactions for RNA: YHR135C

YCK1, Transcript of Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform, yeast

Gene YCK1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	YHR135C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	YSC83	P32792	385 aa		6.63	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	KTR2	P33550	425 aa		6.63	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	DUS4	Q06063	367 aa		6.63	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	SIL1	Q08199	421 aa		6.63	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	TY1B-A	O13527	1196 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	CCP1	P00431	361 aa		6.62	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	HAP4	P14064	554 aa		6.62	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	CHS2	P14180	963 aa		6.62	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	EUG1	P32474	517 aa		6.62	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	UBP13	P38187	747 aa		6.62	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	SMF1	P38925	575 aa		6.62	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	GPB2	P39717	880 aa		6.62	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	NET1	P47035	1189 aa		6.62	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	VID30	P53076	958 aa		6.62	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	TAM41	P53230	385 aa		6.62	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	YGR125W	P53273	1036 aa		6.62	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	TIM8	P57744	87 aa		6.62	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	NGL3	Q03210	505 aa		6.62	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	RBA50	Q04418	439 aa		6.62	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	YLR297W	Q05899	129 aa		6.62	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	OPY2	Q06810	360 aa		6.62	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	PHO87	P25360	923 aa		6.61	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	DPB3	P27344	201 aa		6.61	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	IRE1	P32361	1115 aa		6.61	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	CDC11	P32458	415 aa		6.61	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	TCD1	P38756	429 aa		6.61	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	VPS53	P47061	822 aa		6.61	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.61	□□□□□ -1.35	RIP-Chip
YCK1	YHR135C	YMR321C	Q04898	105 aa		6.61	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	CUR1	Q06469	252 aa		6.61	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	SLX4	Q12098	748 aa		6.61	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	NOP14	Q99207	810 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	LAA1	P39526	2014 aa		6.61	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	SSA4	P22202	642 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.61	□□□□□ -1.35	not detected
YCK1	YHR135C	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	HXT1	P32465	570 aa		6.61	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	SRB4	P32569	687 aa		6.61	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	LTV1	P34078	463 aa		6.61	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	ATG19	P35193	415 aa		6.61	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	CAB3	P36076	571 aa		6.61	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	CUZ1	P53899	274 aa		6.61	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	ROD1	Q02805	837 aa		6.61	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	SWI6	P09959	803 aa		6.6	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	ERG11	P10614	530 aa		6.6	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	MCM1	P11746	286 aa		6.6	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	CKI1	P20485	582 aa		6.6	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	MUD1	P32605	298 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	CEM1	P39525	442 aa		6.6	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	BUD16	P39988	312 aa		6.6	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	KTR7	P40504	517 aa		6.6	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	SDS3	P40505	327 aa		6.6	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	SCS3	P53012	380 aa		6.6	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	ATG23	Q06671	453 aa		6.6	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	GPI13	Q07830	1017 aa		6.6	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	DIT1	P21623	536 aa		6.59	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	YUR1	P26725	428 aa		6.59	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	TVP38	P36164	337 aa		6.59	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	SMC3	P47037	1230 aa		6.59	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	MAL13	P53338	473 aa		6.59	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	DON1	Q05610	365 aa		6.59	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	YPQ2	Q06328	317 aa		6.59	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	SMC5	Q08204	1093 aa		6.59	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	DAS2	Q12084	232 aa		6.59	□□□□□ -1.35
YCK1	YHR135C	RIF1	P29539	1916 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	CYT1	P07143	309 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	YEL043W	P32618	956 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	COT1	P32798	439 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	TFC4	P33339	1025 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	YEL025C	P39991	1188 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	COS5	P47187	383 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	TPO2	P53283	614 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	RTT102	P53330	157 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	COQ9	Q05779	260 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	TY1A-DR3	Q12441	440 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	TOM1	Q03280	3268 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	HVG1	P0CE11	249 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	RPO26	P20435	155 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	YKL050C	P35736	922 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	EAF5	P39995	279 aa		6.58	□□□□□ -1.36
YCK1	YHR135C	YNL146W	P53906	100 aa		6.58	□□□□□ -1.36

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