RNA–Protein interactions for RNA: YGR035C

YGR035C, Transcript of Putative protein of unknown function, potential Cdc28p substrate, yeast

Gene YGR035C, Length 351 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YGR035C	YGR035C	GAD1	Q04792	585 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YGR035C	YGR035C	HOF1	Q05080	669 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YGR035C	YGR035C	AFT2	Q08957	416 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YGR035C	YGR035C	FLC1	Q08967	793 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YGR035C	YGR035C	TAF3	Q12297	353 aa		3.43	□□□□□ -1.86
YGR035C	YGR035C	DIF1	O13577	133 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YGR035C	YGR035C	PER1	P25625	357 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YGR035C	YGR035C	EMP70	P32802	667 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YGR035C	YGR035C	UBS1	P38290	277 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YGR035C	YGR035C	MTL1	P53214	551 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YGR035C	YGR035C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
YGR035C	YGR035C	ATP25	Q03153	612 aa		3.42	□□□□□ -1.86
YGR035C	YGR035C	SPO11	P23179	398 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YGR035C	YGR035C	GLG1	P36143	616 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YGR035C	YGR035C	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YGR035C	YGR035C	NDC80	P40460	691 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YGR035C	YGR035C	CTR1	P49573	406 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YGR035C	YGR035C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YGR035C	YGR035C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
YGR035C	YGR035C	RTA1	P53047	317 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YGR035C	YGR035C	YBP2	P53169	641 aa		3.41	□□□□□ -1.86
YGR035C	YGR035C	SIR3	P06701	978 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	SPC29	P33419	253 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	SFB3	P38810	929 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	3.4	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	TY4A-J	P47023	414 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	ALY2	P47029	1046 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	CAN1	P04817	590 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	YHR112C	P38716	378 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	ECM1	P39715	212 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	FMO1	P38866	432 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.38	□□□□□ -1.87	not detected
YGR035C	YGR035C	LYS9	P38999	446 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	YEL020C	P39994	560 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	ARG2	P40360	574 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	HUL5	P53119	910 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	YDR338C	Q05497	695 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	ICT1	Q12385	394 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	PHO11	P35842	467 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	PHO12	P38693	467 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	NUP60	P39705	539 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	ATG4	P53867	494 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	YAP7	Q08182	245 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	MLH3	Q12083	715 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	RPN13	O13563	156 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	BDH2	P39713	417 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	FHN1	P53279	174 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	ORC4	P54791	529 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	ARG5,6	Q01217	863 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	ZRT2	Q12436	422 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	YLR149C	Q99296	730 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	YFL052W	P43551	465 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	GLO1	P50107	326 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YGR035C	YGR035C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
YGR035C	YGR035C	GAL11	P19659	1081 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YGR035C	YGR035C	TMT1	P32643	299 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YGR035C	YGR035C	ORC2	P32833	620 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YGR035C	YGR035C	APT2	P36973	181 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YGR035C	YGR035C	PAC2	P39937	518 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YGR035C	YGR035C	YJL049W	P47048	450 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YGR035C	YGR035C	BNA2	P47125	453 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YGR035C	YGR035C	USV1	Q12132	391 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YGR035C	YGR035C	VPS34	P22543	875 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YGR035C	YGR035C	MTC2	P34246	357 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YGR035C	YGR035C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
YGR035C	YGR035C	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
YGR035C	YGR035C	GDH3	P39708	457 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YGR035C	YGR035C	GET2	P40056	285 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YGR035C	YGR035C	NPY1	P53164	384 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YGR035C	YGR035C	MCM21	Q06675	368 aa		3.32	□□□□□ -1.88
YGR035C	YGR035C	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
YGR035C	YGR035C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
YGR035C	YGR035C	FUB1	P25659	250 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YGR035C	YGR035C	MCD4	P36051	919 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YGR035C	YGR035C	SET3	P36124	751 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YGR035C	YGR035C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
YGR035C	YGR035C	SEC5	P89102	971 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YGR035C	YGR035C	REC102	Q02721	264 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YGR035C	YGR035C	OSW1	Q08692	278 aa		3.31	□□□□□ -1.88
YGR035C	YGR035C	GMH1	P36125	273 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YGR035C	YGR035C	RIM13	Q03792	727 aa		3.3	□□□□□ -1.88
YGR035C	YGR035C	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
YGR035C	YGR035C	PEX1	P24004	1043 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YGR035C	YGR035C	MUP3	P38734	546 aa		3.29	□□□□□ -1.88
YGR035C	YGR035C	COX18	P53239	316 aa		3.29	□□□□□ -1.88

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