RNA–Protein interactions for RNA: Q0055

AI2, Reverse transcriptase required for splicing of the COX1 pre-mRNA, yeast

Gene AI2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AI2	Q0055	GRX6	Q12438	231 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	FBP1	P09201	348 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	KAR3	P17119	729 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	ROX1	P25042	368 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	EMC3	P36039	253 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	PSY4	P38193	441 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	VHR1	P40522	640 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	RKM2	Q03942	479 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	HSP42	Q12329	375 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		3.14	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	BIK1	P11709	440 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	DIT1	P21623	536 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	BRF1	P29056	596 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	YKL107W	P34251	309 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	MRPL16	P38064	232 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	YHR202W	P38887	602 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	BEM4	P39011	633 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	DSS1	P39112	969 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	SKP2	P42843	763 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	CTF18	P49956	741 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	ZDS2	P54786	942 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	LCD1	Q04377	747 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	YLR352W	Q06479	807 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	SOG2	Q08817	791 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	GUP2	Q08929	609 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	REC107	P21651	314 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	YCL002C	P25565	263 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	MLS1	P30952	554 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	TFB1	P32776	642 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	PTH2	P34222	208 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	YKL050C	P35736	922 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	ADD66	P36040	267 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	DID4	P36108	232 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	MXR1	P40029	184 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	CIT3	P43635	486 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	YJR039W	P47107	1121 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	CUZ1	P53899	274 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	EST2	Q06163	884 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	GNT1	Q12096	491 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	HAL9	Q12180	1030 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		3.13	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.12	□□□□□ -1.91	not detected
AI2	Q0055	CDC16	P09798	840 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	PET123	P17558	318 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	ALG3	P38179	458 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	MAD3	P47074	515 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	JJJ3	P47138	172 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	RAD17	P48581	401 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	PXA2	P34230	853 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	YKR051W	P36142	418 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	GEM1	P39722	662 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	DOT6	P40059	670 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	GID8	P40208	455 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	TEP1	P53916	434 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	MET7	Q08645	548 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	THI21	Q08975	551 aa		3.12	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	INH1	P01097	85 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	SNF5	P18480	905 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	DOM34	P33309	386 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	RGD1	P38339	666 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	SWD1	P39706	426 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	FIR1	P40020	876 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	HFM1	P51979	1187 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	VTI1	Q04338	217 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	SYT1	Q06836	1226 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	GUD1	Q07729	489 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	PCD1	Q12524	340 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	RMP1	Q12530	201 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	CMP2	P14747	604 aa		3.11	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
AI2	Q0055	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91

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