RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

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Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
SYT6-210ENST00000641643 DUOX1Q9NRD9 1551 aa28.25■■■□□ 2.11
SYT6-210ENST00000641643 G3V3G9 751 aa28.24■■■□□ 2.11
SYT6-210ENST00000641643 FOXO4P98177 505 aa28.24■■■□□ 2.11
SYT6-210ENST00000641643 CXCL9Q07325 125 aa28.24■■■□□ 2.11
SYT6-210ENST00000641643 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
SYT6-210ENST00000641643 DCAF8Q5TAQ9 597 aa28.24■■■□□ 2.11
SYT6-210ENST00000641643 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
SYT6-210ENST00000641643 MINPP1Q9UNW1 487 aa28.24■■■□□ 2.11
SYT6-210ENST00000641643 SCN4AP35499 1836 aa28.23■■■□□ 2.11
SYT6-210ENST00000641643 EPHX2P34913 555 aa28.23■■■□□ 2.11
SYT6-210ENST00000641643 RARSP54136 660 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
SYT6-210ENST00000641643 CIAPIN1Q6FI81 312 aa28.23■■■□□ 2.11
SYT6-210ENST00000641643 ATP2B4P23634 1241 aa28.22■■■□□ 2.11
SYT6-210ENST00000641643 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
SYT6-210ENST00000641643 TNIP1Q15025 636 aa28.22■■■□□ 2.11
SYT6-210ENST00000641643 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
SYT6-210ENST00000641643 LMBR1LQ6UX01 489 aa28.22■■■□□ 2.11
SYT6-210ENST00000641643 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
SYT6-210ENST00000641643 DBNDD1Q9H9R9 158 aa28.22■■■□□ 2.11
SYT6-210ENST00000641643 RAD17O75943 681 aa28.21■■■□□ 2.11
SYT6-210ENST00000641643 CCDC57Q2TAC2 916 aa28.21■■■□□ 2.11
SYT6-210ENST00000641643 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
SYT6-210ENST00000641643 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.11
SYT6-210ENST00000641643 DOK7Q18PE1 504 aa28.2■■■□□ 2.1
SYT6-210ENST00000641643 TAF7LQ5H9L4 462 aa28.2■■■□□ 2.1
SYT6-210ENST00000641643 EPHA10Q5JZY3 1008 aa28.2■■■□□ 2.1
SYT6-210ENST00000641643 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
SYT6-210ENST00000641643 ECE2O60344 883 aa28.19■■■□□ 2.1
SYT6-210ENST00000641643 APLP1P51693 650 aa28.19■■■□□ 2.1
SYT6-210ENST00000641643 CHADLQ6NUI6 762 aa28.19■■■□□ 2.1
SYT6-210ENST00000641643 LDHDQ86WU2 507 aa28.19■■■□□ 2.1
SYT6-210ENST00000641643 SUCLG2Q96I99 432 aa28.19■■■□□ 2.1
SYT6-210ENST00000641643 ANKRD2Q9GZV1 360 aa28.19■■■□□ 2.1
SYT6-210ENST00000641643 UTYO14607 1347 aa28.18■■■□□ 2.1
SYT6-210ENST00000641643 KIF16BQ96L93 1317 aa28.18■■■□□ 2.1
SYT6-210ENST00000641643 YDJCA8MPS7 323 aa28.18■■■□□ 2.1
SYT6-210ENST00000641643 POTEIP0CG38 1075 aa28.18■■■□□ 2.1
SYT6-210ENST00000641643 POTEJP0CG39 1038 aa28.18■■■□□ 2.1
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SYT6-210ENST00000641643 CLEC11AQ9Y240 323 aa28.18■■■□□ 2.1
SYT6-210ENST00000641643 LTBP1Q14766 1721 aa28.18■■■□□ 2.1
SYT6-210ENST00000641643 ZBED9Q6R2W3 1325 aa28.18■■■□□ 2.1
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SYT6-210ENST00000641643 EPS15P42566 896 aa28.15■■■□□ 2.1
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SYT6-210ENST00000641643 USP44Q9H0E7 712 aa28.14■■■□□ 2.1
SYT6-210ENST00000641643 GPRC5DQ9NZD1 345 aa28.14■■■□□ 2.1
SYT6-210ENST00000641643 SPEF2Q9C093 1822 aa28.14■■■□□ 2.09
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SYT6-210ENST00000641643 ARHGAP45Q92619 1136 aa28.13■■■□□ 2.09
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SYT6-210ENST00000641643 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
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SYT6-210ENST00000641643 MED23Q9ULK4 1368 aa28.11■■■□□ 2.09
SYT6-210ENST00000641643 KCNQ5Q9NR82 932 aa28.11■■■□□ 2.09
SYT6-210ENST00000641643 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
SYT6-210ENST00000641643 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
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SYT6-210ENST00000641643 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
SYT6-210ENST00000641643 CEP350Q5VT06 3117 aa28.1■■■□□ 2.09
SYT6-210ENST00000641643 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
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SYT6-210ENST00000641643 BCAR3O75815 825 aa28.08■■■□□ 2.09
SYT6-210ENST00000641643 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
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SYT6-210ENST00000641643 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
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SYT6-210ENST00000641643 HDAC5Q9UQL6 1122 aa28.07■■■□□ 2.08
SYT6-210ENST00000641643 MICALL2Q8IY33 904 aa28.06■■■□□ 2.08
SYT6-210ENST00000641643 ANKRD44Q8N8A2 993 aa28.06■■■□□ 2.08
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SYT6-210ENST00000641643 PLIN1O60240 522 aa28.05■■■□□ 2.08
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SYT6-210ENST00000641643 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa28.04■■■□□ 2.08
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SYT6-210ENST00000641643 USP17L4A6NCW7 530 aa28.03■■■□□ 2.08
SYT6-210ENST00000641643 HTRA3P83110 453 aa28.03■■■□□ 2.08
SYT6-210ENST00000641643 USP17L1Q7RTZ2 530 aa28.03■■■□□ 2.08
SYT6-210ENST00000641643 TXNRD3Q86VQ6 643 aa28.03■■■□□ 2.08
SYT6-210ENST00000641643 TRIM27P14373 513 aa28.03■■■□□ 2.08
SYT6-210ENST00000641643 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa28.02■■■□□ 2.08
SYT6-210ENST00000641643 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
SYT6-210ENST00000641643 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
SYT6-210ENST00000641643 SNAP23O00161 211 aa28.01■■■□□ 2.07
SYT6-210ENST00000641643 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
SYT6-210ENST00000641643 KLRK1P26718 216 aa28.01■■■□□ 2.07
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