RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619151.4

BRF1-221, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 5 BASIC

Gene BRF1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-221	ENST00000619151	ZBTB7A	O95365	584 aa		33.89	■■■■□ 3.02
BRF1-221	ENST00000619151	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		33.89	■■■■□ 3.02
BRF1-221	ENST00000619151	SERPINB2	P05120	415 aa		33.88	■■■■□ 3.01
BRF1-221	ENST00000619151	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		33.88	■■■■□ 3.01
BRF1-221	ENST00000619151	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	33.88	■■■■□ 3.01
BRF1-221	ENST00000619151	REC8	O95072	547 aa		33.87	■■■■□ 3.01
BRF1-221	ENST00000619151	ERFE	Q4G0M1	354 aa		33.87	■■■■□ 3.01
BRF1-221	ENST00000619151	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		33.86	■■■■□ 3.01
BRF1-221	ENST00000619151	EVI5L	Q96CN4	794 aa		33.86	■■■■□ 3.01
BRF1-221	ENST00000619151	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		33.86	■■■■□ 3.01
BRF1-221	ENST00000619151	ATP5J	P18859	108 aa		33.85	■■■■□ 3.01
BRF1-221	ENST00000619151	CHML	P26374	656 aa		33.85	■■■■□ 3.01
BRF1-221	ENST00000619151	METTL24	Q5JXM2	366 aa		33.85	■■■■□ 3.01
BRF1-221	ENST00000619151	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		33.85	■■■■□ 3.01
BRF1-221	ENST00000619151	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		33.84	■■■■□ 3.01
BRF1-221	ENST00000619151	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		33.84	■■■■□ 3.01
BRF1-221	ENST00000619151	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	33.84	■■■■□ 3.01
BRF1-221	ENST00000619151	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	33.84	■■■■□ 3.01
BRF1-221	ENST00000619151	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		33.83	■■■■□ 3.01
BRF1-221	ENST00000619151		A0A1B0GUL7	405 aa		33.83	■■■■□ 3.01
BRF1-221	ENST00000619151	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	33.83	■■■■□ 3.01
BRF1-221	ENST00000619151	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	33.83	■■■■□ 3.01
BRF1-221	ENST00000619151	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	33.83	■■■■□ 3.01
BRF1-221	ENST00000619151	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		33.82	■■■■□ 3
BRF1-221	ENST00000619151	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	33.82	■■■■□ 3
BRF1-221	ENST00000619151	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		33.82	■■■■□ 3
BRF1-221	ENST00000619151	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		33.81	■■■■□ 3
BRF1-221	ENST00000619151	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		33.81	■■■■□ 3
BRF1-221	ENST00000619151	CNBD1	Q8NA66	436 aa		33.81	■■■■□ 3
BRF1-221	ENST00000619151	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		33.81	■■■■□ 3
BRF1-221	ENST00000619151	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		33.81	■■■■□ 3
BRF1-221	ENST00000619151	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		33.81	■■■■□ 3
BRF1-221	ENST00000619151	HIP1	O00291	1037 aa		33.79	■■■■□ 3
BRF1-221	ENST00000619151	NPHP1	O15259	732 aa		33.79	■■■■□ 3
BRF1-221	ENST00000619151	ABCC12	Q96J65	1359 aa		33.79	■■■■□ 3
BRF1-221	ENST00000619151	NLRP3	Q96P20	1036 aa		33.79	■■■■□ 3
BRF1-221	ENST00000619151	POLD1	P28340	1107 aa		33.78	■■■■□ 3
BRF1-221	ENST00000619151	TIMM10	P62072	90 aa		33.78	■■■■□ 3
BRF1-221	ENST00000619151	ATP2B3	Q16720	1220 aa		33.77	■■■■□ 3
BRF1-221	ENST00000619151	PTGER2	P43116	358 aa		33.76	■■■■□ 3
BRF1-221	ENST00000619151	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		33.76	■■■■□ 3
BRF1-221	ENST00000619151	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	33.76	■■■■□ 3
BRF1-221	ENST00000619151	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		33.76	■■■■□ 3
BRF1-221	ENST00000619151	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		33.76	■■■■□ 3
BRF1-221	ENST00000619151	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		33.76	■■■■□ 3
BRF1-221	ENST00000619151	GORAB	Q5T7V8	394 aa		33.75	■■■□□ 2.99
BRF1-221	ENST00000619151	HAUS7	Q99871	368 aa		33.75	■■■□□ 2.99
BRF1-221	ENST00000619151	SPON1	Q9HCB6	807 aa		33.75	■■■□□ 2.99
BRF1-221	ENST00000619151	PDE8B	O95263	885 aa		33.74	■■■□□ 2.99
BRF1-221	ENST00000619151	ST5	P78524	1137 aa		33.74	■■■□□ 2.99
BRF1-221	ENST00000619151	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		33.74	■■■□□ 2.99
BRF1-221	ENST00000619151	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	33.74	■■■□□ 2.99
BRF1-221	ENST00000619151	USP26	Q9BXU7	913 aa		33.74	■■■□□ 2.99
BRF1-221	ENST00000619151	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	33.74	■■■□□ 2.99
BRF1-221	ENST00000619151	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		33.73	■■■□□ 2.99
BRF1-221	ENST00000619151	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		33.73	■■■□□ 2.99
BRF1-221	ENST00000619151	XAGE2	Q96GT9	111 aa		33.73	■■■□□ 2.99
BRF1-221	ENST00000619151	BECN1	Q14457	450 aa		33.72	■■■□□ 2.99
BRF1-221	ENST00000619151	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	33.72	■■■□□ 2.99
BRF1-221	ENST00000619151	FSD1	Q9BTV5	496 aa		33.72	■■■□□ 2.99
BRF1-221	ENST00000619151	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		33.71	■■■□□ 2.99
BRF1-221	ENST00000619151	TICAM2	Q86XR7	235 aa		33.71	■■■□□ 2.99
BRF1-221	ENST00000619151	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		33.71	■■■□□ 2.99
BRF1-221	ENST00000619151	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		33.7	■■■□□ 2.99
BRF1-221	ENST00000619151	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	33.69	■■■□□ 2.98
BRF1-221	ENST00000619151	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		33.69	■■■□□ 2.98
BRF1-221	ENST00000619151	LPIN2	Q92539	896 aa		33.69	■■■□□ 2.98
BRF1-221	ENST00000619151	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	33.69	■■■□□ 2.98
BRF1-221	ENST00000619151	SPEF2	Q9C093	1822 aa		33.69	■■■□□ 2.98
BRF1-221	ENST00000619151	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	33.69	■■■□□ 2.98
BRF1-221	ENST00000619151	SGSM2	O43147	1006 aa		33.69	■■■□□ 2.98
BRF1-221	ENST00000619151	SLC5A1	P13866	664 aa		33.68	■■■□□ 2.98
BRF1-221	ENST00000619151	MCC	P23508	829 aa		33.68	■■■□□ 2.98
BRF1-221	ENST00000619151	RAD50	Q92878	1312 aa		33.67	■■■□□ 2.98
BRF1-221	ENST00000619151	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		33.67	■■■□□ 2.98
BRF1-221	ENST00000619151	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		33.66	■■■□□ 2.98
BRF1-221	ENST00000619151	ADORA1	P30542	326 aa		33.66	■■■□□ 2.98
BRF1-221	ENST00000619151	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	33.66	■■■□□ 2.98
BRF1-221	ENST00000619151	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		33.66	■■■□□ 2.98
BRF1-221	ENST00000619151	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	33.65	■■■□□ 2.98
BRF1-221	ENST00000619151	FGFR2	P21802	821 aa		33.64	■■■□□ 2.98
BRF1-221	ENST00000619151	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		33.64	■■■□□ 2.98
BRF1-221	ENST00000619151	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	33.64	■■■□□ 2.98
BRF1-221	ENST00000619151	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	33.64	■■■□□ 2.98
BRF1-221	ENST00000619151	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		33.64	■■■□□ 2.98
BRF1-221	ENST00000619151	PDE6B	P35913	854 aa		33.63	■■■□□ 2.97
BRF1-221	ENST00000619151	CRY2	Q49AN0	593 aa		33.63	■■■□□ 2.97
BRF1-221	ENST00000619151	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		33.63	■■■□□ 2.97
BRF1-221	ENST00000619151	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		33.62	■■■□□ 2.97
BRF1-221	ENST00000619151	CHRND	Q07001	517 aa		33.62	■■■□□ 2.97
BRF1-221	ENST00000619151	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	33.62	■■■□□ 2.97
BRF1-221	ENST00000619151	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		33.61	■■■□□ 2.97
BRF1-221	ENST00000619151	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	33.61	■■■□□ 2.97
BRF1-221	ENST00000619151	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	33.61	■■■□□ 2.97
BRF1-221	ENST00000619151	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	33.6	■■■□□ 2.97
BRF1-221	ENST00000619151	GOLIM4	O00461	696 aa		33.59	■■■□□ 2.97
BRF1-221	ENST00000619151	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	33.59	■■■□□ 2.97
BRF1-221	ENST00000619151	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		33.59	■■■□□ 2.97
BRF1-221	ENST00000619151	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	33.58	■■■□□ 2.97
BRF1-221	ENST00000619151	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	33.58	■■■□□ 2.97

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