RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607296.1

AC008897.3-201, humanhuman

BASIC

Gene AC008897.3, Length 483 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC008897.3-201ENST00000607296 CCDC158Q5M9N0 1113 aa14.68□□□□□ -0.06
AC008897.3-201ENST00000607296 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
AC008897.3-201ENST00000607296 SYNE4Q8N205 404 aa14.68□□□□□ -0.06
AC008897.3-201ENST00000607296 KBTBD3Q8NAB2 608 aa14.68□□□□□ -0.06
AC008897.3-201ENST00000607296 FSD1Q9BTV5 496 aa14.68□□□□□ -0.06
AC008897.3-201ENST00000607296 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
AC008897.3-201ENST00000607296 IL25Q9H293 177 aa14.67□□□□□ -0.06
AC008897.3-201ENST00000607296 BCL2L12Q9HB09 334 aa14.67□□□□□ -0.06
AC008897.3-201ENST00000607296 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.67□□□□□ -0.06
AC008897.3-201ENST00000607296 CCDC171Q6TFL3 1326 aa14.66□□□□□ -0.06
AC008897.3-201ENST00000607296 GNPATO15228 680 aa14.66□□□□□ -0.06
AC008897.3-201ENST00000607296 ZPR1O75312 459 aa14.66□□□□□ -0.06
AC008897.3-201ENST00000607296 PDE8BO95263 885 aa14.66□□□□□ -0.06
AC008897.3-201ENST00000607296 DDIT3P35638 169 aa14.66□□□□□ -0.06
AC008897.3-201ENST00000607296 TIMM10P62072 90 aa14.66□□□□□ -0.06
AC008897.3-201ENST00000607296 ATP2B3Q16720 1220 aa14.66□□□□□ -0.06
AC008897.3-201ENST00000607296 METTL24Q5JXM2 366 aa14.66□□□□□ -0.06
AC008897.3-201ENST00000607296 NEUROD6Q96NK8 337 aa14.66□□□□□ -0.06
AC008897.3-201ENST00000607296 CNNM1Q9NRU3 951 aa14.66□□□□□ -0.06
AC008897.3-201ENST00000607296 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
AC008897.3-201ENST00000607296 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
AC008897.3-201ENST00000607296 MAP4K1Q92918 833 aa14.65□□□□□ -0.06
AC008897.3-201ENST00000607296 XAGE2Q96GT9 111 aa14.65□□□□□ -0.06
AC008897.3-201ENST00000607296 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
AC008897.3-201ENST00000607296 PAG1Q9NWQ8 432 aa14.65□□□□□ -0.06
AC008897.3-201ENST00000607296 CHMP5Q9NZZ3 219 aa14.65□□□□□ -0.06
AC008897.3-201ENST00000607296 DOCK2Q92608 1830 aa14.64□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 FGFR2P21802 821 aa14.64□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 TRAPPC3LQ5T215 181 aa14.64□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 FAM182BQ5T319 152 aa14.64□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 LPIN2Q92539 896 aa14.64□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 SETDB2Q96T68 719 aa14.64□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 TM6SF1Q9BZW5 370 aa14.64□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 HELLSQ9NRZ9 838 aa14.64□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 ZBTB22O15209 634 aa14.63□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa14.63□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 TSGA10IPQ3SY00 556 aa14.63□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 TTC39AQ5SRH9 613 aa14.63□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 USPL1Q5W0Q7 1092 aa14.63□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 TBC1D9BQ66K14 1250 aa14.63□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 HMG20BQ9P0W2 317 aa14.63□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 CARMIL3Q8ND23 1372 aa14.62□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 A0A0D9SFI3 127 aa14.62□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 SSFA2P28290 1259 aa14.62□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 NECTIN1Q15223 517 aa14.62□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa14.62□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 GORABQ5T7V8 394 aa14.62□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 RNF20Q5VTR2 975 aa14.62□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 TPTE2Q6XPS3 522 aa14.62□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 FAM227BQ96M60 508 aa14.62□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 MPHOSPH8Q99549 860 aa14.62□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 PALD1Q9ULE6 856 aa14.62□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 PLSCR1O15162 318 aa14.61□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 SLC5A1P13866 664 aa14.61□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 RFC4P35249 363 aa14.61□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 KCNQ4P56696 695 aa14.61□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 ERFEQ4G0M1 354 aa14.61□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa14.61□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 LRRC4BQ9NT99 713 aa14.61□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 SNX14Q9Y5W7 946 aa14.61□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 GOLIM4O00461 696 aa14.6□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 TAF5LO75529 589 aa14.6□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 ADORA1P30542 326 aa14.6□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 NEK4P51957 841 aa14.6□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 PTH1RQ03431 593 aa14.59□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa14.59□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa14.59□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 DSCC1Q9BVC3 393 aa14.59□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
AC008897.3-201ENST00000607296 PSMA5P28066 241 aa14.58□□□□□ -0.08
AC008897.3-201ENST00000607296 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
AC008897.3-201ENST00000607296 CUL4AQ13619 759 aa14.58□□□□□ -0.08
AC008897.3-201ENST00000607296 KRT32Q14532 448 aa14.58□□□□□ -0.08
AC008897.3-201ENST00000607296 TTC14Q96N46 770 aa14.58□□□□□ -0.08
AC008897.3-201ENST00000607296 NLRP3Q96P20 1036 aa14.58□□□□□ -0.08
AC008897.3-201ENST00000607296 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
AC008897.3-201ENST00000607296 SEC31BQ9NQW1 1179 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms