RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 HIP1O00291 1037 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-207ENST00000589146 MSH5O43196 834 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-207ENST00000589146 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-207ENST00000589146 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-207ENST00000589146 PDE8BO95263 885 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-207ENST00000589146 TM4SF1P30408 202 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-207ENST00000589146 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-207ENST00000589146 C3orf67Q6ZVT6 689 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP2B3Q16720 1220 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-207ENST00000589146 XAGE2Q96GT9 111 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-207ENST00000589146 NLRP3Q96P20 1036 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-207ENST00000589146 MPHOSPH8Q99549 860 aa27.66■■■□□ 2.02
CAPNS1-207ENST00000589146 SPEF2Q9C093 1822 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-207ENST00000589146 SGSM2O43147 1006 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-207ENST00000589146 FGFR2P21802 821 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF827Q17R98 1081 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-207ENST00000589146 FLAD1Q8NFF5 587 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-207ENST00000589146 RUFY2Q8WXA3 655 aa27.65■■■□□ 2.02
CAPNS1-207ENST00000589146 ARAP2Q8WZ64 1704 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-207ENST00000589146 KIF2CQ99661 725 aa27.64■■■□□ 2.02
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC158Q5M9N0 1113 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-207ENST00000589146 SNRKQ9NRH2 765 aa27.63■■■□□ 2.01
CAPNS1-207ENST00000589146 ADORA1P30542 326 aa27.62■■■□□ 2.01
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CAPNS1-207ENST00000589146 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa27.62■■■□□ 2.01
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-207ENST00000589146 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-207ENST00000589146 RAD50Q92878 1312 aa27.61■■■□□ 2.01
CAPNS1-207ENST00000589146 COL4A1P02462 1669 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-207ENST00000589146 IL17RAQ96F46 866 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-207ENST00000589146 FSD1Q9BTV5 496 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-207ENST00000589146 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa27.6■■■□□ 2.01
CAPNS1-207ENST00000589146 EP400Q96L91 3159 aa27.59■■■□□ 2.01
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CAPNS1-207ENST00000589146 BECN1Q14457 450 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-207ENST00000589146 CNBD1Q8NA66 436 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-207ENST00000589146 IL25Q9H293 177 aa27.59■■■□□ 2.01
CAPNS1-207ENST00000589146 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
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CAPNS1-207ENST00000589146 GORABQ5T7V8 394 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-207ENST00000589146 PRR5LQ6MZQ0 368 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-207ENST00000589146 KBTBD3Q8NAB2 608 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-207ENST00000589146 CAMKK2Q96RR4 588 aa27.58■■■□□ 2.01
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1B0GUL6 1792 aa27.58■■■□□ 2
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC5A1P13866 664 aa27.57■■■□□ 2
CAPNS1-207ENST00000589146 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP27.57■■■□□ 2
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CAPNS1-207ENST00000589146 PAG1Q9NWQ8 432 aa27.57■■■□□ 2
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CAPNS1-207ENST00000589146 CHRNDQ07001 517 aa27.56■■■□□ 2
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CAPNS1-207ENST00000589146 MCCP23508 829 aa27.54■■■□□ 2
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CAPNS1-207ENST00000589146 DDR1Q08345 913 aa27.54■■■□□ 2
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CAPNS1-207ENST00000589146 NRXN2Q9P2S2 1712 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-207ENST00000589146 ST5P78524 1137 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-207ENST00000589146 RABEP1Q15276 862 aa27.53■■■□□ 2
CAPNS1-207ENST00000589146 MED23Q9ULK4 1368 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-207ENST00000589146 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-207ENST00000589146 AKAP11Q9UKA4 1901 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-207ENST00000589146 GOLIM4O00461 696 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-207ENST00000589146 CRY2Q49AN0 593 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-207ENST00000589146 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-207ENST00000589146 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM227BQ96M60 508 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-207ENST00000589146 TBC1D2Q9BYX2 928 aa27.52■■■□□ 2
CAPNS1-207ENST00000589146 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
CAPNS1-207ENST00000589146 MINPP1Q9UNW1 487 aa27.52■■■□□ 2
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CAPNS1-207ENST00000589146 TAF5LO75529 589 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-207ENST00000589146 UBE4AQ14139 1066 aa27.51■■□□□ 1.99
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC102BQ68D86 513 aa27.51■■□□□ 1.99
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CAPNS1-207ENST00000589146 IL27Q8NEV9 243 aa27.5■■□□□ 1.99
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A0D9SFI3 127 aa27.49■■□□□ 1.99
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CAPNS1-207ENST00000589146 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
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CAPNS1-207ENST00000589146 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
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