RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572043.5

CTDNEP1-207, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 857 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-207ENST00000572043 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 G3V3G9 751 aa22.56■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 ECE2O60344 883 aa22.56■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 TNIP1Q15025 636 aa22.56■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.56■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.56■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 RTL9Q8NET4 1388 aa22.55■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.55■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.55■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 GPRC5DQ9NZD1 345 aa22.55■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.55■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 XDHP47989 1333 aa22.55■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 GRM8O00222 908 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 CSF1RP07333 972 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 LTBP1Q14766 1721 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 SCN4AP35499 1836 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 PSMD14O00487 310 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 ATP2B4P23634 1241 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 FOXO4P98177 505 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 SHTN1A0MZ66 631 aa22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 ALDH1L1O75891 902 aa22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 CNTROBQ8N137 903 aa22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1-207ENST00000572043 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.51■■□□□ 1.19
CTDNEP1-207ENST00000572043 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.51■■□□□ 1.19
CTDNEP1-207ENST00000572043 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
CTDNEP1-207ENST00000572043 KLRG1Q96E93 195 aa22.51■■□□□ 1.19
CTDNEP1-207ENST00000572043 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
CTDNEP1-207ENST00000572043 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
CTDNEP1-207ENST00000572043 PTPRCP08575 1304 aa22.5■■□□□ 1.19
CTDNEP1-207ENST00000572043 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1-207ENST00000572043 MICALL2Q8IY33 904 aa22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1-207ENST00000572043 SUCLG2Q96I99 432 aa22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1-207ENST00000572043 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1-207ENST00000572043 PASKQ96RG2 1323 aa22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1-207ENST00000572043 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1-207ENST00000572043 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1-207ENST00000572043 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1-207ENST00000572043 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1-207ENST00000572043 CREBZFQ9NS37 354 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1-207ENST00000572043 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1-207ENST00000572043 H7C1D1 291 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1-207ENST00000572043 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1-207ENST00000572043 CHRNDQ07001 517 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1-207ENST00000572043 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1-207ENST00000572043 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1-207ENST00000572043 KLRK1P26718 216 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 KCNJ4P48050 445 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 SNAP23O00161 211 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 TRAF5O00463 557 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 CACNA1FO60840 1977 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 TAF5LO75529 589 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 FBXW7Q969H0 707 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 KAZALD1Q96I82 304 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 MED23Q9ULK4 1368 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 PLIN1O60240 522 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 DPF2Q92785 391 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 EGFRP00533 1210 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 SPEF2Q9C093 1822 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 MYH3P11055 1940 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 UTYO14607 1347 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 PODNQ7Z5L7 613 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 USP17L3A6NCW0 530 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 USP17L4A6NCW7 530 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 MXD3Q9BW11 206 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1-207ENST00000572043 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
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