RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566059.5

SPNS1-208, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 1,615 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-208ENST00000566059 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS1-208ENST00000566059 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.4■■□□□ 1.18
SPNS1-208ENST00000566059 CHD4Q14839 1912 aa22.39■■□□□ 1.18
SPNS1-208ENST00000566059 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.39■■□□□ 1.18
SPNS1-208ENST00000566059 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.39■■□□□ 1.18
SPNS1-208ENST00000566059 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.39■■□□□ 1.18
SPNS1-208ENST00000566059 SBF1O95248 1867 aa22.39■■□□□ 1.18
SPNS1-208ENST00000566059 MTX1Q13505 466 aa22.39■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.39■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 POLLQ9UGP5 575 aa22.39■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 SPEF2Q9C093 1822 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.38■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 XDHP47989 1333 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.37■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 LTBP1Q14766 1721 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 SRGAP3O43295 1099 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 CHRNDQ07001 517 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.36■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 C6orf229H3BNL8 230 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 LRRC24Q50LG9 513 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 GGA1Q9UJY5 639 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 UFL1O94874 794 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 YY1P25490 414 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 AOC3Q16853 763 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 VPS33BQ9H267 617 aa22.35■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 PPIP5K2O43314 1243 aa22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 ATP2B4P23634 1241 aa22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 ATP8B2P98198 1209 aa22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 WASHC4Q2M389 1173 aa22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SPNS1-208ENST00000566059 COL4A5P29400 1685 aa22.33■■□□□ 1.16
SPNS1-208ENST00000566059 TAF5LO75529 589 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS1-208ENST00000566059 COPRSQ9NQ92 184 aa22.32■■□□□ 1.16
SPNS1-208ENST00000566059 EYA2O00167 538 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-208ENST00000566059 NEFLP07196 543 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-208ENST00000566059 SIL1Q9H173 461 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-208ENST00000566059 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-208ENST00000566059 SNAP23O00161 211 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-208ENST00000566059 RIMBP2O15034 1052 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-208ENST00000566059 CEP85Q6P2H3 762 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-208ENST00000566059 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-208ENST00000566059 EYA3Q99504 573 aa22.31■■□□□ 1.16
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.3■■□□□ 1.16
SPNS1-208ENST00000566059 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.3■■□□□ 1.16
SPNS1-208ENST00000566059 POLA2Q14181 598 aa22.3■■□□□ 1.16
SPNS1-208ENST00000566059 SSH3Q8TE77 659 aa22.3■■□□□ 1.16
SPNS1-208ENST00000566059 JDP2Q8WYK2 163 aa22.3■■□□□ 1.16
SPNS1-208ENST00000566059 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SPNS1-208ENST00000566059 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-208ENST00000566059 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-208ENST00000566059 FBXO3Q9UK99 471 aa22.29■■□□□ 1.16
SPNS1-208ENST00000566059 CIAO1O76071 339 aa22.28■■□□□ 1.16
SPNS1-208ENST00000566059 METTL24Q5JXM2 366 aa22.28■■□□□ 1.16
SPNS1-208ENST00000566059 CRBNQ96SW2 442 aa22.28■■□□□ 1.16
SPNS1-208ENST00000566059 FZD9O00144 591 aa22.28■■□□□ 1.16
SPNS1-208ENST00000566059 NIM1KQ8IY84 436 aa22.28■■□□□ 1.16
SPNS1-208ENST00000566059 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.28■■□□□ 1.16
SPNS1-208ENST00000566059 KLRK1P26718 216 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS1-208ENST00000566059 KCNJ4P48050 445 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS1-208ENST00000566059 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.27■■□□□ 1.16
SPNS1-208ENST00000566059 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.26■■□□□ 1.15
SPNS1-208ENST00000566059 PDE8BO95263 885 aa22.26■■□□□ 1.15
SPNS1-208ENST00000566059 DOK7Q18PE1 504 aa22.26■■□□□ 1.15
SPNS1-208ENST00000566059 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SPNS1-208ENST00000566059 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.26■■□□□ 1.15
SPNS1-208ENST00000566059 MED23Q9ULK4 1368 aa22.26■■□□□ 1.15
SPNS1-208ENST00000566059 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-208ENST00000566059 SIRT2Q8IXJ6 389 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-208ENST00000566059 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-208ENST00000566059 A0A1B0GUL6 1792 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-208ENST00000566059 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.25■■□□□ 1.15
SPNS1-208ENST00000566059 UBE4AQ14139 1066 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-208ENST00000566059 GLTPD2A6NH11 291 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-208ENST00000566059 YDJCA8MPS7 323 aa22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-208ENST00000566059 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SPNS1-208ENST00000566059 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.23■■□□□ 1.15
SPNS1-208ENST00000566059 ECE2O60344 883 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS1-208ENST00000566059 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.22■■□□□ 1.15
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SPNS1-208ENST00000566059 G3V3G9 751 aa22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-208ENST00000566059 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
SPNS1-208ENST00000566059 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
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