RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564630.5

CCNDBP1-205, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-205ENST00000564630 PDRG1Q9NUG6 133 aa24.22■■□□□ 1.47
CCNDBP1-205ENST00000564630 KCPQ6ZWJ8 1503 aa24.21■■□□□ 1.47
CCNDBP1-205ENST00000564630 STX6O43752 255 aa24.21■■□□□ 1.47
CCNDBP1-205ENST00000564630 SYT1P21579 422 aa24.21■■□□□ 1.47
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATP6V1AP38606 617 aa24.21■■□□□ 1.47
CCNDBP1-205ENST00000564630 GCKRQ14397 625 aa24.21■■□□□ 1.47
CCNDBP1-205ENST00000564630 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRIMPOLQ96LW4 560 aa24.21■■□□□ 1.47
CCNDBP1-205ENST00000564630 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
CCNDBP1-205ENST00000564630 PRDM4Q9UKN5 801 aa24.21■■□□□ 1.47
CCNDBP1-205ENST00000564630 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa24.21■■□□□ 1.47
CCNDBP1-205ENST00000564630 UBR2Q8IWV8 1755 aa24.21■■□□□ 1.47
CCNDBP1-205ENST00000564630 LARGE1O95461 756 aa24.2■■□□□ 1.47
CCNDBP1-205ENST00000564630 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.47
CCNDBP1-205ENST00000564630 ITPK1Q13572 414 aa24.2■■□□□ 1.47
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF827Q17R98 1081 aa24.2■■□□□ 1.47
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYRIPQ8NFW9 859 aa24.2■■□□□ 1.47
CCNDBP1-205ENST00000564630 SNRKQ9NRH2 765 aa24.2■■□□□ 1.47
CCNDBP1-205ENST00000564630 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 COPS6Q7L5N1 327 aa24.2■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 FAM227BQ96M60 508 aa24.2■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 SIL1Q9H173 461 aa24.2■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 NBPF14Q5TI25 921 aa24.19■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 TTC5Q8N0Z6 440 aa24.19■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 MAP4K1Q92918 833 aa24.19■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYD88Q99836 296 aa24.19■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa24.18■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 TJP1Q07157 1748 aa24.18■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 CREB3L3Q68CJ9 461 aa24.18■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 LINC00116Q8NCU8 138 aa24.18■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP24.18■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 F13A1P00488 732 aa24.17■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC83Q8IWF9 413 aa24.17■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 KLHDC4Q8TBB5 520 aa24.17■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 PIBF1Q8WXW3 757 aa24.17■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 CNPY2Q9Y2B0 182 aa24.17■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 EPHA10Q5JZY3 1008 aa24.17■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 LRP10Q7Z4F1 713 aa24.17■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 BOLA2Q9H3K6 86 aa24.17■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 C4BP0C0L5 1744 aa24.17■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 STK32BQ9NY57 414 aa24.16■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa24.16■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 GJB2P29033 226 aa24.15■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 KCNJ4P48050 445 aa24.15■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC15A2Q16348 729 aa24.15■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.15■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 FSD1Q9BTV5 496 aa24.15■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 LAMB4A4D0S4 1761 aa24.15■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.14■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 A0A0D9SFI3 127 aa24.14■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 AKT1S1Q96B36 256 aa24.14■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 SPTLC3Q9NUV7 552 aa24.14■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 USP16Q9Y5T5 823 aa24.14■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 MED23Q9ULK4 1368 aa24.14■■□□□ 1.46
CCNDBP1-205ENST00000564630 SLC27A2O14975 620 aa24.14■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 RNF214Q8ND24 703 aa24.14■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 COPRSQ9NQ92 184 aa24.14■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 ST3GAL1Q11201 340 aa24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 ME3Q16798 604 aa24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 DNAJC10Q8IXB1 793 aa24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 PSMA5P28066 241 aa24.12■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 SMIM5Q71RC9 77 aa24.12■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 COL15A1P39059 1388 aa24.12■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 UBE2HP62256 183 aa24.12■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 CCDC183Q5T5S1 534 aa24.12■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 FMNL2Q96PY5 1086 aa24.12■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 MTMR6Q9Y217 621 aa24.12■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 PTMAP06454 111 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 RNF20Q5VTR2 975 aa24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 AMIGO3Q86WK7 504 aa24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.11■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 TPCN1Q9ULQ1 816 aa24.1■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 AK7Q96M32 723 aa24.09■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP24.09■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 FIBPO43427 364 aa24.08■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 ATP5JP18859 108 aa24.08■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 TNNI3KQ59H18 835 aa24.08■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 NECAB1Q8N987 351 aa24.08■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa24.08■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 UBR3Q6ZT12 1888 aa24.08■■□□□ 1.45
CCNDBP1-205ENST00000564630 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms