RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560965.1

CHP1-208, Transcript of calcineurin like EF-hand protein 1, human

TSL 2

Gene CHP1, Length 467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHP1-208	ENST00000560965	MBIP	Q9NS73	344 aa		7.41	□□□□□ -1.22
CHP1-208	ENST00000560965	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
CHP1-208	ENST00000560965	PLSCR1	O15162	318 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CHP1-208	ENST00000560965	CAPN5	O15484	640 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.22
CHP1-208	ENST00000560965	ALDH1A1	P00352	501 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CHP1-208	ENST00000560965	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
CHP1-208	ENST00000560965	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CHP1-208	ENST00000560965	XP32	Q5T750	250 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CHP1-208	ENST00000560965	PIGB	Q92521	554 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CHP1-208	ENST00000560965	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
CHP1-208	ENST00000560965	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		7.4	□□□□□ -1.22
CHP1-208	ENST00000560965	C5	P01031	1676 aa		7.4	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	7.4	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		7.39	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	RREB1	Q92766	1687 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	PALLD	Q8WX93	1383 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	VSIG8	P0DPA2	414 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	ATG3	Q9NT62	314 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	TJP1	Q07157	1748 aa		7.38	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	STARD3NL	O95772	234 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		7.37	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF496	Q96IT1	587 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	KIF16B	Q96L93	1317 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	RNF225	M0QZC1	329 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	VAMP4	O75379	141 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	MS4A1	P11836	297 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	SIK1	P57059	783 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	SKOR1	P84550	965 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	RDH13	Q8NBN7	331 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	ZFP42	Q96MM3	310 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	STK31	Q9BXU1	1019 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		7.36	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	7.36	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	PTPRC	P08575	1304 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	GNPAT	O15228	680 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	7.35	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	KCNQ2	O43526	872 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	TRIM37	O94972	964 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	BAG6	P46379	1132 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	MMP16	P51512	607 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	WNT7B	P56706	349 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	SLC39A6	Q13433	755 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	HYPK	Q9NX55	129 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	C4B	P0C0L5	1744 aa		7.35	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	7.34	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	7.34	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		7.34	□□□□□ -1.23
CHP1-208	ENST00000560965	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965		A0A087WZG4	1122 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	KCNQ3	O43525	872 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	APBA3	O96018	575 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	FAM182B	Q5T319	152 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	7.33	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	TSPYL6	Q8N831	410 aa		7.33	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	IGHA1	P01876	353 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	AAMP	Q13685	434 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	TXNRD1	Q16881	649 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	7.32	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	WASF2	Q9Y6W5	498 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	NUP188	Q5SRE5	1749 aa		7.32	□□□□□ -1.24
CHP1-208	ENST00000560965	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		7.31	□□□□□ -1.24

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