RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa4.59□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 CCDC189A1A4V9 331 aa4.58□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 BACH1O14867 736 aa4.58□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 CAND2O75155 1236 aa4.58□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 ITGB7P26010 798 aa4.58□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 GNA15P30679 374 aa4.58□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 GJA8P48165 433 aa4.58□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 PTSQ03393 145 aa4.58□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 AAMPQ13685 434 aa4.58□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 ALKBH2Q6NS38 261 aa4.58□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 GAS2L2Q8NHY3 880 aa4.58□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 APPBP2Q92624 585 aa4.58□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 IER2Q9BTL4 223 aa4.58□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa4.58□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.58□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 NEUROD4Q9HD90 331 aa4.58□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa4.58□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 HOMER2Q9NSB8 354 aa4.58□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 SWAP70Q9UH65 585 aa4.58□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 EID1Q9Y6B2 187 aa4.58□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 KIF4AO95239 1232 aa4.57□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 VIL1P09327 827 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 BMP2P12643 396 aa4.57□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 MAP9Q49MG5 647 aa4.57□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 LRP10Q7Z4F1 713 aa4.57□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 AMOTL1Q8IY63 956 aa4.57□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 CNPY4Q8N129 248 aa4.57□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 GPRASP2Q96D09 838 aa4.57□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 IL17RAQ96F46 866 aa4.57□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 TRIM55Q9BYV6 548 aa4.57□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 FANCLQ9NW38 375 aa4.57□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 ATAD2Q6PL18 1390 aa4.56□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 KRBA1A5PL33 1030 aa4.56□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 EXOC5O00471 708 aa4.56□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 UPP2O95045 317 aa4.56□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 FSHRP23945 695 aa4.56□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 MPSTP25325 297 aa4.56□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 WEE1P30291 646 aa4.56□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 NOS2P35228 1153 aa4.56□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 SCTRP47872 440 aa4.56□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 GYS2P54840 703 aa4.56□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 GDF10P55107 478 aa4.56□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 SV2AQ7L0J3 742 aa4.56□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
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CS-232ENST00000552331 LINC00528Q8N1L1 170 aa4.56□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 CCDC155Q8N6L0 562 aa4.56□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 APBA2Q99767 749 aa4.56□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 ZFAND3Q9H8U3 227 aa4.56□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 ZNF358Q9NW07 568 aa4.56□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa4.56□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 GGT7Q9UJ14 662 aa4.56□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 AK5Q9Y6K8 562 aa4.56□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa4.56□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 CDC14CA4D256 554 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 M0R2N6 131 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 LDHAP00338 332 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 KRT18P05783 430 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 GNALP38405 381 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 EVA1CP58658 441 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 PAK2Q13177 524 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 BRD3Q15059 726 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 PPP2R5AQ15172 486 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 VPS72Q15906 364 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 ESCO1Q5FWF5 840 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 CAPN12Q6ZSI9 719 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 HOMER1Q86YM7 354 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 CCDC116Q8IYX3 515 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 VWA5B2Q8N398 1253 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 SAMD3Q8N6K7 520 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 FBF1Q8TES7 1133 aa4.55□□□□□ -1.68
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CS-232ENST00000552331 DEPDC7Q96QD5 511 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 FAM129BQ96TA1 746 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 C12orf49Q9H741 205 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 CHMP3Q9Y3E7 222 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 CCER2I3L3R5 266 aa4.54□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 STAU1O95793 577 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
CS-232ENST00000552331 ITGA6P23229 1130 aa4.54□□□□□ -1.68
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