RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551676.5

PPP1CC-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, human

TSL 2 BASIC

Gene PPP1CC, Length 1,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CC-208	ENST00000551676	HAUS7	Q99871	368 aa		31.31	■■■□□ 2.6
PPP1CC-208	ENST00000551676	REC8	O95072	547 aa		31.3	■■■□□ 2.6
PPP1CC-208	ENST00000551676	ATP2B3	Q16720	1220 aa		31.3	■■■□□ 2.6
PPP1CC-208	ENST00000551676	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	31.3	■■■□□ 2.6
PPP1CC-208	ENST00000551676	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		31.3	■■■□□ 2.6
PPP1CC-208	ENST00000551676	USP26	Q9BXU7	913 aa		31.3	■■■□□ 2.6
PPP1CC-208	ENST00000551676	XAGE2	Q96GT9	111 aa		31.3	■■■□□ 2.6
PPP1CC-208	ENST00000551676	AK9	Q5TCS8	1911 aa		31.28	■■■□□ 2.6
PPP1CC-208	ENST00000551676	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	31.28	■■■□□ 2.6
PPP1CC-208	ENST00000551676	CNBD1	Q8NA66	436 aa		31.28	■■■□□ 2.6
PPP1CC-208	ENST00000551676	FGFR2	P21802	821 aa		31.27	■■■□□ 2.6
PPP1CC-208	ENST00000551676	ADORA1	P30542	326 aa		31.27	■■■□□ 2.6
PPP1CC-208	ENST00000551676	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		31.26	■■■□□ 2.6
PPP1CC-208	ENST00000551676	SERPINB2	P05120	415 aa		31.26	■■■□□ 2.59
PPP1CC-208	ENST00000551676	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	31.26	■■■□□ 2.59
PPP1CC-208	ENST00000551676	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		31.26	■■■□□ 2.59
PPP1CC-208	ENST00000551676	CASZ1	Q86V15	1759 aa		31.25	■■■□□ 2.59
PPP1CC-208	ENST00000551676	COL4A1	P02462	1669 aa		31.25	■■■□□ 2.59
PPP1CC-208	ENST00000551676	HIP1	O00291	1037 aa		31.25	■■■□□ 2.59
PPP1CC-208	ENST00000551676	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		31.25	■■■□□ 2.59
PPP1CC-208	ENST00000551676	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	31.25	■■■□□ 2.59
PPP1CC-208	ENST00000551676	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		31.24	■■■□□ 2.59
PPP1CC-208	ENST00000551676	LPIN2	Q92539	896 aa		31.24	■■■□□ 2.59
PPP1CC-208	ENST00000551676	SGSM2	O43147	1006 aa		31.23	■■■□□ 2.59
PPP1CC-208	ENST00000551676	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	31.23	■■■□□ 2.59
PPP1CC-208	ENST00000551676	DDR1	Q08345	913 aa		31.23	■■■□□ 2.59
PPP1CC-208	ENST00000551676	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	31.23	■■■□□ 2.59
PPP1CC-208	ENST00000551676	TICAM2	Q86XR7	235 aa		31.23	■■■□□ 2.59
PPP1CC-208	ENST00000551676	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		31.23	■■■□□ 2.59
PPP1CC-208	ENST00000551676	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		31.23	■■■□□ 2.59
PPP1CC-208	ENST00000551676	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	31.22	■■■□□ 2.59
PPP1CC-208	ENST00000551676	NPHP1	O15259	732 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PPP1CC-208	ENST00000551676	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	31.22	■■■□□ 2.59
PPP1CC-208	ENST00000551676	GORAB	Q5T7V8	394 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PPP1CC-208	ENST00000551676	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	31.22	■■■□□ 2.59
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	31.22	■■■□□ 2.59
PPP1CC-208	ENST00000551676	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		31.22	■■■□□ 2.59
PPP1CC-208	ENST00000551676	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		31.21	■■■□□ 2.59
PPP1CC-208	ENST00000551676	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	31.21	■■■□□ 2.59
PPP1CC-208	ENST00000551676	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	31.21	■■■□□ 2.59
PPP1CC-208	ENST00000551676	CHRND	Q07001	517 aa		31.21	■■■□□ 2.59
PPP1CC-208	ENST00000551676	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		31.21	■■■□□ 2.59
PPP1CC-208	ENST00000551676	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	31.21	■■■□□ 2.59
PPP1CC-208	ENST00000551676	FSD1	Q9BTV5	496 aa		31.21	■■■□□ 2.59
PPP1CC-208	ENST00000551676	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	31.2	■■■□□ 2.58
PPP1CC-208	ENST00000551676	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		31.2	■■■□□ 2.58
PPP1CC-208	ENST00000551676	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	31.2	■■■□□ 2.58
PPP1CC-208	ENST00000551676	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	31.2	■■■□□ 2.58
PPP1CC-208	ENST00000551676	KIF2C	Q99661	725 aa		31.2	■■■□□ 2.58
PPP1CC-208	ENST00000551676	IL25	Q9H293	177 aa		31.2	■■■□□ 2.58
PPP1CC-208	ENST00000551676	ST5	P78524	1137 aa		31.19	■■■□□ 2.58
PPP1CC-208	ENST00000551676	SLC5A1	P13866	664 aa		31.18	■■■□□ 2.58
PPP1CC-208	ENST00000551676	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	31.18	■■■□□ 2.58
PPP1CC-208	ENST00000551676	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	31.18	■■■□□ 2.58
PPP1CC-208	ENST00000551676	SPEF2	Q9C093	1822 aa		31.18	■■■□□ 2.58
PPP1CC-208	ENST00000551676	TAF5L	O75529	589 aa		31.17	■■■□□ 2.58
PPP1CC-208	ENST00000551676	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		31.17	■■■□□ 2.58
PPP1CC-208	ENST00000551676	SNRK	Q9NRH2	765 aa		31.17	■■■□□ 2.58
PPP1CC-208	ENST00000551676	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		31.17	■■■□□ 2.58
PPP1CC-208	ENST00000551676	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		31.17	■■■□□ 2.58
PPP1CC-208	ENST00000551676	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		31.17	■■■□□ 2.58
PPP1CC-208	ENST00000551676	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		31.17	■■■□□ 2.58
PPP1CC-208	ENST00000551676	MSH5	O43196	834 aa		31.17	■■■□□ 2.58
PPP1CC-208	ENST00000551676	SLC15A2	Q16348	729 aa		31.16	■■■□□ 2.58
PPP1CC-208	ENST00000551676	CRY2	Q49AN0	593 aa		31.16	■■■□□ 2.58
PPP1CC-208	ENST00000551676	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	31.16	■■■□□ 2.58
PPP1CC-208	ENST00000551676	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		31.15	■■■□□ 2.58
PPP1CC-208	ENST00000551676	RAD50	Q92878	1312 aa		31.14	■■■□□ 2.58
PPP1CC-208	ENST00000551676	GOLIM4	O00461	696 aa		31.14	■■■□□ 2.58
PPP1CC-208	ENST00000551676	BAG6	P46379	1132 aa		31.14	■■■□□ 2.58
PPP1CC-208	ENST00000551676	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	31.14	■■■□□ 2.58
PPP1CC-208	ENST00000551676	SF3B2	Q13435	895 aa	Known RBP	31.14	■■■□□ 2.58
PPP1CC-208	ENST00000551676	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	31.13	■■■□□ 2.57
PPP1CC-208	ENST00000551676	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		31.13	■■■□□ 2.57
PPP1CC-208	ENST00000551676	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	31.13	■■■□□ 2.57
PPP1CC-208	ENST00000551676	CCDC102B	Q68D86	513 aa		31.13	■■■□□ 2.57
PPP1CC-208	ENST00000551676	STK32B	Q9NY57	414 aa		31.13	■■■□□ 2.57
PPP1CC-208	ENST00000551676	SCARF1	Q14162	830 aa		31.13	■■■□□ 2.57
PPP1CC-208	ENST00000551676	FAM227B	Q96M60	508 aa		31.13	■■■□□ 2.57
PPP1CC-208	ENST00000551676	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	31.13	■■■□□ 2.57
PPP1CC-208	ENST00000551676	TAF1	P21675	1872 aa		31.12	■■■□□ 2.57
PPP1CC-208	ENST00000551676	GRAP	Q13588	217 aa		31.12	■■■□□ 2.57
PPP1CC-208	ENST00000551676	UBE4A	Q14139	1066 aa		31.12	■■■□□ 2.57
PPP1CC-208	ENST00000551676	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	31.12	■■■□□ 2.57
PPP1CC-208	ENST00000551676	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		31.11	■■■□□ 2.57
PPP1CC-208	ENST00000551676	SNAP23	O00161	211 aa		31.11	■■■□□ 2.57
PPP1CC-208	ENST00000551676	PHKA1	P46020	1223 aa		31.11	■■■□□ 2.57
PPP1CC-208	ENST00000551676	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		31.1	■■■□□ 2.57
PPP1CC-208	ENST00000551676		A0A1B0GUL6	1792 aa		31.1	■■■□□ 2.57
PPP1CC-208	ENST00000551676		A0A0D9SFI3	127 aa		31.09	■■■□□ 2.57
PPP1CC-208	ENST00000551676	MCAM	P43121	646 aa		31.09	■■■□□ 2.57
PPP1CC-208	ENST00000551676	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		31.09	■■■□□ 2.57
PPP1CC-208	ENST00000551676	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	31.09	■■■□□ 2.57
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZAP70	P43403	619 aa		31.09	■■■□□ 2.57
PPP1CC-208	ENST00000551676	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	31.09	■■■□□ 2.57
PPP1CC-208	ENST00000551676	BECN1	Q14457	450 aa		31.09	■■■□□ 2.57
PPP1CC-208	ENST00000551676	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		31.09	■■■□□ 2.57
PPP1CC-208	ENST00000551676	IL17RA	Q96F46	866 aa		31.09	■■■□□ 2.57
PPP1CC-208	ENST00000551676	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		31.09	■■■□□ 2.57
PPP1CC-208	ENST00000551676	MED23	Q9ULK4	1368 aa		31.08	■■■□□ 2.57

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