RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527871.5

RPS2-208, Transcript of ribosomal protein S2, human

TSL 1 (best)

Gene RPS2, Length 1,243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS2-208	ENST00000527871		H7C1D1	291 aa		31.33	■■■□□ 2.61
RPS2-208	ENST00000527871	ECE2	O60344	883 aa		31.33	■■■□□ 2.61
RPS2-208	ENST00000527871	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	31.33	■■■□□ 2.61
RPS2-208	ENST00000527871	EYA3	Q99504	573 aa		31.33	■■■□□ 2.61
RPS2-208	ENST00000527871	IL16	Q14005	1332 aa		31.32	■■■□□ 2.6
RPS2-208	ENST00000527871	CAPNS2	Q96L46	248 aa		31.32	■■■□□ 2.6
RPS2-208	ENST00000527871	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	31.32	■■■□□ 2.6
RPS2-208	ENST00000527871	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	31.31	■■■□□ 2.6
RPS2-208	ENST00000527871	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		31.31	■■■□□ 2.6
RPS2-208	ENST00000527871	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		31.31	■■■□□ 2.6
RPS2-208	ENST00000527871	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	31.3	■■■□□ 2.6
RPS2-208	ENST00000527871	EGFR	P00533	1210 aa		31.3	■■■□□ 2.6
RPS2-208	ENST00000527871	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		31.3	■■■□□ 2.6
RPS2-208	ENST00000527871	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		31.3	■■■□□ 2.6
RPS2-208	ENST00000527871	AIDA	Q96BJ3	306 aa		31.3	■■■□□ 2.6
RPS2-208	ENST00000527871	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	31.3	■■■□□ 2.6
RPS2-208	ENST00000527871	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	31.29	■■■□□ 2.6
RPS2-208	ENST00000527871	SCN9A	Q15858	1988 aa		31.28	■■■□□ 2.6
RPS2-208	ENST00000527871	CAPN15	O75808	1086 aa		31.28	■■■□□ 2.6
RPS2-208	ENST00000527871	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	31.28	■■■□□ 2.6
RPS2-208	ENST00000527871	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	31.28	■■■□□ 2.6
RPS2-208	ENST00000527871	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		31.28	■■■□□ 2.6
RPS2-208	ENST00000527871	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		31.28	■■■□□ 2.6
RPS2-208	ENST00000527871	UFL1	O94874	794 aa		31.27	■■■□□ 2.6
RPS2-208	ENST00000527871	SLC4A2	P04920	1241 aa		31.27	■■■□□ 2.6
RPS2-208	ENST00000527871	LBX1	P52954	281 aa		31.27	■■■□□ 2.6
RPS2-208	ENST00000527871	CTSW	P56202	376 aa		31.27	■■■□□ 2.6
RPS2-208	ENST00000527871	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	31.27	■■■□□ 2.6
RPS2-208	ENST00000527871	DLK2	Q6UY11	383 aa		31.27	■■■□□ 2.6
RPS2-208	ENST00000527871	STK31	Q9BXU1	1019 aa		31.27	■■■□□ 2.6
RPS2-208	ENST00000527871	GGA1	Q9UJY5	639 aa		31.27	■■■□□ 2.6
RPS2-208	ENST00000527871	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		31.26	■■■□□ 2.59
RPS2-208	ENST00000527871		H7C1W4	665 aa		31.26	■■■□□ 2.59
RPS2-208	ENST00000527871	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	31.26	■■■□□ 2.59
RPS2-208	ENST00000527871	ECE1	P42892	770 aa		31.26	■■■□□ 2.59
RPS2-208	ENST00000527871	MRS2	Q9HD23	443 aa		31.26	■■■□□ 2.59
RPS2-208	ENST00000527871	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	31.25	■■■□□ 2.59
RPS2-208	ENST00000527871	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	31.25	■■■□□ 2.59
RPS2-208	ENST00000527871	USP48	Q86UV5	1035 aa		31.25	■■■□□ 2.59
RPS2-208	ENST00000527871	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		31.25	■■■□□ 2.59
RPS2-208	ENST00000527871	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		31.24	■■■□□ 2.59
RPS2-208	ENST00000527871	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		31.24	■■■□□ 2.59
RPS2-208	ENST00000527871	GREM2	Q9H772	168 aa		31.23	■■■□□ 2.59
RPS2-208	ENST00000527871	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	31.23	■■■□□ 2.59
RPS2-208	ENST00000527871	XDH	P47989	1333 aa		31.23	■■■□□ 2.59
RPS2-208	ENST00000527871	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		31.22	■■■□□ 2.59
RPS2-208	ENST00000527871	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	31.22	■■■□□ 2.59
RPS2-208	ENST00000527871	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		31.22	■■■□□ 2.59
RPS2-208	ENST00000527871	AOC2	O75106	756 aa		31.21	■■■□□ 2.59
RPS2-208	ENST00000527871	VAMP4	O75379	141 aa		31.21	■■■□□ 2.59
RPS2-208	ENST00000527871	MAP2K2	P36507	400 aa		31.21	■■■□□ 2.59
RPS2-208	ENST00000527871	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	31.21	■■■□□ 2.59
RPS2-208	ENST00000527871	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		31.21	■■■□□ 2.59
RPS2-208	ENST00000527871	ATP2B4	P23634	1241 aa		31.2	■■■□□ 2.59
RPS2-208	ENST00000527871	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	31.2	■■■□□ 2.59
RPS2-208	ENST00000527871	CASP7	P55210	303 aa		31.2	■■■□□ 2.59
RPS2-208	ENST00000527871	FLII	Q13045	1269 aa		31.2	■■■□□ 2.59
RPS2-208	ENST00000527871	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	31.2	■■■□□ 2.59
RPS2-208	ENST00000527871	WDR63	Q8IWG1	891 aa		31.2	■■■□□ 2.59
RPS2-208	ENST00000527871	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	31.2	■■■□□ 2.59
RPS2-208	ENST00000527871	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	31.19	■■■□□ 2.58
RPS2-208	ENST00000527871	GRM1	Q13255	1194 aa		31.19	■■■□□ 2.58
RPS2-208	ENST00000527871	GML	Q99445	158 aa		31.19	■■■□□ 2.58
RPS2-208	ENST00000527871	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		31.19	■■■□□ 2.58
RPS2-208	ENST00000527871	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		31.19	■■■□□ 2.58
RPS2-208	ENST00000527871	ZNF609	O15014	1411 aa		31.18	■■■□□ 2.58
RPS2-208	ENST00000527871	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	31.18	■■■□□ 2.58
RPS2-208	ENST00000527871	GCKR	Q14397	625 aa		31.18	■■■□□ 2.58
RPS2-208	ENST00000527871	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		31.18	■■■□□ 2.58
RPS2-208	ENST00000527871	ANP32C	O43423	234 aa		31.17	■■■□□ 2.58
RPS2-208	ENST00000527871	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
RPS2-208	ENST00000527871	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		31.17	■■■□□ 2.58
RPS2-208	ENST00000527871	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
RPS2-208	ENST00000527871	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
RPS2-208	ENST00000527871	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		31.16	■■■□□ 2.58
RPS2-208	ENST00000527871		G3V3G9	751 aa		31.15	■■■□□ 2.58
RPS2-208	ENST00000527871	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		31.15	■■■□□ 2.58
RPS2-208	ENST00000527871	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		31.15	■■■□□ 2.58
RPS2-208	ENST00000527871	PODN	Q7Z5L7	613 aa		31.15	■■■□□ 2.58
RPS2-208	ENST00000527871	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	31.15	■■■□□ 2.58
RPS2-208	ENST00000527871	ADM5	C9JUS6	153 aa		31.14	■■■□□ 2.58
RPS2-208	ENST00000527871	CSF1R	P07333	972 aa		31.14	■■■□□ 2.58
RPS2-208	ENST00000527871	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	31.14	■■■□□ 2.58
RPS2-208	ENST00000527871	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		31.14	■■■□□ 2.58
RPS2-208	ENST00000527871	MYH3	P11055	1940 aa		31.14	■■■□□ 2.57
RPS2-208	ENST00000527871	LINS1	Q8NG48	757 aa		31.13	■■■□□ 2.57
RPS2-208	ENST00000527871	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	31.13	■■■□□ 2.57
RPS2-208	ENST00000527871	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	31.12	■■■□□ 2.57
RPS2-208	ENST00000527871	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	31.12	■■■□□ 2.57
RPS2-208	ENST00000527871	ZIC5	Q96T25	663 aa		31.12	■■■□□ 2.57
RPS2-208	ENST00000527871	USP17L3	A6NCW0	530 aa		31.11	■■■□□ 2.57
RPS2-208	ENST00000527871	USP17L4	A6NCW7	530 aa		31.11	■■■□□ 2.57
RPS2-208	ENST00000527871	CACNA1F	O60840	1977 aa		31.11	■■■□□ 2.57
RPS2-208	ENST00000527871	PSME4	Q14997	1843 aa		31.11	■■■□□ 2.57
RPS2-208	ENST00000527871	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		31.11	■■■□□ 2.57
RPS2-208	ENST00000527871	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		31.11	■■■□□ 2.57
RPS2-208	ENST00000527871	MED23	Q9ULK4	1368 aa		31.11	■■■□□ 2.57
RPS2-208	ENST00000527871	HUNK	P57058	714 aa		31.1	■■■□□ 2.57
RPS2-208	ENST00000527871	GGA3	Q9NZ52	723 aa		31.1	■■■□□ 2.57
RPS2-208	ENST00000527871	ITGA6	P23229	1130 aa		31.09	■■■□□ 2.57

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.6 ms