RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513063.5

MXD3-208, Transcript of MAX dimerization protein 3, human

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene MXD3, Length 861 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MXD3-208	ENST00000513063	CACNA1F	O60840	1977 aa		31.28	■■■□□ 2.6
MXD3-208	ENST00000513063	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		31.27	■■■□□ 2.6
MXD3-208	ENST00000513063	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	31.27	■■■□□ 2.6
MXD3-208	ENST00000513063	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	31.27	■■■□□ 2.6
MXD3-208	ENST00000513063	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	31.27	■■■□□ 2.6
MXD3-208	ENST00000513063	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		31.27	■■■□□ 2.6
MXD3-208	ENST00000513063	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		31.27	■■■□□ 2.6
MXD3-208	ENST00000513063	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	31.27	■■■□□ 2.6
MXD3-208	ENST00000513063	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		31.27	■■■□□ 2.6
MXD3-208	ENST00000513063	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		31.26	■■■□□ 2.6
MXD3-208	ENST00000513063	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	31.26	■■■□□ 2.59
MXD3-208	ENST00000513063	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		31.26	■■■□□ 2.59
MXD3-208	ENST00000513063	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	31.25	■■■□□ 2.59
MXD3-208	ENST00000513063	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	31.25	■■■□□ 2.59
MXD3-208	ENST00000513063	GRAP	Q13588	217 aa		31.24	■■■□□ 2.59
MXD3-208	ENST00000513063	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	31.24	■■■□□ 2.59
MXD3-208	ENST00000513063	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	31.24	■■■□□ 2.59
MXD3-208	ENST00000513063	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		31.24	■■■□□ 2.59
MXD3-208	ENST00000513063	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		31.23	■■■□□ 2.59
MXD3-208	ENST00000513063	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	31.23	■■■□□ 2.59
MXD3-208	ENST00000513063		H7C1D1	291 aa		31.22	■■■□□ 2.59
MXD3-208	ENST00000513063	FAM89A	Q96GI7	184 aa		31.22	■■■□□ 2.59
MXD3-208	ENST00000513063	TAF1	P21675	1872 aa		31.22	■■■□□ 2.59
MXD3-208	ENST00000513063	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		31.21	■■■□□ 2.59
MXD3-208	ENST00000513063	SHTN1	A0MZ66	631 aa		31.21	■■■□□ 2.59
MXD3-208	ENST00000513063	YDJC	A8MPS7	323 aa		31.21	■■■□□ 2.59
MXD3-208	ENST00000513063	NOG	Q13253	232 aa		31.21	■■■□□ 2.59
MXD3-208	ENST00000513063	MICALL2	Q8IY33	904 aa		31.21	■■■□□ 2.59
MXD3-208	ENST00000513063	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		31.21	■■■□□ 2.59
MXD3-208	ENST00000513063	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		31.2	■■■□□ 2.59
MXD3-208	ENST00000513063	DGKZ	Q13574	1117 aa		31.2	■■■□□ 2.59
MXD3-208	ENST00000513063	HUNK	P57058	714 aa		31.19	■■■□□ 2.58
MXD3-208	ENST00000513063	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	31.19	■■■□□ 2.58
MXD3-208	ENST00000513063	TMC4	Q7Z404	712 aa		31.19	■■■□□ 2.58
MXD3-208	ENST00000513063	USP48	Q86UV5	1035 aa		31.19	■■■□□ 2.58
MXD3-208	ENST00000513063	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	31.19	■■■□□ 2.58
MXD3-208	ENST00000513063	IGKV5-2	P06315	115 aa		31.17	■■■□□ 2.58
MXD3-208	ENST00000513063	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
MXD3-208	ENST00000513063	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		31.17	■■■□□ 2.58
MXD3-208	ENST00000513063	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
MXD3-208	ENST00000513063	ZIC5	Q96T25	663 aa		31.16	■■■□□ 2.58
MXD3-208	ENST00000513063	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	31.15	■■■□□ 2.58
MXD3-208	ENST00000513063	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		31.15	■■■□□ 2.58
MXD3-208	ENST00000513063	DPF2	Q92785	391 aa		31.15	■■■□□ 2.58
MXD3-208	ENST00000513063	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	31.14	■■■□□ 2.58
MXD3-208	ENST00000513063	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	31.14	■■■□□ 2.58
MXD3-208	ENST00000513063	WASHC4	Q2M389	1173 aa		31.14	■■■□□ 2.58
MXD3-208	ENST00000513063	PSMD14	O00487	310 aa		31.13	■■■□□ 2.57
MXD3-208	ENST00000513063	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	31.13	■■■□□ 2.57
MXD3-208	ENST00000513063	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	31.13	■■■□□ 2.57
MXD3-208	ENST00000513063	DLK2	Q6UY11	383 aa		31.13	■■■□□ 2.57
MXD3-208	ENST00000513063	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	31.13	■■■□□ 2.57
MXD3-208	ENST00000513063	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		31.13	■■■□□ 2.57
MXD3-208	ENST00000513063	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		31.13	■■■□□ 2.57
MXD3-208	ENST00000513063	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		31.12	■■■□□ 2.57
MXD3-208	ENST00000513063		F6X3S4	739 aa		31.12	■■■□□ 2.57
MXD3-208	ENST00000513063	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		31.12	■■■□□ 2.57
MXD3-208	ENST00000513063	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	31.12	■■■□□ 2.57
MXD3-208	ENST00000513063	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	31.12	■■■□□ 2.57
MXD3-208	ENST00000513063	RGMB	Q6NW40	437 aa		31.11	■■■□□ 2.57
MXD3-208	ENST00000513063	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	31.1	■■■□□ 2.57
MXD3-208	ENST00000513063	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		31.1	■■■□□ 2.57
MXD3-208	ENST00000513063	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	31.1	■■■□□ 2.57
MXD3-208	ENST00000513063	C6orf229	H3BNL8	230 aa		31.09	■■■□□ 2.57
MXD3-208	ENST00000513063	RIMBP2	O15034	1052 aa		31.09	■■■□□ 2.57
MXD3-208	ENST00000513063	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	31.09	■■■□□ 2.57
MXD3-208	ENST00000513063	LINS1	Q8NG48	757 aa		31.09	■■■□□ 2.57
MXD3-208	ENST00000513063	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	31.09	■■■□□ 2.57
MXD3-208	ENST00000513063	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	31.09	■■■□□ 2.57
MXD3-208	ENST00000513063	EGFR	P00533	1210 aa		31.08	■■■□□ 2.57
MXD3-208	ENST00000513063	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	31.08	■■■□□ 2.57
MXD3-208	ENST00000513063	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		31.08	■■■□□ 2.57
MXD3-208	ENST00000513063	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	31.07	■■■□□ 2.56
MXD3-208	ENST00000513063	ADM5	C9JUS6	153 aa		31.07	■■■□□ 2.56
MXD3-208	ENST00000513063	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	31.07	■■■□□ 2.56
MXD3-208	ENST00000513063	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	31.07	■■■□□ 2.56
MXD3-208	ENST00000513063	ECE2	O60344	883 aa		31.06	■■■□□ 2.56
MXD3-208	ENST00000513063	GCKR	Q14397	625 aa		31.06	■■■□□ 2.56
MXD3-208	ENST00000513063	CCDC102A	Q96A19	550 aa		31.06	■■■□□ 2.56
MXD3-208	ENST00000513063	EYA3	Q99504	573 aa		31.06	■■■□□ 2.56
MXD3-208	ENST00000513063	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		31.06	■■■□□ 2.56
MXD3-208	ENST00000513063	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		31.06	■■■□□ 2.56
MXD3-208	ENST00000513063	POLL	Q9UGP5	575 aa		31.06	■■■□□ 2.56
MXD3-208	ENST00000513063	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	31.06	■■■□□ 2.56
MXD3-208	ENST00000513063	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		31.05	■■■□□ 2.56
MXD3-208	ENST00000513063	GPSM2	P81274	684 aa		31.05	■■■□□ 2.56
MXD3-208	ENST00000513063	BEND3	Q5T5X7	828 aa		31.05	■■■□□ 2.56
MXD3-208	ENST00000513063	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	31.05	■■■□□ 2.56
MXD3-208	ENST00000513063	COL4A1	P02462	1669 aa		31.04	■■■□□ 2.56
MXD3-208	ENST00000513063	PDE8A	O60658	829 aa		31.04	■■■□□ 2.56
MXD3-208	ENST00000513063	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	31.04	■■■□□ 2.56
MXD3-208	ENST00000513063	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	31.04	■■■□□ 2.56
MXD3-208	ENST00000513063	DOK7	Q18PE1	504 aa		31.04	■■■□□ 2.56
MXD3-208	ENST00000513063	RTL9	Q8NET4	1388 aa		31.04	■■■□□ 2.56
MXD3-208	ENST00000513063		H7C1W4	665 aa		31.03	■■■□□ 2.56
MXD3-208	ENST00000513063	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		31.03	■■■□□ 2.56
MXD3-208	ENST00000513063	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		31.03	■■■□□ 2.56
MXD3-208	ENST00000513063	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		31.03	■■■□□ 2.56
MXD3-208	ENST00000513063	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		31.03	■■■□□ 2.56
MXD3-208	ENST00000513063	PTPRC	P08575	1304 aa		31.02	■■■□□ 2.56

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