RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508936.1

SMAD1-AS2-201, SMAD1 antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD1-AS2, Length 1,090 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 UCN2Q96RP3 112 aa8.85□□□□□ -0.99
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C11orf91Q3C1V1 193 aa8.84□□□□□ -0.99
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MYRFLQ96LU7 910 aa8.84□□□□□ -0.99
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TRIM33Q9UPN9 1127 aa8.84□□□□□ -0.99
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RAD21O60216 631 aa8.83□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MMP20O60882 483 aa8.83□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa8.83□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CLEC10AQ8IUN9 316 aa8.83□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GALNT11Q8NCW6 608 aa8.83□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa8.83□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 WISP1O95388 367 aa8.82□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAM83CQ9BQN1 747 aa8.82□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LINC01387J3KSC0 135 aa8.81□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 OPLAHO14841 1288 aa8.81□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 OGFOD2Q6N063 350 aa8.81□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RGL4Q8IZJ4 473 aa8.81□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SHKBP1Q8TBC3 707 aa8.81□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 VTI1AQ96AJ9 217 aa8.81□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 POM121CA8CG34 1229 aa8.8□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAM20CQ8IXL6 584 aa8.8□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 USP20Q9Y2K6 914 aa8.8□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SART1O43290 800 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DUOXA2Q1HG44 320 aa8.79□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ABI1Q8IZP0 508 aa8.79□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MYO19Q96H55 970 aa8.79□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KCNF1Q9H3M0 494 aa8.79□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP8.79□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LGR5O75473 907 aa8.78□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAM117BQ6P1L5 589 aa8.78□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KLHL23Q8NBE8 558 aa8.78□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 GIMAP7Q8NHV1 300 aa8.78□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ASIC4Q96FT7 647 aa8.78□□□□□ -1
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FOXO3O43524 673 aa8.77□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa8.77□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BEND4Q6ZU67 534 aa8.77□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 POM121Q96HA1 1249 aa8.77□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KCNK4Q9NYG8 393 aa8.77□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP8.76□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 C8AP07357 584 aa8.76□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 BMP3P12645 472 aa8.76□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CDC27P30260 824 aa8.76□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DPYDQ12882 1025 aa8.76□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TXNDC11Q6PKC3 985 aa8.76□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TREML1Q86YW5 311 aa8.76□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 POU5F2Q8N7G0 328 aa8.76□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SPACA7Q96KW9 195 aa8.76□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PIM2Q9P1W9 311 aa8.76□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 WDR64B1ANS9 1081 aa8.75□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CEP135Q66GS9 1140 aa8.75□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 NLRP13Q86W25 1043 aa8.75□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LACRTQ9GZZ8 138 aa8.75□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HIF3AQ9Y2N7 669 aa8.75□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.75□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FSCN2O14926 492 aa8.74□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ANKRD34AQ69YU3 496 aa8.74□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CARD10Q9BWT7 1032 aa8.74□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAM177BA6PVY3 158 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CDC25BP30305 580 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PTK7Q13308 1070 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ATG3Q9NT62 314 aa8.73□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 HYAL2Q12891 473 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FBXL18Q96ME1 805 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LEMD3Q9Y2U8 911 aa8.72□□□□□ -1.01
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TM4SF5O14894 197 aa8.71□□□□□ -1.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 WEE1P30291 646 aa8.71□□□□□ -1.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ATP11AP98196 1134 aa8.71□□□□□ -1.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 ANKMY2Q8IV38 441 aa8.71□□□□□ -1.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 OR13H1Q8NG92 308 aa8.71□□□□□ -1.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MFSD14AQ96MC6 490 aa8.71□□□□□ -1.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa8.71□□□□□ -1.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CBLL1Q75N03 491 aa8.7□□□□□ -1.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 RNF208Q9H0X6 261 aa8.7□□□□□ -1.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 SEC31BQ9NQW1 1179 aa8.7□□□□□ -1.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CCDC39Q9UFE4 941 aa8.7□□□□□ -1.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 LRFN2Q9ULH4 789 aa8.7□□□□□ -1.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 PREPP48147 710 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP8.69□□□□□ -1.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 TP53INP2Q8IXH6 220 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 UBASH3BQ8TF42 649 aa8.69□□□□□ -1.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FOSL1P15407 271 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FDX2Q6P4F2 183 aa8.68□□□□□ -1.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 FAM196BA6NMK8 535 aa8.67□□□□□ -1.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 USP17L15C9J2P7 530 aa8.67□□□□□ -1.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 USP17L10C9JJH3 530 aa8.67□□□□□ -1.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.67□□□□□ -1.02
SMAD1-AS2-201ENST00000508936 USP17L12C9JPN9 530 aa8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms