RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495879.1

PTPRG-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRG, Length 3,011 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-207ENST00000495879 PTPN14Q15678 1187 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 PXDNQ92626 1479 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 COPS6Q7L5N1 327 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 ST7Q9NRC1 585 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 OGFRQ9NZT2 677 aa21.93■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 CACNA1FO60840 1977 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 PTPDC1A2A3K4 754 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 BIN1O00499 593 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 ELF2Q15723 593 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 ISM2Q6H9L7 571 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 FSIP1Q8NA03 581 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 CTDNEP1O95476 244 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 PSME1Q06323 249 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 ESCO1Q5FWF5 840 aa21.92■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 PDIA6Q15084 440 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 CFAP45Q9UL16 551 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 A0A1B0GVL5 298 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 KMT5BQ4FZB7 885 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 HMG20BQ9P0W2 317 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 TBX22Q9Y458 520 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 UBR1Q8IWV7 1749 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 ZNF609O15014 1411 aa21.91■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 STX1AQ16623 288 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 PTPN21Q16825 1174 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 KINO60870 393 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 TNNI3KQ59H18 835 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 NEURL1BA8MQ27 555 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 LRRN4CLQ8ND94 238 aa21.9■■□□□ 1.1
PTPRG-207ENST00000495879 CCZ1BP86790 482 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 GCKRQ14397 625 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 FEZ1Q99689 392 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 SNRKQ9NRH2 765 aa21.89■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 KIF18AQ8NI77 898 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 SDF4Q9BRK5 362 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 GOLIM4O00461 696 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.88■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 KRT32Q14532 448 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 SMC2O95347 1197 aa21.87■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 GORABQ5T7V8 394 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 AXIN2Q9Y2T1 843 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 TIMM10P62072 90 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 TSGA10IPQ3SY00 556 aa21.86■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 ANKRD24Q8TF21 1146 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 RCOR1Q9UKL0 485 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 KIF20AO95235 890 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 ATP5JP18859 108 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 DPCR1Q3MIW9 517 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 NYAP1Q6ZVC0 841 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.85■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 HAND2P61296 217 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 PCDHA7Q9UN72 937 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 ERICH4A6NGS2 130 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 TMC6Q7Z403 805 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa21.84■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 PFKFB2O60825 505 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 NDUFA8P51970 172 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 SARM1Q6SZW1 724 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 NBPF11Q86T75 865 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 ENGASEQ8NFI3 743 aa21.83■■□□□ 1.09
PTPRG-207ENST00000495879 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
PTPRG-207ENST00000495879 CDC25BP30305 580 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRG-207ENST00000495879 FAM160A1Q05DH4 1040 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRG-207ENST00000495879 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
PTPRG-207ENST00000495879 CEP57L1Q8IYX8 460 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRG-207ENST00000495879 ANO10Q9NW15 660 aa21.83■■□□□ 1.08
PTPRG-207ENST00000495879 IFNKQ9P0W0 207 aa21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms