RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490444.2

PUM3-204, Transcript of pumilio RNA binding family member 3, human

TSL 5

Gene PUM3, Length 340 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM3-204	ENST00000490444	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	PSME1	Q06323	249 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	WWC1	Q8IX03	1113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	PLD4	Q96BZ4	506 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	PIK3CD	O00329	1044 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	BMP3	P12645	472 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	GTF2I	P78347	998 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	SLC38A3	Q99624	504 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	ALG2	Q9H553	416 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	JAG2	Q9Y219	1238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	IFT43	Q96FT9	208 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PUM3-204	ENST00000490444	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	RARA	P10276	462 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	PPME1	Q9Y570	386 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	F13B	P05160	661 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	NCOA4	Q13772	614 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	TRIM50	Q86XT4	487 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	FLCN	Q8NFG4	579 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	TOX2	Q96NM4	488 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	USP17L5	A8MUK1	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	TM4SF5	O14894	197 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	GHRH	P01286	108 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	SIK1	P57059	783 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	UCN2	Q96RP3	112 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	RBSN	Q9H1K0	784 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	KCNK4	Q9NYG8	393 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	ARID3C	A6NKF2	412 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	INPP5B	P32019	993 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	GLMN	Q92990	594 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	FAM84A	Q96KN4	292 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444		M0R2N6	131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	SASH3	O75995	380 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	PREP	P48147	710 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	ATP1A2	P50993	1020 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	RTN1	Q16799	776 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	LINC01387	J3KSC0	135 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444		J3QW42	95 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	CYP26A1	O43174	497 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	CFP	P27918	469 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	MESP2	Q0VG99	397 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	CCDC102B	Q68D86	513 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	C1QL4	Q86Z23	238 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	FBXL6	Q8N531	539 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	FAM168A	Q92567	244 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	COL26A1	Q96A83	441 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	BCS1L	Q9Y276	419 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	SOX18	P35713	384 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PUM3-204	ENST00000490444	USP17L3	A6NCW0	530 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUM3-204	ENST00000490444	USP17L4	A6NCW7	530 aa		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms