RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 SLURP2P0DP57 97 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 PLAURQ03405 335 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 HFE2Q6ZVN8 426 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 ACDQ96AP0 544 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 BCL2L13Q9BXK5 485 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-211ENST00000489450 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa5.65□□□□□ -1.5
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RABGGTB-211ENST00000489450 SOX18P35713 384 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 NRLP54845 237 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 GPLD1P80108 840 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 COL19A1Q14993 1142 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 SVOPQ8N4V2 548 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 GIPC2Q8TF65 315 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 TNFRSF25Q93038 417 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 DNAJC25Q9H1X3 360 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 J3QW42 95 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 ACPPP15309 386 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 IRS1P35568 1242 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 ADH7P40394 386 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 ATP2B2Q01814 1243 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 HYAL2Q12891 473 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 TRPM4Q8TD43 1214 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 PMEPA1Q969W9 287 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC74AQ96AQ1 378 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 NPHS2Q9NP85 383 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 LATS2Q9NRM7 1088 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 RNF19AQ9NV58 838 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 SALL4Q9UJQ4 1053 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC6A14Q9UN76 642 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 KIF4AO95239 1232 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 CPB1P15086 417 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 LYPD4Q6UWN0 246 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 PI16Q6UXB8 463 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 NCAPG2Q86XI2 1143 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 GALNT12Q8IXK2 581 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF428Q96B54 188 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 MDFIQ99750 246 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 NAGPAQ9UK23 515 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 ABCC9O60706 1549 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 TRPA1O75762 1119 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 EPXP11678 715 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
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RABGGTB-211ENST00000489450 ELOA3BQ3SY89 546 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM35AQ86V20 835 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 ELOA3Q8NG57 546 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 SHISA8B8ZZ34 492 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 GHRHP01286 108 aa5.6□□□□□ -1.51
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RABGGTB-211ENST00000489450 EDN3P14138 238 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 PCSK7Q16549 785 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP5.6□□□□□ -1.511e-323■■■■■ 36.9
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RABGGTB-211ENST00000489450 GALNT6Q8NCL4 622 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 EDARADDQ8WWZ3 215 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 SPACA7Q96KW9 195 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 HHIPQ96QV1 700 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 RASSF4Q9H2L5 321 aa5.6□□□□□ -1.51
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RABGGTB-211ENST00000489450 OIP5O43482 229 aa5.59□□□□□ -1.51
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RABGGTB-211ENST00000489450 PERM1Q5SV97 790 aa5.59□□□□□ -1.51
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RABGGTB-211ENST00000489450 STARD13Q9Y3M8 1113 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-211ENST00000489450 ALBP02768 609 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 KIAA0319Q5VV43 1072 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 GPAT2Q6NUI2 795 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 KANK3Q6NY19 840 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-211ENST00000489450 CHSY3Q70JA7 882 aa5.58□□□□□ -1.52
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