RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
ODC1-204ENST00000446285 ZNF521Q96K83 1311 aa34.04■■■■□ 3.04
ODC1-204ENST00000446285 RIMBP2O15034 1052 aa34.03■■■■□ 3.04
ODC1-204ENST00000446285 PLA2G12BQ9BX93 195 aa34.03■■■■□ 3.04
ODC1-204ENST00000446285 XDHP47989 1333 aa34.03■■■■□ 3.04
ODC1-204ENST00000446285 UFL1O94874 794 aa34.02■■■■□ 3.04
ODC1-204ENST00000446285 DBNDD1Q9H9R9 158 aa34.02■■■■□ 3.04
ODC1-204ENST00000446285 ECE2O60344 883 aa34.01■■■■□ 3.03
ODC1-204ENST00000446285 CNTNAP1P78357 1384 aa34■■■■□ 3.03
ODC1-204ENST00000446285 DPF2Q92785 391 aa34■■■■□ 3.03
ODC1-204ENST00000446285 GREM2Q9H772 168 aa33.99■■■■□ 3.03
ODC1-204ENST00000446285 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP33.99■■■■□ 3.03
ODC1-204ENST00000446285 H7C1D1 291 aa33.98■■■■□ 3.03
ODC1-204ENST00000446285 ATP2B4P23634 1241 aa33.98■■■■□ 3.03
ODC1-204ENST00000446285 RPS12P25398 132 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
ODC1-204ENST00000446285 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
ODC1-204ENST00000446285 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP33.98■■■■□ 3.03
ODC1-204ENST00000446285 PSMD14O00487 310 aa33.97■■■■□ 3.03
ODC1-204ENST00000446285 CASP7P55210 303 aa33.97■■■■□ 3.03
ODC1-204ENST00000446285 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
ODC1-204ENST00000446285 TRPM7Q96QT4 1865 aa33.97■■■■□ 3.03
ODC1-204ENST00000446285 G3V3G9 751 aa33.96■■■■□ 3.03
ODC1-204ENST00000446285 DOK7Q18PE1 504 aa33.96■■■■□ 3.03
ODC1-204ENST00000446285 DCAF8Q5TAQ9 597 aa33.96■■■■□ 3.03
ODC1-204ENST00000446285 SPEF2Q9C093 1822 aa33.95■■■■□ 3.03
ODC1-204ENST00000446285 PGAP2Q9UHJ9 254 aa33.95■■■■□ 3.03
ODC1-204ENST00000446285 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP33.94■■■■□ 3.02
ODC1-204ENST00000446285 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP33.94■■■■□ 3.02
ODC1-204ENST00000446285 BEND3Q5T5X7 828 aa33.93■■■■□ 3.02
ODC1-204ENST00000446285 MICALL2Q8IY33 904 aa33.93■■■■□ 3.02
ODC1-204ENST00000446285 SCN9AQ15858 1988 aa33.92■■■■□ 3.02
ODC1-204ENST00000446285 CSF1RP07333 972 aa33.92■■■■□ 3.02
ODC1-204ENST00000446285 MINPP1Q9UNW1 487 aa33.92■■■■□ 3.02
ODC1-204ENST00000446285 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP33.92■■■■□ 3.02
ODC1-204ENST00000446285 PSME4Q14997 1843 aa33.92■■■■□ 3.02
ODC1-204ENST00000446285 RASSF10A6NK89 507 aa33.91■■■■□ 3.02
ODC1-204ENST00000446285 E9PSI1 815 aa33.91■■■■□ 3.02
ODC1-204ENST00000446285 ZNF609O15014 1411 aa33.9■■■■□ 3.02
ODC1-204ENST00000446285 F6X3S4 739 aa33.9■■■■□ 3.02
ODC1-204ENST00000446285 ITGA6P23229 1130 aa33.9■■■■□ 3.02
ODC1-204ENST00000446285 MED23Q9ULK4 1368 aa33.89■■■■□ 3.02
ODC1-204ENST00000446285 VIL1P09327 827 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
ODC1-204ENST00000446285 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
ODC1-204ENST00000446285 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
ODC1-204ENST00000446285 TRPM4Q8TD43 1214 aa33.89■■■■□ 3.02
ODC1-204ENST00000446285 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP33.88■■■■□ 3.01
ODC1-204ENST00000446285 DEFB115Q30KQ5 88 aa33.88■■■■□ 3.01
ODC1-204ENST00000446285 FAM161AQ3B820 660 aa33.88■■■■□ 3.01
ODC1-204ENST00000446285 PODNQ7Z5L7 613 aa33.88■■■■□ 3.01
ODC1-204ENST00000446285 MPHOSPH8Q99549 860 aa33.88■■■■□ 3.01
ODC1-204ENST00000446285 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP33.88■■■■□ 3.01
ODC1-204ENST00000446285 IFFO2Q5TF58 517 aa33.87■■■■□ 3.01
ODC1-204ENST00000446285 ANKRD2Q9GZV1 360 aa33.87■■■■□ 3.01
ODC1-204ENST00000446285 KCNQ5Q9NR82 932 aa33.87■■■■□ 3.01
ODC1-204ENST00000446285 LEMD3Q9Y2U8 911 aa33.87■■■■□ 3.01
ODC1-204ENST00000446285 ALDH1L1O75891 902 aa33.86■■■■□ 3.01
ODC1-204ENST00000446285 CCT4P50991 539 aaKnown RBP33.86■■■■□ 3.01
ODC1-204ENST00000446285 CDC37L1Q7L3B6 337 aa33.86■■■■□ 3.01
ODC1-204ENST00000446285 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa33.85■■■■□ 3.01
ODC1-204ENST00000446285 CCER2I3L3R5 266 aa33.85■■■■□ 3.01
ODC1-204ENST00000446285 VEGFBP49765 207 aa33.85■■■■□ 3.01
ODC1-204ENST00000446285 SHTN1A0MZ66 631 aa33.84■■■■□ 3.01
ODC1-204ENST00000446285 GRM8O00222 908 aa33.84■■■■□ 3.01
ODC1-204ENST00000446285 TRAF5O00463 557 aa33.84■■■■□ 3.01
ODC1-204ENST00000446285 AGBL3Q8NEM8 1001 aa33.84■■■■□ 3.01
ODC1-204ENST00000446285 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP33.83■■■■□ 3.01
ODC1-204ENST00000446285 SAMD7Q7Z3H4 446 aa33.82■■■■□ 3
ODC1-204ENST00000446285 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP33.82■■■■□ 3
ODC1-204ENST00000446285 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa33.82■■■■□ 3
ODC1-204ENST00000446285 FOXO4P98177 505 aa33.81■■■■□ 3
ODC1-204ENST00000446285 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP33.81■■■■□ 3
ODC1-204ENST00000446285 CST9Q5W186 159 aa33.81■■■■□ 3
ODC1-204ENST00000446285 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP33.81■■■■□ 3
ODC1-204ENST00000446285 USP17L3A6NCW0 530 aa33.8■■■■□ 3
ODC1-204ENST00000446285 USP17L4A6NCW7 530 aa33.8■■■■□ 3
ODC1-204ENST00000446285 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP33.8■■■■□ 39e-11■□□□□ 9.5
ODC1-204ENST00000446285 SLFN5Q08AF3 891 aa33.8■■■■□ 3
ODC1-204ENST00000446285 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
ODC1-204ENST00000446285 SLC4A10Q6U841 1118 aa33.8■■■■□ 3
ODC1-204ENST00000446285 USP17L1Q7RTZ2 530 aa33.8■■■■□ 3
ODC1-204ENST00000446285 COA1Q9GZY4 146 aa33.79■■■■□ 3
ODC1-204ENST00000446285 TLL2Q9Y6L7 1015 aa33.79■■■■□ 3
ODC1-204ENST00000446285 ZNF804BA4D1E1 1349 aa33.79■■■■□ 3
ODC1-204ENST00000446285 PTPRCP08575 1304 aa33.79■■■■□ 3
ODC1-204ENST00000446285 CELF2O95319 508 aaKnown RBP33.78■■■■□ 3
ODC1-204ENST00000446285 ECE1P42892 770 aa33.78■■■■□ 3
ODC1-204ENST00000446285 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa33.78■■■■□ 3
ODC1-204ENST00000446285 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP33.78■■■■□ 3
ODC1-204ENST00000446285 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP33.77■■■■□ 3
ODC1-204ENST00000446285 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP33.77■■■■□ 3
ODC1-204ENST00000446285 CHMP3Q9Y3E7 222 aa33.77■■■■□ 3
ODC1-204ENST00000446285 CHRNDQ07001 517 aa33.76■■■□□ 2.99
ODC1-204ENST00000446285 KCNJ4P48050 445 aa33.75■■■□□ 2.99
ODC1-204ENST00000446285 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP33.75■■■□□ 2.99
ODC1-204ENST00000446285 LMBR1LQ6UX01 489 aa33.75■■■□□ 2.99
ODC1-204ENST00000446285 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP33.75■■■□□ 2.99
ODC1-204ENST00000446285 GMLQ99445 158 aa33.75■■■□□ 2.99
ODC1-204ENST00000446285 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
ODC1-204ENST00000446285 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
ODC1-204ENST00000446285 EGFRP00533 1210 aa33.74■■■□□ 2.99
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