RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	18.34	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	GGA1	Q9UJY5	639 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		18.34	■□□□□ 0.53
PTPA-222	ENST00000445241	WDR90	Q96KV7	1748 aa		18.33	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	PPIP5K2	O43314	1243 aa		18.33	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	ATP2B4	P23634	1241 aa		18.33	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		18.33	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	MEIS3	Q99687	375 aa		18.33	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	18.33	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	WASHC4	Q2M389	1173 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	NIM1K	Q8IY84	436 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	POLL	Q9UGP5	575 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		18.32	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	C6orf229	H3BNL8	230 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	AOC3	Q16853	763 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	SLC51A	Q86UW1	340 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	FBXO3	Q9UK99	471 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	COL4A5	P29400	1685 aa		18.31	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	SCN4A	P35499	1836 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	UFL1	O94874	794 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	MTX1	Q13505	466 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	TNN	Q9UQP3	1299 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	MED23	Q9ULK4	1368 aa		18.3	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	GNAI2	P04899	355 aa		18.29	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	RLBP1	P12271	317 aa		18.29	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	CHRND	Q07001	517 aa		18.29	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	PDE3A	Q14432	1141 aa		18.29	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		18.29	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	18.29	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	18.29	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		18.29	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	PSME4	Q14997	1843 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	GPC2	Q8N158	579 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		18.28	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	18.27	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		18.27	■□□□□ 0.52
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		18.26	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	CIAO1	O76071	339 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	TNIP1	Q15025	636 aa		18.25	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	KCNJ4	P48050	445 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	UBE4A	Q14139	1066 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	PODN	Q7Z5L7	613 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	PANK1	Q8TE04	598 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	COPRS	Q9NQ92	184 aa		18.24	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF609	O15014	1411 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	EYA2	O00167	538 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	ECE2	O60344	883 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	COA1	Q9GZY4	146 aa		18.23	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	SCN9A	Q15858	1988 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241		G3V3G9	751 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	KIF3C	O14782	793 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	RIMBP2	O15034	1052 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	SRGAP3	O43295	1099 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	CXCL9	Q07325	125 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		18.22	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	YDJC	A8MPS7	323 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		18.21	■□□□□ 0.51
PTPA-222	ENST00000445241	PLIN1	O60240	522 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	PDE8B	O95263	885 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	18.2	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	LRRC24	Q50LG9	513 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	METTL24	Q5JXM2	366 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	RRAGC	Q9HB90	399 aa		18.2	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	POTEC	B2RU33	542 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	TAF5L	O75529	589 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	ATP8B2	P98198	1209 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	POLA2	Q14181	598 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	18.19	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		18.19	■□□□□ 0.5
PTPA-222	ENST00000445241	SSH3	Q8TE77	659 aa		18.19	■□□□□ 0.5

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