RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440702.5

FAM20B-202, Transcript of FAM20B, glycosaminoglycan xylosylkinase, humanhuman

TSL 3

Gene FAM20B, Length 603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20B-202ENST00000440702 EYA3Q99504 573 aa22.14■■□□□ 1.13
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FAM20B-202ENST00000440702 EGFRP00533 1210 aa22.13■■□□□ 1.13
FAM20B-202ENST00000440702 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
FAM20B-202ENST00000440702 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.13■■□□□ 1.13
FAM20B-202ENST00000440702 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.13■■□□□ 1.13
FAM20B-202ENST00000440702 UFL1O94874 794 aa22.12■■□□□ 1.13
FAM20B-202ENST00000440702 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
FAM20B-202ENST00000440702 SPEF2Q9C093 1822 aa22.11■■□□□ 1.13
FAM20B-202ENST00000440702 DPF2Q92785 391 aa22.11■■□□□ 1.13
FAM20B-202ENST00000440702 ABHD8Q96I13 439 aa22.11■■□□□ 1.13
FAM20B-202ENST00000440702 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.11■■□□□ 1.13
FAM20B-202ENST00000440702 G3V3G9 751 aa22.1■■□□□ 1.13
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FAM20B-202ENST00000440702 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.1■■□□□ 1.13
FAM20B-202ENST00000440702 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.1■■□□□ 1.13
FAM20B-202ENST00000440702 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
FAM20B-202ENST00000440702 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.09■■□□□ 1.13
FAM20B-202ENST00000440702 ADM5C9JUS6 153 aa22.09■■□□□ 1.13
FAM20B-202ENST00000440702 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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FAM20B-202ENST00000440702 PDE8AO60658 829 aa22.08■■□□□ 1.13
FAM20B-202ENST00000440702 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
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FAM20B-202ENST00000440702 TSPYL6Q8N831 410 aa22.08■■□□□ 1.13
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FAM20B-202ENST00000440702 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.07■■□□□ 1.12
FAM20B-202ENST00000440702 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.07■■□□□ 1.12
FAM20B-202ENST00000440702 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
FAM20B-202ENST00000440702 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.07■■□□□ 1.12
FAM20B-202ENST00000440702 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.07■■□□□ 1.12
FAM20B-202ENST00000440702 MYH3P11055 1940 aa22.07■■□□□ 1.12
FAM20B-202ENST00000440702 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
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FAM20B-202ENST00000440702 ZIC5Q96T25 663 aa22.06■■□□□ 1.12
FAM20B-202ENST00000440702 PSME4Q14997 1843 aa22.06■■□□□ 1.12
FAM20B-202ENST00000440702 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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FAM20B-202ENST00000440702 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.05■■□□□ 1.12
FAM20B-202ENST00000440702 GGA3Q9NZ52 723 aa22.05■■□□□ 1.12
FAM20B-202ENST00000440702 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
FAM20B-202ENST00000440702 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
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FAM20B-202ENST00000440702 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.02■■□□□ 1.12
FAM20B-202ENST00000440702 CA12O43570 354 aa22.02■■□□□ 1.12
FAM20B-202ENST00000440702 CTSWP56202 376 aa22.02■■□□□ 1.12
FAM20B-202ENST00000440702 NOGQ13253 232 aa22.02■■□□□ 1.12
FAM20B-202ENST00000440702 CCDC184Q52MB2 194 aa22.02■■□□□ 1.12
FAM20B-202ENST00000440702 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.02■■□□□ 1.12
FAM20B-202ENST00000440702 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.02■■□□□ 1.12
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FAM20B-202ENST00000440702 RGMBQ6NW40 437 aa22.01■■□□□ 1.11
FAM20B-202ENST00000440702 KSR2Q6VAB6 950 aa22.01■■□□□ 1.11
FAM20B-202ENST00000440702 SULF1Q8IWU6 871 aa22.01■■□□□ 1.11
FAM20B-202ENST00000440702 STK31Q9BXU1 1019 aa22.01■■□□□ 1.11
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FAM20B-202ENST00000440702 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
FAM20B-202ENST00000440702 ATP2B4P23634 1241 aa21.99■■□□□ 1.11
FAM20B-202ENST00000440702 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.99■■□□□ 1.11
FAM20B-202ENST00000440702 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
FAM20B-202ENST00000440702 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.99■■□□□ 1.11
FAM20B-202ENST00000440702 GREM2Q9H772 168 aa21.99■■□□□ 1.11
FAM20B-202ENST00000440702 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
FAM20B-202ENST00000440702 SCARF1Q14162 830 aa21.98■■□□□ 1.11
FAM20B-202ENST00000440702 FAM161AQ3B820 660 aa21.98■■□□□ 1.11
FAM20B-202ENST00000440702 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
FAM20B-202ENST00000440702 G2E3Q7L622 706 aa21.98■■□□□ 1.11
FAM20B-202ENST00000440702 AGBL3Q8NEM8 1001 aa21.98■■□□□ 1.11
FAM20B-202ENST00000440702 FBXW7Q969H0 707 aa21.98■■□□□ 1.11
FAM20B-202ENST00000440702 CDCA5Q96FF9 252 aa21.98■■□□□ 1.11
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FAM20B-202ENST00000440702 TTLL11Q8NHH1 800 aa21.97■■□□□ 1.11
FAM20B-202ENST00000440702 MCOLN1Q9GZU1 580 aa21.97■■□□□ 1.11
FAM20B-202ENST00000440702 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
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FAM20B-202ENST00000440702 USP17L3A6NCW0 530 aa21.96■■□□□ 1.11
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FAM20B-202ENST00000440702 NEURL1BA8MQ27 555 aa21.96■■□□□ 1.11
FAM20B-202ENST00000440702 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
FAM20B-202ENST00000440702 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
FAM20B-202ENST00000440702 USP17L1Q7RTZ2 530 aa21.96■■□□□ 1.11
FAM20B-202ENST00000440702 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa21.96■■□□□ 1.11
FAM20B-202ENST00000440702 ZNF609O15014 1411 aa21.96■■□□□ 1.11
FAM20B-202ENST00000440702 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
FAM20B-202ENST00000440702 MXD3Q9BW11 206 aa21.95■■□□□ 1.1
FAM20B-202ENST00000440702 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.95■■□□□ 1.1
FAM20B-202ENST00000440702 MINPP1Q9UNW1 487 aa21.95■■□□□ 1.1
FAM20B-202ENST00000440702 SLC4A2P04920 1241 aa21.94■■□□□ 1.1
FAM20B-202ENST00000440702 USP17L8P0C7I0 530 aa21.94■■□□□ 1.1
FAM20B-202ENST00000440702 DGKZQ13574 1117 aa21.94■■□□□ 1.1
FAM20B-202ENST00000440702 WWC1Q8IX03 1113 aa21.94■■□□□ 1.1
FAM20B-202ENST00000440702 CCDC102AQ96A19 550 aa21.94■■□□□ 1.1
FAM20B-202ENST00000440702 GMLQ99445 158 aa21.94■■□□□ 1.1
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