RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	22.82	■■□□□ 1.24
MRPL28-203	ENST00000429738	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		22.82	■■□□□ 1.24
MRPL28-203	ENST00000429738	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	22.82	■■□□□ 1.24
MRPL28-203	ENST00000429738	YDJC	A8MPS7	323 aa		22.81	■■□□□ 1.24
MRPL28-203	ENST00000429738	WDR63	Q8IWG1	891 aa		22.81	■■□□□ 1.24
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		22.81	■■□□□ 1.24
MRPL28-203	ENST00000429738	CASP8AP2	Q9UKL3	1982 aa		22.81	■■□□□ 1.24
MRPL28-203	ENST00000429738	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	22.8	■■□□□ 1.24
MRPL28-203	ENST00000429738	KSR2	Q6VAB6	950 aa		22.8	■■□□□ 1.24
MRPL28-203	ENST00000429738	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		22.8	■■□□□ 1.24
MRPL28-203	ENST00000429738	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		22.8	■■□□□ 1.24
MRPL28-203	ENST00000429738	USP48	Q86UV5	1035 aa		22.79	■■□□□ 1.24
MRPL28-203	ENST00000429738	DPF2	Q92785	391 aa		22.79	■■□□□ 1.24
MRPL28-203	ENST00000429738	STK31	Q9BXU1	1019 aa		22.79	■■□□□ 1.24
MRPL28-203	ENST00000429738	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	22.79	■■□□□ 1.24
MRPL28-203	ENST00000429738	SHTN1	A0MZ66	631 aa		22.78	■■□□□ 1.24
MRPL28-203	ENST00000429738	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		22.78	■■□□□ 1.24
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC34A2	O95436	690 aa		22.78	■■□□□ 1.24
MRPL28-203	ENST00000429738	IGKV5-2	P06315	115 aa		22.78	■■□□□ 1.24
MRPL28-203	ENST00000429738	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	22.78	■■□□□ 1.24
MRPL28-203	ENST00000429738	MICALL2	Q8IY33	904 aa		22.78	■■□□□ 1.24
MRPL28-203	ENST00000429738	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		22.78	■■□□□ 1.24
MRPL28-203	ENST00000429738	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		22.78	■■□□□ 1.24
MRPL28-203	ENST00000429738	NOG	Q13253	232 aa		22.77	■■□□□ 1.24
MRPL28-203	ENST00000429738	G2E3	Q7L622	706 aa		22.77	■■□□□ 1.24
MRPL28-203	ENST00000429738	PDE8A	O60658	829 aa		22.76	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	22.76	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	WASHC4	Q2M389	1173 aa		22.76	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	22.76	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	22.76	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	MYH3	P11055	1940 aa		22.76	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	PSMD14	O00487	310 aa		22.75	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC4A2	P04920	1241 aa		22.75	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	HUNK	P57058	714 aa		22.75	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		22.75	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	22.75	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	22.74	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	VAMP4	O75379	141 aa		22.74	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	22.74	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	ZIC5	Q96T25	663 aa		22.74	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	22.74	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		22.74	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	GPSM2	P81274	684 aa		22.73	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		22.73	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	DLK2	Q6UY11	383 aa		22.73	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		22.73	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		22.73	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	POLL	Q9UGP5	575 aa		22.73	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		22.72	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	RIMBP2	O15034	1052 aa		22.72	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		22.72	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	FLII	Q13045	1269 aa		22.72	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	DGKZ	Q13574	1117 aa		22.72	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		22.72	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	C6orf229	H3BNL8	230 aa		22.71	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	22.71	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	22.71	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	22.71	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	22.71	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	RGMB	Q6NW40	437 aa		22.71	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		22.71	■■□□□ 1.23
MRPL28-203	ENST00000429738	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		22.7	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	22.7	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	22.69	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	EGFR	P00533	1210 aa		22.69	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	CTSW	P56202	376 aa		22.69	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	22.69	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		22.69	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC102A	Q96A19	550 aa		22.69	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	22.69	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	EYA3	Q99504	573 aa		22.69	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		22.69	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF521	Q96K83	1311 aa		22.68	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738		H7C1W4	665 aa		22.68	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	ECE2	O60344	883 aa		22.68	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	DOK7	Q18PE1	504 aa		22.68	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		22.68	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	22.68	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	RTL9	Q8NET4	1388 aa		22.67	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	22.67	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		22.67	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	ADM5	C9JUS6	153 aa		22.66	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	22.66	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	GCKR	Q14397	625 aa		22.66	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		22.66	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		22.66	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	SCN9A	Q15858	1988 aa		22.66	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	22.65	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	22.65	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	CASP7	P55210	303 aa		22.65	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		22.65	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		22.65	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	22.65	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	SPEF2	Q9C093	1822 aa		22.65	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		22.64	■■□□□ 1.22
MRPL28-203	ENST00000429738	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		22.64	■■□□□ 1.21
MRPL28-203	ENST00000429738	LINS1	Q8NG48	757 aa		22.64	■■□□□ 1.21
MRPL28-203	ENST00000429738	GREM2	Q9H772	168 aa		22.64	■■□□□ 1.21
MRPL28-203	ENST00000429738	UFL1	O94874	794 aa		22.63	■■□□□ 1.21
MRPL28-203	ENST00000429738	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		22.63	■■□□□ 1.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 132.6 ms