RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368205.7

PTPRK-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 662 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-202ENST00000368205 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-202ENST00000368205 SAP130Q9H0E3 1048 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRK-202ENST00000368205 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-202ENST00000368205 PRR23CQ6ZRP0 262 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-202ENST00000368205 IL22RA1Q8N6P7 574 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-202ENST00000368205 AKTIPQ9H8T0 292 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-202ENST00000368205 FAM13BQ9NYF5 915 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRK-202ENST00000368205 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-202ENST00000368205 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-202ENST00000368205 SLC51AQ86UW1 340 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-202ENST00000368205 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-202ENST00000368205 MUC3BQ9H195 1237 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-202ENST00000368205 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-202ENST00000368205 RNF112Q9ULX5 631 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRK-202ENST00000368205 F8W735 103 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-202ENST00000368205 TNFRSF10BO14763 440 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-202ENST00000368205 SETDB1Q15047 1291 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-202ENST00000368205 FAM26DQ5JW98 314 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-202ENST00000368205 Q6ZS46 218 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-202ENST00000368205 OR13H1Q8NG92 308 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-202ENST00000368205 STK32AQ8WU08 396 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRK-202ENST00000368205 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-202ENST00000368205 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-202ENST00000368205 ATG7O95352 703 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-202ENST00000368205 PIK3R5Q8WYR1 880 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRK-202ENST00000368205 UBAP1LF5GYI3 381 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-202ENST00000368205 TRIM33Q9UPN9 1127 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRK-202ENST00000368205 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-202ENST00000368205 PPME1Q9Y570 386 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRK-202ENST00000368205 ALX3O95076 343 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-202ENST00000368205 HYAL2Q12891 473 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-202ENST00000368205 CAPN12Q6ZSI9 719 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-202ENST00000368205 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRK-202ENST00000368205 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-202ENST00000368205 KIF4AO95239 1232 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-202ENST00000368205 ZAP70P43403 619 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-202ENST00000368205 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-202ENST00000368205 TMEM164Q5U3C3 297 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-202ENST00000368205 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-202ENST00000368205 MKNK1Q9BUB5 465 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRK-202ENST00000368205 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-202ENST00000368205 FSTP19883 344 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-202ENST00000368205 SPACA7Q96KW9 195 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-202ENST00000368205 STIM2Q9P246 746 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRK-202ENST00000368205 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-202ENST00000368205 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-202ENST00000368205 ABTB2Q8N961 1025 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-202ENST00000368205 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRK-202ENST00000368205 ATP11AP98196 1134 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-202ENST00000368205 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-202ENST00000368205 GALNT11Q8NCW6 608 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-202ENST00000368205 GPR152Q8TDT2 470 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRK-202ENST00000368205 LINC01387J3KSC0 135 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-202ENST00000368205 TM4SF5O14894 197 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-202ENST00000368205 GLB1P16278 677 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-202ENST00000368205 CDC27P30260 824 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-202ENST00000368205 CEP135Q66GS9 1140 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-202ENST00000368205 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP8.59□□□□□ -1.03
PTPRK-202ENST00000368205 ZBTB39O15060 712 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 GSC2O15499 205 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 CD68P34810 354 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 SCNN1AP37088 669 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 RASSF4Q9H2L5 321 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 RAXQ9Y2V3 346 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 CEP120Q8N960 986 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 KLHL23Q8NBE8 558 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 PBX4Q9BYU1 374 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 LACRTQ9GZZ8 138 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 WISP1O95388 367 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 UVSSAQ2YD98 709 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 PBXIP1Q96AQ6 731 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 CEP41Q9BYV8 373 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 SLAIN2Q9P270 581 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 FSCN2O14926 492 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 ADAM19Q9H013 955 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 ELP3Q9H9T3 547 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 PCMTD2Q9NV79 361 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 KCNK4Q9NYG8 393 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 DHX15O43143 795 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 IGLV1-40P01703 118 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 PTPRAP18433 802 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 ATP2B4P23634 1241 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 CD97P48960 835 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 FAM117BQ6P1L5 589 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 TXNDC11Q6PKC3 985 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 ACAD11Q709F0 780 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 ARMC10Q8N2F6 343 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 EPHA1P21709 976 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 XKR5Q6UX68 686 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 NCAPG2Q86XI2 1143 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 WNT8BQ93098 351 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRK-202ENST00000368205 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
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