RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 TPRNQ4KMQ1 711 aa10□□□□□ -0.81
PTPRC-202ENST00000367364 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PTPRC-202ENST00000367364 RGL4Q8IZJ4 473 aa10□□□□□ -0.81
PTPRC-202ENST00000367364 DCAF11Q8TEB1 546 aa10□□□□□ -0.81
PTPRC-202ENST00000367364 TM4SF5O14894 197 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRC-202ENST00000367364 DHX15O43143 795 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRC-202ENST00000367364 SOX18P35713 384 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRC-202ENST00000367364 NFIAQ12857 509 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRC-202ENST00000367364 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
PTPRC-202ENST00000367364 USP17L15C9J2P7 530 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRC-202ENST00000367364 USP17L10C9JJH3 530 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRC-202ENST00000367364 USP17L13C9JLJ4 530 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRC-202ENST00000367364 USP17L12C9JPN9 530 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRC-202ENST00000367364 USP17L11C9JVI0 530 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRC-202ENST00000367364 USP17L21D6R901 530 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRC-202ENST00000367364 USP17L18D6R9N7 530 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRC-202ENST00000367364 USP17L22D6RA61 530 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRC-202ENST00000367364 USP17L17D6RBQ6 530 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRC-202ENST00000367364 USP17L19D6RCP7 530 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRC-202ENST00000367364 USP17L20D6RJB6 530 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRC-202ENST00000367364 FOXO3O43524 673 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRC-202ENST00000367364 USP17L24Q0WX57 530 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRC-202ENST00000367364 ANKMY2Q8IV38 441 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRC-202ENST00000367364 PRR19A6NJB7 356 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRC-202ENST00000367364 TREML1Q86YW5 311 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRC-202ENST00000367364 GLMNQ92990 594 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRC-202ENST00000367364 C7orf69Q9H7B7 122 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRC-202ENST00000367364 KCNK4Q9NYG8 393 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRC-202ENST00000367364 PPME1Q9Y570 386 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRC-202ENST00000367364 DTX1Q86Y01 620 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 TRIM42Q8IWZ5 723 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 ARXQ96QS3 562 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 RBSNQ9H1K0 784 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 FAM196BA6NMK8 535 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 LINC01387J3KSC0 135 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 ACAD11Q709F0 780 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 MUC3BQ9H195 1237 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 HMX2A2RU54 273 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 UVSSAQ2YD98 709 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 TXNDC11Q6PKC3 985 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 CEP41Q9BYV8 373 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 CD68P34810 354 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 RNF43Q68DV7 783 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 GRIK1P39086 918 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 ATP11AP98196 1134 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 FZD5Q13467 585 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 VTI1AQ96AJ9 217 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 DBNDD2Q9BQY9 259 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 FLIIQ13045 1269 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 NLRP13Q86W25 1043 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 MYRFLQ96LU7 910 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 ADGRE2Q9UHX3 823 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 COX20Q5RI15 118 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 CARD10Q9BWT7 1032 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 LACRTQ9GZZ8 138 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPRC-202ENST00000367364 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRC-202ENST00000367364 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPRC-202ENST00000367364 OR13H1Q8NG92 308 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRC-202ENST00000367364 WNT11O96014 354 aa9.88□□□□□ -0.83
PTPRC-202ENST00000367364 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
PTPRC-202ENST00000367364 ADAM11O75078 769 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRC-202ENST00000367364 FAM26DQ5JW98 314 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRC-202ENST00000367364 CEP135Q66GS9 1140 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRC-202ENST00000367364 FAM20CQ8IXL6 584 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRC-202ENST00000367364 SHKBP1Q8TBC3 707 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRC-202ENST00000367364 VRTNQ9H8Y1 702 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRC-202ENST00000367364 FSCN2O14926 492 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRC-202ENST00000367364 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
PTPRC-202ENST00000367364 CDC27P30260 824 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRC-202ENST00000367364 CDC25BP30305 580 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRC-202ENST00000367364 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
PTPRC-202ENST00000367364 UBASH3BQ8TF42 649 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRC-202ENST00000367364 FAM83CQ9BQN1 747 aa9.86□□□□□ -0.83
PTPRC-202ENST00000367364 DUOXA2Q1HG44 320 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRC-202ENST00000367364 CLEC10AQ8IUN9 316 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRC-202ENST00000367364 RASSF4Q9H2L5 321 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRC-202ENST00000367364 EPHA1P21709 976 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRC-202ENST00000367364 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRC-202ENST00000367364 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
PTPRC-202ENST00000367364 KLHL23Q8NBE8 558 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRC-202ENST00000367364 COL26A1Q96A83 441 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRC-202ENST00000367364 CLUAP1Q96AJ1 413 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRC-202ENST00000367364 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.83
PTPRC-202ENST00000367364 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 HYAL2Q12891 473 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 SAP130Q9H0E3 1048 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 UBAP1LF5GYI3 381 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP9.82□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 BMP3P12645 472 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 PREPP48147 710 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRC-202ENST00000367364 BEND4Q6ZU67 534 aa9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms