RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340766.9

PPP1CC-202, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PPP1CC, Length 1,472 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-202ENST00000340766 IL15P40933 162 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
PPP1CC-202ENST00000340766 ATG9AQ7Z3C6 839 aa35.44■■■■□ 3.26
PPP1CC-202ENST00000340766 KCNA3P22001 575 aa35.43■■■■□ 3.26
PPP1CC-202ENST00000340766 TMC4Q7Z404 712 aa35.43■■■■□ 3.26
PPP1CC-202ENST00000340766 ERC1Q8IUD2 1116 aa35.43■■■■□ 3.26
PPP1CC-202ENST00000340766 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa35.43■■■■□ 3.26
PPP1CC-202ENST00000340766 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
PPP1CC-202ENST00000340766 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
PPP1CC-202ENST00000340766 APBB1O00213 710 aa35.41■■■■□ 3.26
PPP1CC-202ENST00000340766 MROH5Q6ZUA9 1318 aa35.4■■■■□ 3.26
PPP1CC-202ENST00000340766 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
PPP1CC-202ENST00000340766 TTLL6Q8N841 843 aa35.39■■■■□ 3.26
PPP1CC-202ENST00000340766 KIF1BPQ96EK5 621 aa35.39■■■■□ 3.26
PPP1CC-202ENST00000340766 SASH1O94885 1247 aa35.38■■■■□ 3.25
PPP1CC-202ENST00000340766 NLGN2Q8NFZ4 835 aa35.38■■■■□ 3.25
PPP1CC-202ENST00000340766 LRRCC1Q9C099 1032 aa35.38■■■■□ 3.25
PPP1CC-202ENST00000340766 METTL24Q5JXM2 366 aa35.37■■■■□ 3.25
PPP1CC-202ENST00000340766 RHPN1Q8TCX5 695 aa35.37■■■■□ 3.25
PPP1CC-202ENST00000340766 PIM2Q9P1W9 311 aa35.37■■■■□ 3.25
PPP1CC-202ENST00000340766 MINPP1Q9UNW1 487 aa35.37■■■■□ 3.25
PPP1CC-202ENST00000340766 LTBP1Q14766 1721 aa35.36■■■■□ 3.25
PPP1CC-202ENST00000340766 CHRNDQ07001 517 aa35.35■■■■□ 3.25
PPP1CC-202ENST00000340766 CEP126Q9P2H0 1117 aa35.35■■■■□ 3.25
PPP1CC-202ENST00000340766 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa35.35■■■■□ 3.25
PPP1CC-202ENST00000340766 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa35.35■■■■□ 3.25
PPP1CC-202ENST00000340766 TFCP2Q12800 502 aa35.35■■■■□ 3.25
PPP1CC-202ENST00000340766 ANKRD45Q5TZF3 282 aa35.35■■■■□ 3.25
PPP1CC-202ENST00000340766 SP8Q8IXZ3 490 aa35.34■■■■□ 3.25
PPP1CC-202ENST00000340766 VGLL2Q8N8G2 317 aa35.34■■■■□ 3.25
PPP1CC-202ENST00000340766 ARAP2Q8WZ64 1704 aa35.33■■■■□ 3.25
PPP1CC-202ENST00000340766 ANKRD2Q9GZV1 360 aa35.33■■■■□ 3.25
PPP1CC-202ENST00000340766 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
PPP1CC-202ENST00000340766 NUCB1Q02818 461 aa35.32■■■■□ 3.24
PPP1CC-202ENST00000340766 SLC51AQ86UW1 340 aa35.32■■■■□ 3.24
PPP1CC-202ENST00000340766 SYT17Q9BSW7 474 aa35.32■■■■□ 3.24
PPP1CC-202ENST00000340766 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa35.32■■■■□ 3.24
PPP1CC-202ENST00000340766 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa35.31■■■■□ 3.24
PPP1CC-202ENST00000340766 ZNF609O15014 1411 aa35.31■■■■□ 3.24
PPP1CC-202ENST00000340766 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
PPP1CC-202ENST00000340766 PDE8BO95263 885 aa35.3■■■■□ 3.24
PPP1CC-202ENST00000340766 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
PPP1CC-202ENST00000340766 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
PPP1CC-202ENST00000340766 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
PPP1CC-202ENST00000340766 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP35.3■■■■□ 3.24
PPP1CC-202ENST00000340766 C7orf43Q8WVR3 580 aa35.29■■■■□ 3.24
PPP1CC-202ENST00000340766 GPR108Q9NPR9 543 aa35.29■■■■□ 3.24
PPP1CC-202ENST00000340766 XDHP47989 1333 aa35.28■■■■□ 3.24
PPP1CC-202ENST00000340766 TAF5LO75529 589 aa35.28■■■■□ 3.24
PPP1CC-202ENST00000340766 CHD1LQ86WJ1 897 aa35.28■■■■□ 3.24
PPP1CC-202ENST00000340766 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
PPP1CC-202ENST00000340766 LNPKQ9C0E8 428 aa35.27■■■■□ 3.24
PPP1CC-202ENST00000340766 AKAP2Q9Y2D5 859 aa35.27■■■■□ 3.24
PPP1CC-202ENST00000340766 DUOX1Q9NRD9 1551 aa35.26■■■■□ 3.24
PPP1CC-202ENST00000340766 TNNI3KQ59H18 835 aa35.26■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa35.26■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 OLFM4Q6UX06 510 aa35.26■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa35.26■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP35.26■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 WWC3Q9ULE0 1092 aa35.26■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa35.26■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 GPSM2P81274 684 aa35.25■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 SNED1Q8TER0 1413 aa35.24■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 C21orf2O43822 256 aa35.24■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 ATP2B3Q16720 1220 aa35.24■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 BCL11AQ9H165 835 aa35.24■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 PODXL2Q9NZ53 605 aa35.24■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP35.24■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 BCS1LQ9Y276 419 aa35.23■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa35.23■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 SOGA3Q5TF21 947 aa35.22■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 AACSQ86V21 672 aa35.22■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP35.22■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP35.22■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 A0A1B0GUL7 405 aa35.22■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 FGFR2P21802 821 aa35.22■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 KCNJ4P48050 445 aa35.22■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 UBE4AQ14139 1066 aa35.22■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 MPNDQ8N594 471 aa35.22■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 CCDC93Q567U6 631 aa35.21■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 LPIN2Q92539 896 aa35.21■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 GGA1Q9UJY5 639 aa35.21■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 LEMD3Q9Y2U8 911 aa35.21■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 ZNF804BA4D1E1 1349 aa35.2■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 GRIPAP1Q4V328 841 aa35.2■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
PPP1CC-202ENST00000340766 SNAP23O00161 211 aa35.19■■■■□ 3.22
PPP1CC-202ENST00000340766 SLC5A1P13866 664 aa35.19■■■■□ 3.22
PPP1CC-202ENST00000340766 ATP2B4P23634 1241 aa35.19■■■■□ 3.22
PPP1CC-202ENST00000340766 UFL1O94874 794 aa35.18■■■■□ 3.22
PPP1CC-202ENST00000340766 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
PPP1CC-202ENST00000340766 NEUROD6Q96NK8 337 aa35.18■■■■□ 3.22
PPP1CC-202ENST00000340766 TIMM10P62072 90 aa35.17■■■■□ 3.22
PPP1CC-202ENST00000340766 TBC1D16Q8TBP0 767 aa35.17■■■■□ 3.22
PPP1CC-202ENST00000340766 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
PPP1CC-202ENST00000340766 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
PPP1CC-202ENST00000340766 RTKN2Q8IZC4 609 aa35.16■■■■□ 3.22
PPP1CC-202ENST00000340766 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP35.16■■■■□ 3.22
PPP1CC-202ENST00000340766 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
PPP1CC-202ENST00000340766 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP35.15■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.7 ms