RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317040.11

MVB12A-201, Transcript of multivesicular body subunit 12A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MVB12A, Length 2,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12A-201ENST00000317040 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
MVB12A-201ENST00000317040 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.46■■□□□ 1.19
MVB12A-201ENST00000317040 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
MVB12A-201ENST00000317040 NRDCO43847 1150 aa22.46■■□□□ 1.19
MVB12A-201ENST00000317040 TPM4P67936 248 aa22.46■■□□□ 1.19
MVB12A-201ENST00000317040 CEP57L1Q8IYX8 460 aa22.46■■□□□ 1.19
MVB12A-201ENST00000317040 GNAT3A8MTJ3 354 aa22.45■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 TPM1P09493 284 aa22.45■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 KRT32Q14532 448 aa22.45■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.45■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 HOXB7P09629 217 aa22.45■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 ARID5BQ14865 1188 aa22.45■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 ABTB2Q8N961 1025 aa22.45■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 RCOR1Q9UKL0 485 aa22.45■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 TXLNBQ8N3L3 684 aa22.44■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 V9GYY5 206 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 TNS3Q68CZ2 1445 aa22.44■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 NUTM2GQ5VZR2 741 aa22.43■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 GTF3C6Q969F1 213 aa22.43■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 BPIFA3Q9BQP9 254 aa22.43■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 USP16Q9Y5T5 823 aa22.43■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 MED23Q9ULK4 1368 aa22.43■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.43■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 CLCN6P51797 869 aa22.43■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 ZBTB22O15209 634 aa22.42■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.42■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 ERICH4A6NGS2 130 aa22.42■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 BEND3Q5T5X7 828 aa22.42■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.42■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa22.42■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 CAPN2P17655 700 aa22.41■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 PLA2G4AP47712 749 aa22.41■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa22.41■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 KINO60870 393 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.4■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 TMCO3Q6UWJ1 677 aa22.4■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 UBXN6Q9BZV1 441 aa22.4■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 NLRP6P59044 892 aa22.39■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.39■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.39■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 BRF1Q92994 677 aa22.39■■□□□ 1.18
MVB12A-201ENST00000317040 H3BQV1 296 aa22.39■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 IFFO2Q5TF58 517 aa22.39■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.39■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 NBPF11Q86T75 865 aa22.38■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.38■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 ST7Q9NRC1 585 aa22.38■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 ADD1P35611 737 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 EYA1Q99502 592 aa22.38■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 ALS2Q96Q42 1657 aa22.38■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa22.37■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 CABLES1Q8TDN4 633 aa22.37■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 ETF1P62495 437 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 GPS2Q13227 327 aa22.37■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 UBXN4Q92575 508 aa22.37■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.36■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 ALDH1L1O75891 902 aa22.36■■□□□ 1.17
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MVB12A-201ENST00000317040 NECTIN2Q92692 538 aa22.36■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 PIK3C2AO00443 1686 aa22.35■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 EFCAB8A8MWE9 144 aa22.35■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.35■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 SYT10Q6XYQ8 523 aa22.35■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 FAM227BQ96M60 508 aa22.35■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 AOPEPQ8N6M6 819 aa22.35■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.35■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 ABCC6O95255 1503 aa22.34■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 DTNBO60941 627 aa22.34■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 FCHSD1Q86WN1 690 aa22.34■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa22.34■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 IL17REQ8NFR9 667 aa22.34■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 CHMP4CQ96CF2 233 aa22.34■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.34■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 DNAI1Q9UI46 699 aa22.34■■□□□ 1.17
MVB12A-201ENST00000317040 A0A1W2PQ27 194 aa22.33■■□□□ 1.16
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