RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262643.7

CCNE1-201, Transcript of cyclin E1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNE1, Length 2,043 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1-201ENST00000262643 GJA3Q9Y6H8 435 aa26.8■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 RIMBP2O15034 1052 aa26.79■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 TBC1D16Q8TBP0 767 aa26.79■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 LMBR1LQ6UX01 489 aa26.78■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 LTBP1Q14766 1721 aa26.78■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 UFL1O94874 794 aa26.78■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 GPC2Q8N158 579 aa26.78■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 ZNRF3Q9ULT6 936 aa26.78■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 PODXL2Q9NZ53 605 aa26.77■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 GGA1Q9UJY5 639 aa26.77■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa26.77■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 SUCLG2Q96I99 432 aa26.77■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
CCNE1-201ENST00000262643 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CCNE1-201ENST00000262643 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.76■■□□□ 1.87
CCNE1-201ENST00000262643 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
CCNE1-201ENST00000262643 EYA3Q99504 573 aa26.76■■□□□ 1.87
CCNE1-201ENST00000262643 MPHOSPH8Q99549 860 aa26.76■■□□□ 1.87
CCNE1-201ENST00000262643 MINPP1Q9UNW1 487 aa26.76■■□□□ 1.87
CCNE1-201ENST00000262643 XDHP47989 1333 aa26.76■■□□□ 1.87
CCNE1-201ENST00000262643 IQCA1LA6NCM1 817 aa26.75■■□□□ 1.87
CCNE1-201ENST00000262643 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
CCNE1-201ENST00000262643 KIF16BQ96L93 1317 aa26.74■■□□□ 1.87
CCNE1-201ENST00000262643 DBNDD1Q9H9R9 158 aa26.74■■□□□ 1.87
CCNE1-201ENST00000262643 UTYO14607 1347 aa26.74■■□□□ 1.87
CCNE1-201ENST00000262643 CXCL9Q07325 125 aa26.73■■□□□ 1.87
CCNE1-201ENST00000262643 KAZALD1Q96I82 304 aa26.73■■□□□ 1.87
CCNE1-201ENST00000262643 CRBNQ96SW2 442 aa26.73■■□□□ 1.87
CCNE1-201ENST00000262643 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
CCNE1-201ENST00000262643 RAD17O75943 681 aa26.73■■□□□ 1.87
CCNE1-201ENST00000262643 USP44Q9H0E7 712 aa26.73■■□□□ 1.87
CCNE1-201ENST00000262643 DOK7Q18PE1 504 aa26.72■■□□□ 1.87
CCNE1-201ENST00000262643 CCDC57Q2TAC2 916 aa26.72■■□□□ 1.87
CCNE1-201ENST00000262643 SCN4AP35499 1836 aa26.72■■□□□ 1.87
CCNE1-201ENST00000262643 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
CCNE1-201ENST00000262643 YDJCA8MPS7 323 aa26.72■■□□□ 1.87
CCNE1-201ENST00000262643 CCT4P50991 539 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
CCNE1-201ENST00000262643 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
CCNE1-201ENST00000262643 HACL1Q9UJ83 578 aa26.72■■□□□ 1.87
CCNE1-201ENST00000262643 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
CCNE1-201ENST00000262643 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
CCNE1-201ENST00000262643 CEP350Q5VT06 3117 aa26.71■■□□□ 1.87
CCNE1-201ENST00000262643 ATP2B4P23634 1241 aa26.7■■□□□ 1.87
CCNE1-201ENST00000262643 TAF7LQ5H9L4 462 aa26.7■■□□□ 1.87
CCNE1-201ENST00000262643 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.87
CCNE1-201ENST00000262643 G3V3G9 751 aa26.7■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 DCAF8Q5TAQ9 597 aa26.7■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 CIAPIN1Q6FI81 312 aa26.7■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 SMC1BQ8NDV3 1235 aa26.7■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 ECE2O60344 883 aa26.69■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 POTEIP0CG38 1075 aa26.69■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 POTEJP0CG39 1038 aa26.69■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 ARHGAP45Q92619 1136 aa26.69■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 EPHX2P34913 555 aa26.68■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 SCNN1DP51172 638 aa26.68■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 FSTL1Q12841 308 aa26.68■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 HSPA6P17066 643 aa26.67■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 CHRNDQ07001 517 aa26.67■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 TNIP1Q15025 636 aa26.67■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 ANKRD2Q9GZV1 360 aa26.66■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 EPS15P42566 896 aa26.66■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa26.66■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 ANKRD44Q8N8A2 993 aa26.66■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 KCNQ5Q9NR82 932 aa26.66■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 TRIM27P14373 513 aa26.65■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 TNNQ9UQP3 1299 aa26.65■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.65■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 CCDC136Q96JN2 1154 aa26.65■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 CNNM1Q9NRU3 951 aa26.65■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 TAF5LO75529 589 aa26.64■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.64■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 LEMD3Q9Y2U8 911 aa26.64■■□□□ 1.86
CCNE1-201ENST00000262643 ZNF804BA4D1E1 1349 aa26.63■■□□□ 1.85
CCNE1-201ENST00000262643 PSMD14O00487 310 aa26.63■■□□□ 1.85
CCNE1-201ENST00000262643 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
CCNE1-201ENST00000262643 KCNJ4P48050 445 aa26.63■■□□□ 1.85
CCNE1-201ENST00000262643 GPRC5DQ9NZD1 345 aa26.63■■□□□ 1.85
CCNE1-201ENST00000262643 CLEC11AQ9Y240 323 aa26.63■■□□□ 1.85
CCNE1-201ENST00000262643 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
CCNE1-201ENST00000262643 MED23Q9ULK4 1368 aa26.62■■□□□ 1.85
CCNE1-201ENST00000262643 SCN9AQ15858 1988 aa26.62■■□□□ 1.85
CCNE1-201ENST00000262643 SNAP23O00161 211 aa26.61■■□□□ 1.85
CCNE1-201ENST00000262643 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
CCNE1-201ENST00000262643 CHADLQ6NUI6 762 aa26.61■■□□□ 1.85
CCNE1-201ENST00000262643 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
CCNE1-201ENST00000262643 LDHDQ86WU2 507 aa26.61■■□□□ 1.85
CCNE1-201ENST00000262643 KLRK1P26718 216 aa26.61■■□□□ 1.85
CCNE1-201ENST00000262643 PDE3AQ14432 1141 aa26.61■■□□□ 1.85
CCNE1-201ENST00000262643 TXNRD3Q86VQ6 643 aa26.61■■□□□ 1.85
CCNE1-201ENST00000262643 PANK1Q8TE04 598 aa26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms