RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533897.1

CTSC-208, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 4,344 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-208	ENST00000533897	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	HMGB4	Q8WW32	186 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	ST8SIA4	Q92187	359 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	UCK1	Q9HA47	277 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	BEX1	Q9HBH7	125 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	KLHL1	Q9NR64	748 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	CYB5R1	Q9UHQ9	305 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		3.98	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897		A0A1W2PQD3	144 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	URAD	A6NGE7	173 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF432	O94892	652 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	TOX	O94900	526 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	CSF1	P09603	554 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	CD79A	P11912	226 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF35	P13682	527 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	YPEL5	P62699	121 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	BTG2	P78543	158 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	LEG1	Q6P5S2	330 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	PARG	Q86W56	976 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	GALNT16	Q8N428	558 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	OR1J4	Q8NGS1	313 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	STOML3	Q8TAV4	291 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	BAD	Q92934	168 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	SLC25A32	Q9H2D1	315 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	STARD5	Q9NSY2	213 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	C17orf51	A8MQB3	221 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	C2orf74	A8MZ97	194 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	PSMD9	O00233	223 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	SCAMP1	O15126	338 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	SSNA1	O43805	119 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	PRAMEF2	O60811	474 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	TSC22D2	O75157	780 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF217	O75362	1048 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	PNMT	P11086	282 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	WAS	P42768	502 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	INPP1	P49441	399 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	STX4	Q12846	297 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	UNC119	Q13432	240 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	KCNAB1	Q14722	419 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	SLC17A1	Q14916	467 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	MST1L	Q2TV78	715 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	LUZP2	Q86TE4	346 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	MARC2	Q969Z3	335 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	OMA1	Q96E52	524 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	OR10A5	Q9H207	317 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	DPP7	Q9UHL4	492 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	ATG2B	Q96BY7	2078 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897		A0A0A6YYH2	397 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	LOC100289279	A0A1B0GTE1	492 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	CPED1	A4D0V7	1026 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897		A6NJ64	397 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897		D6RAR5	112 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	SULT2B1	O00204	365 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	MSTN	O14793	375 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	SSX5	O60225	188 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	ALOX12B	O75342	701 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	IGLV3-1	P01715	115 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	CD3D	P04234	171 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	IFNA16	P05015	189 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	APOD	P05090	189 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	FAM157C	P0CG43	387 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	MGMT	P16455	207 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	NTSR1	P30989	418 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	TMEM225	Q6GV28	225 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	TMEM205	Q6UW68	189 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		3.97	□□□□□ -1.77
CTSC-208	ENST00000533897	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		3.97	□□□□□ -1.77

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