RNA–Protein interactions for RNA: YPR172W

YPR172W, Transcript of Putative pyridoxal 5'-phosphate synthase, yeast

Gene YPR172W, Length 603 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YPR172W	YPR172W	PRC1	P00729	532 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YPR172W	YPR172W	MTH1	P35198	433 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YPR172W	YPR172W	SPC42	P36094	363 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YPR172W	YPR172W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YPR172W	YPR172W	PZF1	P39933	429 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YPR172W	YPR172W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YPR172W	YPR172W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YPR172W	YPR172W	FLC1	Q08967	793 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YPR172W	YPR172W	TOM70	P07213	617 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YPR172W	YPR172W	SAP190	P36123	1033 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YPR172W	YPR172W	SAK1	P38990	1142 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YPR172W	YPR172W	AMA1	P50082	593 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YPR172W	YPR172W	TAD1	P53065	400 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YPR172W	YPR172W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YPR172W	YPR172W	CRR1	Q05790	422 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YPR172W	YPR172W	ADY4	Q05955	493 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YPR172W	YPR172W	YCL002C	P25565	263 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	YHL017W	P38745	532 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	SDS3	P40505	327 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	GYP8	P43570	497 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	ALG2	P43636	503 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	SSY5	P47002	699 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	ATP25	Q03153	612 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	YBR053C	P38235	358 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	THI21	Q08975	551 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	YLR415C	O13578	112 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	GAL11	P19659	1081 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	BET3	P36149	193 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	ATF1	P40353	525 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	PFA3	P42836	336 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	YJL163C	P46996	555 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	NRG1	Q03125	231 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	RSC3	Q06639	885 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	CAN1	P04817	590 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	SIC1	P38634	284 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	YIR042C	P40586	236 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	HUL5	P53119	910 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	BDF2	Q07442	638 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	ZDS1	P50111	915 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	RIA1	P53893	1110 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	ATG11	Q12527	1178 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	STI1	P15705	589 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.53	□□□□□ -1.68	not detected
YPR172W	YPR172W	SPC29	P33419	253 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	PCL5	P38794	229 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	SHR5	P41912	237 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	IRC13	Q08630	104 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	MET7	Q08645	548 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		4.53	□□□□□ -1.68
YPR172W	YPR172W	YBR259W	P38338	688 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	NNF1	P47149	201 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	RTA1	P53047	317 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	ZIP2	P53061	704 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	TGL5	Q12043	749 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	GPR1	Q12361	961 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	DIF1	O13577	133 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	PHR1	P05066	565 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.51	□□□□□ -1.69	not detected
YPR172W	YPR172W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	ECM1	P39715	212 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	HXT16	P47185	567 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	ASM4	Q05166	528 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	NSE3	Q05541	303 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	TDP1	P38319	544 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	SGO1	Q08490	590 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	PER1	P25625	357 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	FMP52	P40008	231 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.49	□□□□□ -1.69	not detected
YPR172W	YPR172W	PEX2	P32800	271 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	BCD1	P38772	366 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	HOS4	P40480	1083 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	BAP3	P41815	604 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	ALY2	P47029	1046 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	YBP2	P53169	641 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	GAD1	Q04792	585 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	SUT2	Q12286	268 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	YOR131C	Q12486	218 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	CDC43	P18898	376 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	KIN3	P22209	435 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	TY4A-J	P47023	414 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	UBC11	P52492	156 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	YAP1802	P53309	568 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YPR172W	YPR172W	PPZ2	P33329	710 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YPR172W	YPR172W	GDH3	P39708	457 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YPR172W	YPR172W	TEL2	P53038	688 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YPR172W	YPR172W	SSL2	Q00578	843 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YPR172W	YPR172W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7

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