RNA–Protein interactions for RNA: YOL005C

RPB11, Transcript of RNA polymerase II subunit B12.5, yeastyeast

Gene RPB11, Length 363 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPB11YOL005C HLJ1P48353 224 aa3.4□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C NCS6P53088 359 aa3.4□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C DNM1P54861 757 aa3.4□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C UTP14Q04500 899 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C YKL222CP35995 705 aa3.39□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C MCD4P36051 919 aa3.39□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C CTF8P38877 133 aa3.39□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C MSS4P38994 779 aa3.39□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C PZF1P39933 429 aa3.39□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C VHR1P40522 640 aa3.39□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C YJR142WP47173 342 aa3.39□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C MNN10P50108 393 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C NPY1P53164 384 aa3.39□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C SDA1P53313 767 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C YNL193WP53870 558 aa3.39□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C SNP1Q00916 300 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C PEX19Q07418 342 aa3.39□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C YBR182C-AQ8TGU6 64 aa3.39□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C RPL8AP17076 256 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C KAR4P25583 335 aa3.38□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C SEC21P32074 935 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C SHM2P37291 469 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C FLR1P38124 548 aa3.38□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C CAF16P43569 289 aa3.38□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C AIM14P53109 570 aa3.38□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C PKH1Q03407 766 aa3.38□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C CLU1Q03690 1277 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C NHX1Q04121 633 aa3.38□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C ESC8Q08119 714 aa3.38□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C FBP1P09201 348 aa3.37□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C PFK1P16861 987 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C SFL1P20134 766 aa3.37□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C HOG1P32485 435 aa3.37□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C STE14P32584 239 aa3.37□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C HXT16P47185 567 aa3.37□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C UBC9P50623 157 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C ZIP2P53061 704 aa3.37□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C YDR338CQ05497 695 aa3.37□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C Q0142Q9ZZW4 58 aa3.37□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C STE11P23561 717 aa3.36□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C HCM1P25364 564 aa3.36□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C PCL2P25693 308 aa3.36□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C CTS1P29029 562 aa3.36□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C NGG1P32494 702 aa3.36□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C HSL7P38274 827 aa3.36□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C CRP1P38845 465 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C TAF1P46677 1066 aa3.36□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C PHO23P50947 330 aa3.36□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C GUP2Q08929 609 aa3.36□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C THI21Q08975 551 aa3.36□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C YKR051WP36142 418 aa3.35□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C RPP1P38786 293 aa3.35□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C GIP4P39732 760 aa3.35□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C PFA3P42836 336 aa3.35□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C EXG2P52911 562 aa3.35□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C MET13P53128 600 aa3.35□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C YBP2P53169 641 aa3.35□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C ASI2P53895 289 aa3.35□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C MUS81Q04149 632 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C ASM4Q05166 528 aa3.35□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C RPN7Q06103 429 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C GIN4Q12263 1142 aa3.35□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C NUP145P49687 1317 aa3.35□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C TUB3P09734 445 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C HMG1P12683 1054 aa3.34□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C FKH2P41813 862 aa3.34□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C BNA2P47125 453 aa3.34□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C ORC4P54791 529 aa3.34□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C ATG33Q06485 197 aa3.34□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C GUD1Q07729 489 aa3.34□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C YLR001CQ07895 862 aa3.34□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C AIM39Q08223 395 aa3.34□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C TRM11Q12463 433 aa3.34□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C YLR149CQ99296 730 aa3.34□□□□□ -1.87
RPB11YOL005C YLR415CO13578 112 aa3.33□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C PRP4P20053 465 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data3.33□□□□□ -1.88not detected
RPB11YOL005C CTF13P35203 478 aa3.33□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C PCM1P38628 557 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C DOS2P54858 310 aa3.33□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C SLU7Q02775 382 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C NRG1Q03125 231 aa3.33□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C THI73Q07904 523 aa3.33□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C TSR4P25040 408 aa3.32□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C HRR25P29295 494 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C DCG1P32460 244 aa3.32□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C PRP19P32523 503 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C YEL1P34225 687 aa3.32□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C TYS1P36421 394 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C PRP31P49704 494 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C YNR029CP53729 429 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C UME1Q03010 460 aa3.32□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C ENB1Q08299 606 aa3.32□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C FAP7Q12055 197 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C NTO1Q12311 748 aa3.32□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C LAS17Q12446 633 aa3.32□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C TUB2P02557 457 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C PMA1P05030 918 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C MET3P08536 511 aa3.31□□□□□ -1.88
RPB11YOL005C MIH1P23748 554 aa3.31□□□□□ -1.88
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