RNA–Protein interactions for RNA: YOL004W

SIN3, Transcript of Component of both the Rpd3S and Rpd3L histone deacetylase complexes, yeastyeast

Gene SIN3, Length 4,611 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SIN3YOL004W ALE1Q08548 619 aa3.25□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W CIR2Q08822 631 aa3.25□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W NHA1Q99271 985 aa3.25□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W TRS33Q99394 268 aa3.25□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W MET1P36150 593 aa3.24□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W PIK1P39104 1066 aa3.24□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W ALG2P43636 503 aa3.24□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W NUT1P53114 1132 aa3.24□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W ZPR1P53303 486 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W NUP116Q02630 1113 aa3.24□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W HPF1Q05164 967 aa3.24□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W NOC3Q07896 663 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W KTR1P27810 393 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W GCD6P32501 712 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W BCS1P32839 456 aa3.24□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W SLN1P39928 1220 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W ISM1P48526 1002 aa3.24□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W SRX1P36077 127 aa3.24□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W YFL034WP43564 1073 aa3.24□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W PEX14P53112 341 aa3.24□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W YOL057WQ08225 711 aa3.24□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W KEL3Q08979 651 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W FAB1P34756 2278 aa3.24□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W PDA1P16387 420 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W PGS1P25578 521 aa3.24□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W POL12P38121 705 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W SMF1P38925 575 aa3.24□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W BTT1P40314 149 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W RSM25P40496 264 aa3.24□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W ACF4P47129 309 aa3.24□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W PRO2P54885 456 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W VIP1Q06685 1146 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W YOR238WQ08634 303 aa3.24□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W APC11Q12157 165 aa3.24□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W RME1P32338 300 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W TYE7P33122 291 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W TAF14P35189 244 aa3.23□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W BLI1P35727 113 aa3.23□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W RIM21P48565 533 aa3.23□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W MRX10Q05648 414 aa3.23□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W PNP1Q05788 311 aa3.23□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W FYV10P40492 516 aa3.23□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W YDL121CQ07541 149 aa3.23□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W APL5Q08951 932 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W OSW2Q12202 724 aa3.23□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W SLA1P32790 1244 aa3.23□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W ESF2P53743 316 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W ALF1P53904 254 aa3.23□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W GPD1Q00055 391 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W YDR541CQ03049 344 aa3.23□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W WTM2Q12206 467 aa3.23□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W ATG11Q12527 1178 aa3.23□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W CYB2P00175 591 aa3.23□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W SSH4P32343 579 aa3.23□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W SKI2P35207 1287 aaKnown RBP RIP-Chip data3.23□□□□□ -1.89not detected
SIN3YOL004W KDX1P36005 433 aa3.23□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W SAK1P38990 1142 aa3.23□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W OSW5P40219 148 aa3.23□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W OPT1P40897 799 aa3.23□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W VTC2P43585 828 aa3.23□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W ATG36P46983 293 aa3.23□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W MDE1P47095 244 aa3.23□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W NAM8Q00539 523 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W YPR109WQ06104 294 aa3.23□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W CLP1Q08685 445 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W PUS1Q12211 544 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W PCD1Q12524 340 aa3.23□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W FRS2P15625 503 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W ADK2P26364 225 aa3.22□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W YHR078WP38799 552 aa3.22□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W BPL1P48445 690 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W SCY1P53009 804 aa3.22□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W YDR090CQ03193 310 aa3.22□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W DIN7Q12086 430 aa3.22□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W MTF1P14908 341 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W SLY41P22215 453 aa3.22□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W UTR4P32626 227 aa3.22□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W SPC97P38863 823 aa3.22□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W YEL025CP39991 1188 aa3.22□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W ASE1P50275 885 aa3.22□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W THI3Q07471 609 aa3.22□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W ALR1Q08269 859 aa3.22□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W YLR125WQ12138 136 aa3.22□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W CIT2P08679 460 aa3.22□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W YCP4P25349 247 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W ATG12P38316 186 aa3.22□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W APC5Q08683 685 aa3.22□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W PRE9P23638 258 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W MEF1P25039 761 aa3.21□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W PHO87P25360 923 aa3.21□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W MRC1P25588 1096 aa3.21□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W CCR4P31384 837 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W RPN12P32496 274 aa3.21□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W VPS8P39702 1274 aa3.21□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W SAM37P50110 327 aa3.21□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data3.21□□□□□ -1.89not detected
SIN3YOL004W NAN1Q02931 896 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W YET2Q04210 160 aa3.21□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W MCM16Q12262 181 aa3.21□□□□□ -1.89
SIN3YOL004W ATE1P16639 503 aa3.21□□□□□ -1.9
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