RNA–Protein interactions for RNA: YMR088C

VBA1, Transcript of Permease of basic amino acids in the vacuolar membrane, yeast

Gene VBA1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VBA1	YMR088C	SRL3	P36167	246 aa		5.83	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.83	□□□□□ -1.48	not detected
VBA1	YMR088C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	NDE1	P40215	560 aa		5.83	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	YFL034W	P43564	1073 aa		5.83	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	MON1	P53129	644 aa		5.83	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	YNL193W	P53870	558 aa		5.83	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	GCR2	Q01722	534 aa		5.83	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	MMR1	Q06324	491 aa		5.83	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	YDL124W	Q07551	312 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	ICL2	Q12031	575 aa		5.83	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	DSF1	P0CX08	502 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	YNR073C	P0CX09	502 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	RAD4	P14736	754 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	MSH1	P25846	959 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	FBP26	P32604	452 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	PEP7	P32609	515 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	CNS1	P33313	385 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	CPR5	P35176	225 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	YKL222C	P35995	705 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	YEN1	P40028	759 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	YIL166C	P40445	542 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	YIL092W	P40497	633 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	INA22	P40576	216 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	CEP3	P40969	608 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	XKS1	P42826	600 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	BNA6	P43619	295 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	MNP1	P53163	194 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	PEX8	P53248	589 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	RPM2	Q02773	1202 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	ISU1	Q03020	165 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	BUL2	Q03758	920 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	CWC15	Q03772	175 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	HED1	Q03937	162 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	MGR3	Q04472	501 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	MCP2	Q06567	569 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	RTT10	Q08924	1013 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	LAP2	Q10740	671 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	TFB1	P32776	642 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	MKS1	P34072	584 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	YHL012W	P38709	493 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	PCL7	P40186	285 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	RET3	P53600	189 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	VPS36	Q06696	566 aa		5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	RDS1	P25611	832 aa		5.81	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	UTP11	P34247	250 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	POP7	P38291	140 aa		5.81	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	PEX32	P38292	413 aa		5.81	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	MNN1	P39106	762 aa		5.81	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	BDH2	P39713	417 aa		5.81	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	ZIP2	P53061	704 aa		5.81	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	HOT1	Q03213	719 aa		5.81	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	UTP14	Q04500	899 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	IVY1	Q04934	453 aa		5.81	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	DCS1	Q06151	350 aa		5.81	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	EAF1	Q06337	982 aa		5.81	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	BUG1	Q12191	341 aa		5.81	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	YKL068W-A	Q3E826	78 aa		5.81	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	STF1	P01098	86 aa		5.8	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	ARG81	P05085	880 aa		5.8	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	CDC16	P09798	840 aa		5.8	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	STV1	P37296	890 aa		5.8	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	YBL086C	P38177	466 aa		5.8	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	YJR061W	P40355	935 aa		5.8	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	VID28	P40547	921 aa		5.8	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	TOM22	P49334	152 aa		5.8	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	STB4	P50104	949 aa		5.8	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	LSB1	P53281	241 aa		5.8	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	ESBP6	P53918	673 aa		5.8	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	INA17	Q02888	182 aa		5.8	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	SND1	Q04007	877 aa		5.8	□□□□□ -1.48
VBA1	YMR088C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 50.3 ms