RNA–Protein interactions for RNA: YLL053C

YLL053C, Transcript of Putative protein, yeast

Gene YLL053C, Length 459 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLL053C	YLL053C	VAC14	Q06708	880 aa		11.94	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	SHS1	Q07657	551 aa		11.94	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	YLR001C	Q07895	862 aa		11.94	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	SIL1	Q08199	421 aa		11.94	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	11.94	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	ZPS1	Q12512	249 aa		11.94	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	LAA1	P39526	2014 aa		11.93	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	CDC42	P19073	191 aa		11.93	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	SWI3	P32591	825 aa		11.93	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	TRZ1	P36159	838 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	MMS4	P38257	691 aa		11.93	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	FTR1	P40088	404 aa		11.93	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	11.93	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	CPR7	P47103	393 aa		11.93	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	VPS70	P47161	811 aa		11.93	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	CLA4	P48562	842 aa		11.93	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	11.93	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	SRB4	P32569	687 aa		11.92	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	MRX3	P38172	270 aa		11.92	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	TCD1	P38756	429 aa		11.92	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	NDC80	P40460	691 aa		11.92	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	CEP3	P40969	608 aa		11.92	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	DAS1	P47005	663 aa		11.92	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	NGL3	Q03210	505 aa		11.92	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	PPM1	Q04081	328 aa		11.92	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	GIS3	Q12418	502 aa		11.92	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	PET111	P08468	800 aa		11.91	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	CKI1	P20485	582 aa		11.91	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	DUR3	P33413	735 aa		11.91	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	VPS60	Q03390	229 aa		11.91	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	MAM3	Q12296	706 aa		11.91	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	COX4	P04037	155 aa		11.9	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	SPT2	P06843	333 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	SCJ1	P25303	377 aa		11.9	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	DAL2	P25335	343 aa		11.9	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	CBF2	P32504	956 aa		11.9	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	YGR021W	P53212	290 aa		11.9	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	VPS72	Q03388	795 aa		11.9	□□□□□ -0.5
YLL053C	YLL053C	ASP3-2	P0CX77	362 aa		11.89	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	ASP3-3	P0CX78	362 aa		11.89	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	ASP3-4	P0CX79	362 aa		11.89	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		11.89	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	ERG11	P10614	530 aa		11.89	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	STE11	P23561	717 aa		11.89	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	CSG2	P35206	410 aa		11.89	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	YKL050C	P35736	922 aa		11.89	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	EXO5	P38289	585 aa		11.89	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	STE20	Q03497	939 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	GLN3	P18494	730 aa		11.88	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	PRR1	P28708	518 aa		11.88	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	PAH1	P32567	862 aa		11.88	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	ULI1	P43604	169 aa		11.88	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	AZR1	P50080	613 aa		11.88	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	VPS62	P53285	467 aa		11.88	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	BTN2	P53286	410 aa		11.88	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	MUK1	Q02866	612 aa		11.88	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	RRT12	P25381	491 aa		11.87	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	DPB3	P27344	201 aa		11.87	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	11.87	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	SMF1	P38925	575 aa		11.87	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	BUD16	P39988	312 aa		11.87	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	ABP140	Q08641	628 aa	Known RBP	11.87	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	SFI1	Q12369	946 aa		11.87	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		11.87	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	TRM2	P33753	639 aa		11.86	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	PTC4	P38089	393 aa		11.86	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	ECM3	Q99252	613 aa		11.86	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	RPT1	P33299	467 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	BCH2	P36122	765 aa		11.85	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	UIP5	P36137	443 aa		11.85	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	DYS1	P38791	387 aa		11.85	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	TVP23	P38962	199 aa		11.85	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	YTA12	P40341	825 aa		11.85	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	LAM5	P43560	674 aa		11.85	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	PHO86	P46956	311 aa		11.85	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	KAP114	P53067	1004 aa		11.85	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	YMR018W	Q04364	514 aa		11.85	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
YLL053C	YLL053C	YEL043W	P32618	956 aa		11.84	□□□□□ -0.51

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 83.9 ms