RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	NCL1	P38205	684 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	YHR218W	P38899	603 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	DLD3	P39976	496 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	VHR1	P40522	640 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	GYP8	P43570	497 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	VPS53	P47061	822 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	YGR283C	P53336	341 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	TIM50	Q02776	476 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	LCD1	Q04377	747 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	RGA2	Q06407	1009 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	LAP2	Q10740	671 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	SNT2	P53127	1403 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	LEU1	P07264	779 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	YBL086C	P38177	466 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	RRF1	P38771	230 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	RIC1	P40395	1056 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	YIL166C	P40445	542 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	PCL10	P53124	433 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	ATP25	Q03153	612 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	HLR1	Q04429	423 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	DPH2	P32461	534 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	XRS2	P33301	854 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	HXT7	P39004	570 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	POP2	P39008	433 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	AXL1	P40851	1208 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	HNT2	P49775	206 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	ZIP2	P53061	704 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
SYF1	YDR416W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	DAL7	P21826	554 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	RPC53	P25441	422 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	RGA1	P39083	1007 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	YTA6	P40328	754 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	VHS3	Q08438	674 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	RED1	P14291	827 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	ADD66	P36040	267 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	MXR1	P40029	184 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	SMK1	P41808	388 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	ASK10	P48361	1146 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	TIM10	P87108	93 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	ADY3	Q07732	790 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	WSC3	Q12215	556 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	KCS1	Q12494	1050 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SYF1	YDR416W	SEM1	O94742	89 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	ADE8	P04161	214 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	SLC1	P33333	303 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	CCZ1	P38273	704 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	TDA3	P38758	523 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	MAM1	P40065	302 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	GNT1	Q12096	491 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	APM4	Q99186	491 aa		4.59	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	TRK1	P12685	1235 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	AFR1	P33304	620 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	YKL077W	P36081	392 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	TOK1	P40310	691 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	JJJ2	P46997	583 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	DAM1	P53267	343 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	BNI4	P53858	892 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	HFI1	Q12060	488 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	ARP7	Q12406	477 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	NGG1	P32494	702 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	YRO2	P38079	344 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	YEL068C	P39977	110 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	SKP1	P52286	194 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	TAD1	P53065	400 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	CUS1	Q02554	436 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	NHX1	Q04121	633 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	MET7	Q08645	548 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	CEX1	Q12453	761 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	YPR015C	Q12531	247 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	DNF3	Q12674	1656 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	MTF2	P10849	440 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	PDX1	P16451	410 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	ORC2	P32833	620 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	EMC3	P36039	253 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SYF1	YDR416W	BYE1	P36106	594 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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