RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

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Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 LAMB2P55268 1798 aa28.51■■■□□ 2.15
SYT6-210ENST00000641643 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
SYT6-210ENST00000641643 TMC4Q7Z404 712 aa28.5■■■□□ 2.15
SYT6-210ENST00000641643 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
SYT6-210ENST00000641643 CDCA7LQ96GN5 454 aa28.5■■■□□ 2.15
SYT6-210ENST00000641643 CCDC152Q4G0S7 254 aa28.5■■■□□ 2.15
SYT6-210ENST00000641643 TIAM2Q8IVF5 1701 aa28.49■■■□□ 2.15
SYT6-210ENST00000641643 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
SYT6-210ENST00000641643 JDP2Q8WYK2 163 aa28.49■■■□□ 2.15
SYT6-210ENST00000641643 CDHR2Q9BYE9 1310 aa28.49■■■□□ 2.15
SYT6-210ENST00000641643 LINS1Q8NG48 757 aa28.48■■■□□ 2.15
SYT6-210ENST00000641643 SNED1Q8TER0 1413 aa28.47■■■□□ 2.15
SYT6-210ENST00000641643 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
SYT6-210ENST00000641643 F6X3S4 739 aa28.46■■■□□ 2.15
SYT6-210ENST00000641643 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
SYT6-210ENST00000641643 SLC51AQ86UW1 340 aa28.46■■■□□ 2.15
SYT6-210ENST00000641643 MPNDQ8N594 471 aa28.46■■■□□ 2.15
SYT6-210ENST00000641643 SUPT20HQ8NEM7 779 aa28.46■■■□□ 2.15
SYT6-210ENST00000641643 TOMM70O94826 608 aa28.45■■■□□ 2.15
SYT6-210ENST00000641643 GCKRQ14397 625 aa28.45■■■□□ 2.15
SYT6-210ENST00000641643 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa28.45■■■□□ 2.15
SYT6-210ENST00000641643 LARGE2Q8N3Y3 721 aa28.45■■■□□ 2.15
SYT6-210ENST00000641643 RPS8P62241 208 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
SYT6-210ENST00000641643 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
SYT6-210ENST00000641643 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
SYT6-210ENST00000641643 H7C1W4 665 aa28.43■■■□□ 2.14
SYT6-210ENST00000641643 PPIP5K2O43314 1243 aa28.42■■■□□ 2.14
SYT6-210ENST00000641643 DDNO94850 711 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
SYT6-210ENST00000641643 CTSWP56202 376 aa28.42■■■□□ 2.14
SYT6-210ENST00000641643 SEC31BQ9NQW1 1179 aa28.42■■■□□ 2.14
SYT6-210ENST00000641643 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
SYT6-210ENST00000641643 VPS33BQ9H267 617 aa28.41■■■□□ 2.14
SYT6-210ENST00000641643 BEND3Q5T5X7 828 aa28.41■■■□□ 2.14
SYT6-210ENST00000641643 SLC4A10Q6U841 1118 aa28.41■■■□□ 2.14
SYT6-210ENST00000641643 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
SYT6-210ENST00000641643 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
SYT6-210ENST00000641643 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
SYT6-210ENST00000641643 TAF1P21675 1872 aa28.4■■■□□ 2.14
SYT6-210ENST00000641643 FZD9O00144 591 aa28.4■■■□□ 2.14
SYT6-210ENST00000641643 EIF6P56537 245 aaKnown RBP28.4■■■□□ 2.14
SYT6-210ENST00000641643 NIM1KQ8IY84 436 aa28.4■■■□□ 2.14
SYT6-210ENST00000641643 SSH1Q8WYL5 1049 aa28.4■■■□□ 2.14
SYT6-210ENST00000641643 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
SYT6-210ENST00000641643 AOC3Q16853 763 aa28.38■■■□□ 2.13
SYT6-210ENST00000641643 TTLL11Q8NHH1 800 aa28.38■■■□□ 2.13
SYT6-210ENST00000641643 ALDH1L2Q3SY69 923 aa28.37■■■□□ 2.13
SYT6-210ENST00000641643 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa28.37■■■□□ 2.13
SYT6-210ENST00000641643 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
SYT6-210ENST00000641643 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
SYT6-210ENST00000641643 BCL2L13Q9BXK5 485 aa28.37■■■□□ 2.13
SYT6-210ENST00000641643 ZNF541Q9H0D2 1346 aa28.37■■■□□ 2.13
SYT6-210ENST00000641643 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP28.37■■■□□ 2.13
SYT6-210ENST00000641643 PLA2G12BQ9BX93 195 aa28.37■■■□□ 2.13
SYT6-210ENST00000641643 PTPRCP08575 1304 aa28.36■■■□□ 2.13
SYT6-210ENST00000641643 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa28.36■■■□□ 2.13
SYT6-210ENST00000641643 SMC4Q9NTJ3 1288 aa28.36■■■□□ 2.13
SYT6-210ENST00000641643 GREM2Q9H772 168 aa28.35■■■□□ 2.13
SYT6-210ENST00000641643 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
SYT6-210ENST00000641643 IQCA1LA6NCM1 817 aa28.34■■■□□ 2.13
SYT6-210ENST00000641643 ALDH1L1O75891 902 aa28.34■■■□□ 2.13
SYT6-210ENST00000641643 CASP7P55210 303 aa28.34■■■□□ 2.13
SYT6-210ENST00000641643 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa28.34■■■□□ 2.13
SYT6-210ENST00000641643 WDR90Q96KV7 1748 aa28.34■■■□□ 2.13
SYT6-210ENST00000641643 POTECB2RU33 542 aa28.33■■■□□ 2.13
SYT6-210ENST00000641643 C6orf229H3BNL8 230 aa28.33■■■□□ 2.13
SYT6-210ENST00000641643 GPSM2P81274 684 aa28.33■■■□□ 2.13
SYT6-210ENST00000641643 KIAA2012Q0VF49 1180 aa28.33■■■□□ 2.13
SYT6-210ENST00000641643 GPC2Q8N158 579 aa28.33■■■□□ 2.13
SYT6-210ENST00000641643 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP28.33■■■□□ 2.12
SYT6-210ENST00000641643 GJA3Q9Y6H8 435 aa28.33■■■□□ 2.12
SYT6-210ENST00000641643 GRM8O00222 908 aa28.32■■■□□ 2.12
SYT6-210ENST00000641643 WASHC4Q2M389 1173 aa28.32■■■□□ 2.12
SYT6-210ENST00000641643 ZNRF3Q9ULT6 936 aa28.32■■■□□ 2.12
SYT6-210ENST00000641643 RTL9Q8NET4 1388 aa28.31■■■□□ 2.12
SYT6-210ENST00000641643 FSTL1Q12841 308 aa28.31■■■□□ 2.12
SYT6-210ENST00000641643 EYA3Q99504 573 aa28.31■■■□□ 2.12
SYT6-210ENST00000641643 MYH3P11055 1940 aa28.3■■■□□ 2.12
SYT6-210ENST00000641643 LRRC37AA6NMS7 1700 aa28.3■■■□□ 2.12
SYT6-210ENST00000641643 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
SYT6-210ENST00000641643 SMC1BQ8NDV3 1235 aa28.3■■■□□ 2.12
SYT6-210ENST00000641643 COL4A1P02462 1669 aa28.3■■■□□ 2.12
SYT6-210ENST00000641643 COL4A5P29400 1685 aa28.3■■■□□ 2.12
SYT6-210ENST00000641643 HSPA6P17066 643 aa28.29■■■□□ 2.12
SYT6-210ENST00000641643 ITGA6P23229 1130 aa28.29■■■□□ 2.12
SYT6-210ENST00000641643 PODXL2Q9NZ53 605 aa28.29■■■□□ 2.12
SYT6-210ENST00000641643 POLLQ9UGP5 575 aa28.29■■■□□ 2.12
SYT6-210ENST00000641643 CSF1RP07333 972 aa28.28■■■□□ 2.12
SYT6-210ENST00000641643 FAM161AQ3B820 660 aa28.28■■■□□ 2.12
SYT6-210ENST00000641643 TBC1D16Q8TBP0 767 aa28.28■■■□□ 2.12
SYT6-210ENST00000641643 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
SYT6-210ENST00000641643 HACL1Q9UJ83 578 aa28.28■■■□□ 2.12
SYT6-210ENST00000641643 CHMP3Q9Y3E7 222 aa28.28■■■□□ 2.12
SYT6-210ENST00000641643 GGA1Q9UJY5 639 aa28.28■■■□□ 2.12
SYT6-210ENST00000641643 RIMBP2O15034 1052 aa28.27■■■□□ 2.12
SYT6-210ENST00000641643 UFL1O94874 794 aa28.27■■■□□ 2.12
SYT6-210ENST00000641643 XDHP47989 1333 aa28.26■■■□□ 2.11
SYT6-210ENST00000641643 MPHOSPH8Q99549 860 aa28.26■■■□□ 2.11
SYT6-210ENST00000641643 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
SYT6-210ENST00000641643 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa28.25■■■□□ 2.11
SYT6-210ENST00000641643 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
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