RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619023.4

AKAP9-216, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, human

TSL 5 BASIC

Gene AKAP9, Length 6,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP9-216	ENST00000619023	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	TET3	O43151	1660 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	NLRP5	P59047	1200 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	BIN1	O00499	593 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	TNNT1	P13805	278 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	TMC6	Q7Z403	805 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	LINS1	Q8NG48	757 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	PATL2	C9JE40	543 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	MICU3	Q86XE3	530 aa		13.17	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	CHL1	O00533	1208 aa		13.17	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	GSDMD	P57764	484 aa		13.17	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		13.17	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	IQCE	Q6IPM2	695 aa		13.17	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		13.17	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		13.17	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		13.17	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		13.17	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	KIF18A	Q8NI77	898 aa		13.17	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		13.17	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	ZNF76	P36508	570 aa		13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	ZNF165	P49910	485 aa		13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	USP19	O94966	1318 aa		13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		13.16	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	AOX1	Q06278	1338 aa		13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	KCNA6	P17658	529 aa		13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	RAD50	Q92878	1312 aa		13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	ISM2	Q6H9L7	571 aa		13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	KRT23	Q9C075	422 aa		13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	GC	P02774	474 aa		13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	UBXN4	Q92575	508 aa		13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	PLEKHF1	Q96S99	279 aa		13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
AKAP9-216	ENST00000619023	ATP2B3	Q16720	1220 aa		13.15	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	13.15	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	13.14	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		13.14	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	UNC13B	O14795	1591 aa		13.14	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	CAVIN2	O95810	425 aa		13.14	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		13.14	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	KIF5C	O60282	957 aa		13.14	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		13.14	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	TBX22	Q9Y458	520 aa		13.14	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	TSG101	Q99816	390 aa		13.14	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	TMX1	Q9H3N1	280 aa		13.14	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		13.14	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	ABCC4	O15439	1325 aa		13.14	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	DCAF5	Q96JK2	942 aa		13.14	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	ALG1	Q9BT22	464 aa		13.14	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	CLTCL1	P53675	1640 aa		13.13	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		13.13	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		13.13	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	CLCN1	P35523	988 aa		13.13	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	WTAP	Q15007	396 aa		13.13	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		13.13	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	KIAA0232	Q92628	1395 aa		13.13	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	ERLIN2	O94905	339 aa		13.13	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		13.13	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		13.13	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	KAT14	Q9H8E8	782 aa		13.13	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		13.13	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	ZBTB43	O43298	467 aa		13.12	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	FAM193A	P78312	1265 aa		13.12	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	PDE4B	Q07343	736 aa		13.12	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	KANK3	Q6NY19	840 aa		13.12	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		13.12	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		13.12	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		13.12	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	IL2RB	P14784	551 aa		13.12	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	APOBR	Q0VD83	1088 aa		13.12	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	CEP135	Q66GS9	1140 aa		13.12	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	PRC1	O43663	620 aa		13.12	□□□□□ -0.31
AKAP9-216	ENST00000619023	KIF5B	P33176	963 aa		13.12	□□□□□ -0.31

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.9 ms