RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599471.5

USF2-211, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

TSL 3

Gene USF2, Length 1,173 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-211ENST00000599471 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.19■■□□□ 1.14
USF2-211ENST00000599471 ABCC4O15439 1325 aa22.19■■□□□ 1.14
USF2-211ENST00000599471 PLIN1O60240 522 aa22.18■■□□□ 1.14
USF2-211ENST00000599471 CASP7P55210 303 aa22.18■■□□□ 1.14
USF2-211ENST00000599471 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
USF2-211ENST00000599471 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
USF2-211ENST00000599471 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
USF2-211ENST00000599471 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
USF2-211ENST00000599471 OLFM4Q6UX06 510 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-211ENST00000599471 CRAMP1Q96RY5 1269 aa22.17■■□□□ 1.14
USF2-211ENST00000599471 SPEF2Q9C093 1822 aa22.16■■□□□ 1.14
USF2-211ENST00000599471 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
USF2-211ENST00000599471 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.16■■□□□ 1.14
USF2-211ENST00000599471 SUCLG2Q96I99 432 aa22.16■■□□□ 1.14
USF2-211ENST00000599471 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.16■■□□□ 1.14
USF2-211ENST00000599471 GRAPQ13588 217 aa22.15■■□□□ 1.14
USF2-211ENST00000599471 SLC51AQ86UW1 340 aa22.15■■□□□ 1.14
USF2-211ENST00000599471 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.15■■□□□ 1.14
USF2-211ENST00000599471 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
USF2-211ENST00000599471 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.14■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.14■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 PANK1Q8TE04 598 aa22.14■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 USP44Q9H0E7 712 aa22.14■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 GREM2Q9H772 168 aa22.14■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 RASSF7Q02833 373 aa22.13■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 FAM161AQ3B820 660 aa22.13■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.13■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 COL4A1P02462 1669 aa22.12■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 RLBP1P12271 317 aa22.12■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 FOXO4P98177 505 aa22.12■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 CCDC93Q567U6 631 aa22.12■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.12■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 MEIS3Q99687 375 aa22.12■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 CHD4Q14839 1912 aa22.12■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 UTYO14607 1347 aa22.1■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 BBOX1O75936 387 aa22.1■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 ITGA6P23229 1130 aa22.1■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.1■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 SOGA3Q5TF21 947 aa22.1■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.1■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 MS4A1P11836 297 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.09■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.08■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.08■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 KAZALD1Q96I82 304 aa22.08■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.08■■□□□ 1.13
USF2-211ENST00000599471 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
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USF2-211ENST00000599471 CSF1RP07333 972 aa22.07■■□□□ 1.12
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USF2-211ENST00000599471 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
USF2-211ENST00000599471 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.07■■□□□ 1.12
USF2-211ENST00000599471 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.07■■□□□ 1.12
USF2-211ENST00000599471 SP8Q8IXZ3 490 aa22.06■■□□□ 1.12
USF2-211ENST00000599471 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.06■■□□□ 1.12
USF2-211ENST00000599471 COG6Q9Y2V7 657 aa22.06■■□□□ 1.12
USF2-211ENST00000599471 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
USF2-211ENST00000599471 RTL9Q8NET4 1388 aa22.05■■□□□ 1.12
USF2-211ENST00000599471 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.05■■□□□ 1.12
USF2-211ENST00000599471 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.05■■□□□ 1.12
USF2-211ENST00000599471 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
USF2-211ENST00000599471 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.05■■□□□ 1.12
USF2-211ENST00000599471 RNF181Q9P0P0 153 aa22.05■■□□□ 1.12
USF2-211ENST00000599471 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.05■■□□□ 1.12
USF2-211ENST00000599471 SBF1O95248 1867 aa22.05■■□□□ 1.12
USF2-211ENST00000599471 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.04■■□□□ 1.12
USF2-211ENST00000599471 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.04■■□□□ 1.12
USF2-211ENST00000599471 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
USF2-211ENST00000599471 TMC4Q7Z404 712 aa22.04■■□□□ 1.12
USF2-211ENST00000599471 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
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USF2-211ENST00000599471 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.03■■□□□ 1.12
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USF2-211ENST00000599471 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.03■■□□□ 1.12
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USF2-211ENST00000599471 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
USF2-211ENST00000599471 GPSM2P81274 684 aa22.02■■□□□ 1.12
USF2-211ENST00000599471 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.02■■□□□ 1.12
USF2-211ENST00000599471 LMNB1P20700 586 aa22.01■■□□□ 1.11
USF2-211ENST00000599471 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
USF2-211ENST00000599471 C6orf229H3BNL8 230 aa22■■□□□ 1.11
USF2-211ENST00000599471 YY1P25490 414 aa22■■□□□ 1.11
USF2-211ENST00000599471 PRELPP51888 382 aa22■■□□□ 1.11
USF2-211ENST00000599471 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
USF2-211ENST00000599471 CNNM1Q9NRU3 951 aa22■■□□□ 1.11
USF2-211ENST00000599471 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
USF2-211ENST00000599471 KLHDC4Q8TBB5 520 aa21.99■■□□□ 1.11
USF2-211ENST00000599471 PDE3AQ14432 1141 aa21.98■■□□□ 1.11
USF2-211ENST00000599471 GRIPAP1Q4V328 841 aa21.98■■□□□ 1.11
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