RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 TBC1D32Q96NH3 1257 aa27.91■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 ECHDC1Q9NTX5 307 aa27.91■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 ERC2O15083 957 aa27.9■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 TFCP2Q12800 502 aa27.89■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 TNNI3KQ59H18 835 aa27.89■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa27.89■■■□□ 2.06
CAPNS1-207ENST00000589146 COL24A1Q17RW2 1714 aa27.88■■■□□ 2.05
CAPNS1-207ENST00000589146 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP27.88■■■□□ 2.05
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CAPNS1-207ENST00000589146 C4AP0C0L4 1744 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-207ENST00000589146 PLSCR1O15162 318 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-207ENST00000589146 USPL1Q5W0Q7 1092 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-207ENST00000589146 CASC1Q6TDU7 716 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-207ENST00000589146 UBR3Q6ZT12 1888 aa27.87■■■□□ 2.05
CAPNS1-207ENST00000589146 ZPR1O75312 459 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-207ENST00000589146 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
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CAPNS1-207ENST00000589146 AMIGO3Q86WK7 504 aa27.86■■■□□ 2.05
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
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CAPNS1-207ENST00000589146 ITGA6P23229 1130 aa27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC10A5Q5PT55 438 aa27.84■■■□□ 2.05
CAPNS1-207ENST00000589146 TBC1D9BQ66K14 1250 aa27.84■■■□□ 2.05
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CAPNS1-207ENST00000589146 TXNRD1Q16881 649 aa27.83■■■□□ 2.05
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CAPNS1-207ENST00000589146 PROM2Q8N271 834 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-207ENST00000589146 DDRGK1Q96HY6 314 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-207ENST00000589146 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-207ENST00000589146 C22orf23Q9BZE7 217 aa27.83■■■□□ 2.05
CAPNS1-207ENST00000589146 NYXQ9GZU5 481 aa27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-207ENST00000589146 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-207ENST00000589146 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-207ENST00000589146 SSFA2P28290 1259 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-207ENST00000589146 RFC4P35249 363 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-207ENST00000589146 RBM25P49756 843 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-207ENST00000589146 TAF7LQ5H9L4 462 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-207ENST00000589146 CNTROBQ8N137 903 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-207ENST00000589146 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-207ENST00000589146 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF609O15014 1411 aa27.81■■■□□ 2.04
CAPNS1-207ENST00000589146 ATP5JP18859 108 aa27.8■■■□□ 2.04
CAPNS1-207ENST00000589146 CHMLP26374 656 aa27.8■■■□□ 2.04
CAPNS1-207ENST00000589146 SETDB2Q96T68 719 aa27.8■■■□□ 2.04
CAPNS1-207ENST00000589146 CEP126Q9P2H0 1117 aa27.8■■■□□ 2.04
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CAPNS1-207ENST00000589146 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa27.8■■■□□ 2.04
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM177BA6PVY3 158 aa27.79■■■□□ 2.04
CAPNS1-207ENST00000589146 CCDC152Q4G0S7 254 aa27.79■■■□□ 2.04
CAPNS1-207ENST00000589146 RILPL2Q969X0 211 aa27.79■■■□□ 2.04
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CAPNS1-207ENST00000589146 AK9Q5TCS8 1911 aa27.79■■■□□ 2.04
CAPNS1-207ENST00000589146 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
CAPNS1-207ENST00000589146 AKAP2Q9Y2D5 859 aa27.78■■■□□ 2.04
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CAPNS1-207ENST00000589146 RIC1Q4ADV7 1423 aa27.77■■■□□ 2.04
CAPNS1-207ENST00000589146 ERFEQ4G0M1 354 aa27.77■■■□□ 2.04
CAPNS1-207ENST00000589146 EVI5LQ96CN4 794 aa27.77■■■□□ 2.04
CAPNS1-207ENST00000589146 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
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CAPNS1-207ENST00000589146 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa27.76■■■□□ 2.03
CAPNS1-207ENST00000589146 DBNDD2Q9BQY9 259 aa27.76■■■□□ 2.03
CAPNS1-207ENST00000589146 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa27.75■■■□□ 2.03
CAPNS1-207ENST00000589146 PHF14O94880 888 aa27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1-207ENST00000589146 REC8O95072 547 aa27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1-207ENST00000589146 TPTE2Q6XPS3 522 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-207ENST00000589146 BICDL1Q6ZP65 573 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-207ENST00000589146 VGLL2Q8N8G2 317 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-207ENST00000589146 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-207ENST00000589146 USP26Q9BXU7 913 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-207ENST00000589146 MROH5Q6ZUA9 1318 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-207ENST00000589146 A0A1B0GUL7 405 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-207ENST00000589146 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-207ENST00000589146 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-207ENST00000589146 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-207ENST00000589146 AKT1S1Q96B36 256 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-207ENST00000589146 CNNM1Q9NRU3 951 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-207ENST00000589146 CARMIL3Q8ND23 1372 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-207ENST00000589146 ABCC12Q96J65 1359 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-207ENST00000589146 TIMM10P62072 90 aa27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-207ENST00000589146 METTL24Q5JXM2 366 aa27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-207ENST00000589146 NFIXQ14938 502 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-207ENST00000589146 TICAM2Q86XR7 235 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-207ENST00000589146 NEUROD6Q96NK8 337 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-207ENST00000589146 HAUS7Q99871 368 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-207ENST00000589146 BOLA2Q9H3K6 86 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-207ENST00000589146 CASZ1Q86V15 1759 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-207ENST00000589146 GYS1P13807 737 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-207ENST00000589146 SEC31BQ9NQW1 1179 aa27.69■■■□□ 2.02
CAPNS1-207ENST00000589146 RFX7Q2KHR2 1363 aa27.69■■■□□ 2.02
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