RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 UBE4AQ14139 1066 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 DNAI2Q9GZS0 605 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 LIG1P18858 919 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 NOP2P46087 812 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 IDI1Q13907 227 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 NF2P35240 595 aa24.47■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 N4BP3O15049 544 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC175P0C221 793 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 ANXA1P04083 346 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC2Q9BYS8 371 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 CETN1Q12798 172 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 HOOK3Q86VS8 718 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 TRIM47Q96LD4 638 aa24.46■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP24.45■■□□□ 1.51
PTPRM-211ENST00000580170 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP24.45■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 RRAGBQ5VZM2 374 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 RMND1Q9NWS8 449 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 EHBP1Q8NDI1 1231 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 EXOC1Q9NV70 894 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 CTNNA2P26232 953 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 C8orf34Q49A92 452 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 TCEANC2Q96MN5 208 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.44■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 MYO1BO43795 1136 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 SKILP12757 684 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 SNX21Q969T3 373 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 FBLN1P23142 703 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 KCNG4Q8TDN1 519 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 AFMP43652 599 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 WTAPQ15007 396 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 FAM200AQ8TCP9 573 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 ALG1Q9BT22 464 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC186Q7Z3E2 898 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD44Q8N8A2 993 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 F13A1P00488 732 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 CHMP4BP1P59074 171 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 PRC1O43663 620 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 Q6ZUG5 572 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 ACEP12821 1306 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 IVLP07476 585 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC27Q9C0I9 530 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 ZBTB43O43298 467 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 CTAGE1Q96RT6 745 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 AOPEPQ8N6M6 819 aa24.41■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 BAG3O95817 575 aa24.4■■□□□ 1.5
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PTPRM-211ENST00000580170 HSF2BPO75031 334 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 KRT23Q9C075 422 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 DNAJC25Q9H1X3 360 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 DACT1Q9NYF0 836 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 SYCP3Q8IZU3 236 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 ANKRD24Q8TF21 1146 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 LDHCP07864 332 aa24.4■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 ATP8B2P98198 1209 aa24.39■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa24.39■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
PTPRM-211ENST00000580170 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 KRT28Q7Z3Y7 464 aa24.39■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 DNAI1Q9UI46 699 aa24.39■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 AKR1B10O60218 316 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 C6orf229H3BNL8 230 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 CEP63Q96MT8 703 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 RSPH14Q9UHP6 348 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 STAT6P42226 847 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 FERMT2Q96AC1 680 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 CEP112Q8N8E3 955 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.38■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 EXOC5O00471 708 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 STAMBPO95630 424 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 MMRN2Q9H8L6 949 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 CTAGE15A4D2H0 777 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 CTAGE8P0CG41 777 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRM-211ENST00000580170 CTAGE6Q86UF2 777 aa24.36■■□□□ 1.49
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