RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
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CCNDBP1-211ENST00000567434 KLRG1Q96E93 195 aa21.88■■□□□ 1.09
CCNDBP1-211ENST00000567434 VPS33BQ9H267 617 aa21.88■■□□□ 1.09
CCNDBP1-211ENST00000567434 HTRA3P83110 453 aa21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1-211ENST00000567434 SUPT20HQ8NEM7 779 aa21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1-211ENST00000567434 JDP2Q8WYK2 163 aa21.87■■□□□ 1.09
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CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF428Q96B54 188 aa21.86■■□□□ 1.09
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CCNDBP1-211ENST00000567434 IGKV5-2P06315 115 aa21.85■■□□□ 1.09
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CCNDBP1-211ENST00000567434 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
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CCNDBP1-211ENST00000567434 JMYQ8N9B5 988 aa21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-211ENST00000567434 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CCNDBP1-211ENST00000567434 IQCA1LA6NCM1 817 aa21.83■■□□□ 1.09
CCNDBP1-211ENST00000567434 CCDC152Q4G0S7 254 aa21.83■■□□□ 1.09
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CCNDBP1-211ENST00000567434 DNAAF4Q8WXU2 420 aa21.83■■□□□ 1.09
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCNTO95613 3336 aa21.83■■□□□ 1.08
CCNDBP1-211ENST00000567434 NEURL1BA8MQ27 555 aa21.82■■□□□ 1.08
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CCNDBP1-211ENST00000567434 MPNDQ8N594 471 aa21.82■■□□□ 1.08
CCNDBP1-211ENST00000567434 POTECB2RU33 542 aa21.81■■□□□ 1.08
CCNDBP1-211ENST00000567434 LINS1Q8NG48 757 aa21.81■■□□□ 1.08
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CCNDBP1-211ENST00000567434 PPIP5K2O43314 1243 aa21.8■■□□□ 1.08
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CCNDBP1-211ENST00000567434 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CCNDBP1-211ENST00000567434 GPC2Q8N158 579 aa21.8■■□□□ 1.08
CCNDBP1-211ENST00000567434 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
CCNDBP1-211ENST00000567434 ZNF541Q9H0D2 1346 aa21.8■■□□□ 1.08
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CCNDBP1-211ENST00000567434 TAF1P21675 1872 aa21.79■■□□□ 1.08
CCNDBP1-211ENST00000567434 H7C1W4 665 aa21.78■■□□□ 1.08
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CCNDBP1-211ENST00000567434 SLC51AQ86UW1 340 aa21.78■■□□□ 1.08
CCNDBP1-211ENST00000567434 COL4A5P29400 1685 aa21.78■■□□□ 1.08
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CCNDBP1-211ENST00000567434 KIAA2012Q0VF49 1180 aa21.77■■□□□ 1.08
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CCNDBP1-211ENST00000567434 MYH3P11055 1940 aa21.76■■□□□ 1.07
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CCNDBP1-211ENST00000567434 PLA2G12BQ9BX93 195 aa21.75■■□□□ 1.07
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CCNDBP1-211ENST00000567434 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.74■■□□□ 1.07
CCNDBP1-211ENST00000567434 TTLL11Q8NHH1 800 aa21.74■■□□□ 1.07
CCNDBP1-211ENST00000567434 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
CCNDBP1-211ENST00000567434 SEC31BQ9NQW1 1179 aa21.74■■□□□ 1.07
CCNDBP1-211ENST00000567434 PODXL2Q9NZ53 605 aa21.74■■□□□ 1.07
CCNDBP1-211ENST00000567434 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
CCNDBP1-211ENST00000567434 LTBP1Q14766 1721 aa21.73■■□□□ 1.07
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CCNDBP1-211ENST00000567434 EYA3Q99504 573 aa21.73■■□□□ 1.07
CCNDBP1-211ENST00000567434 COL4A1P02462 1669 aa21.72■■□□□ 1.07
CCNDBP1-211ENST00000567434 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
CCNDBP1-211ENST00000567434 CASP7P55210 303 aa21.72■■□□□ 1.07
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CCNDBP1-211ENST00000567434 WASHC4Q2M389 1173 aa21.71■■□□□ 1.07
CCNDBP1-211ENST00000567434 CHADLQ6NUI6 762 aa21.71■■□□□ 1.07
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CCNDBP1-211ENST00000567434 C6orf229H3BNL8 230 aa21.7■■□□□ 1.06
CCNDBP1-211ENST00000567434 ALDH1L1O75891 902 aa21.7■■□□□ 1.06
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CCNDBP1-211ENST00000567434 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.69■■□□□ 1.06
CCNDBP1-211ENST00000567434 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
CCNDBP1-211ENST00000567434 TBC1D16Q8TBP0 767 aa21.69■■□□□ 1.06
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.69■■□□□ 1.06
CCNDBP1-211ENST00000567434 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
CCNDBP1-211ENST00000567434 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa21.69■■□□□ 1.06
CCNDBP1-211ENST00000567434 POLLQ9UGP5 575 aa21.69■■□□□ 1.06
CCNDBP1-211ENST00000567434 CSF1RP07333 972 aa21.68■■□□□ 1.06
CCNDBP1-211ENST00000567434 CXCL9Q07325 125 aa21.68■■□□□ 1.06
CCNDBP1-211ENST00000567434 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa21.68■■□□□ 1.06
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