RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566059.5

SPNS1-208, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 1,615 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-208ENST00000566059 UTYO14607 1347 aa22.62■■□□□ 1.21
SPNS1-208ENST00000566059 CTSWP56202 376 aa22.61■■□□□ 1.21
SPNS1-208ENST00000566059 C7orf43Q8WVR3 580 aa22.61■■□□□ 1.21
SPNS1-208ENST00000566059 SLX4Q8IY92 1834 aa22.61■■□□□ 1.21
SPNS1-208ENST00000566059 C21orf2O43822 256 aa22.6■■□□□ 1.21
SPNS1-208ENST00000566059 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SPNS1-208ENST00000566059 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.6■■□□□ 1.21
SPNS1-208ENST00000566059 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
SPNS1-208ENST00000566059 FOXO4P98177 505 aa22.59■■□□□ 1.21
SPNS1-208ENST00000566059 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.59■■□□□ 1.21
SPNS1-208ENST00000566059 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.58■■□□□ 1.21
SPNS1-208ENST00000566059 CSF1RP07333 972 aa22.58■■□□□ 1.21
SPNS1-208ENST00000566059 GRAPQ13588 217 aa22.58■■□□□ 1.21
SPNS1-208ENST00000566059 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.58■■□□□ 1.21
SPNS1-208ENST00000566059 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
SPNS1-208ENST00000566059 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
SPNS1-208ENST00000566059 KAZALD1Q96I82 304 aa22.58■■□□□ 1.21
SPNS1-208ENST00000566059 SUCLG2Q96I99 432 aa22.58■■□□□ 1.21
SPNS1-208ENST00000566059 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.58■■□□□ 1.21
SPNS1-208ENST00000566059 PLIN1O60240 522 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-208ENST00000566059 RLBP1P12271 317 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-208ENST00000566059 OLFM4Q6UX06 510 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-208ENST00000566059 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-208ENST00000566059 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-208ENST00000566059 SLC51AQ86UW1 340 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-208ENST00000566059 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-208ENST00000566059 GREM2Q9H772 168 aa22.57■■□□□ 1.2
SPNS1-208ENST00000566059 CACNA1SQ13698 1873 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-208ENST00000566059 BBOX1O75936 387 aa22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-208ENST00000566059 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
SPNS1-208ENST00000566059 COL4A1P02462 1669 aa22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-208ENST00000566059 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
SPNS1-208ENST00000566059 TAF1P21675 1872 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-208ENST00000566059 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-208ENST00000566059 MEIS3Q99687 375 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-208ENST00000566059 RTL9Q8NET4 1388 aa22.54■■□□□ 1.2
SPNS1-208ENST00000566059 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-208ENST00000566059 PANK1Q8TE04 598 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-208ENST00000566059 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-208ENST00000566059 FAM161AQ3B820 660 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-208ENST00000566059 SOGA3Q5TF21 947 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-208ENST00000566059 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-208ENST00000566059 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa22.53■■□□□ 1.2
SPNS1-208ENST00000566059 MYH3P11055 1940 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-208ENST00000566059 NFKBIEO00221 500 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-208ENST00000566059 CCDC93Q567U6 631 aa22.52■■□□□ 1.2
SPNS1-208ENST00000566059 ITGA6P23229 1130 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 SP8Q8IXZ3 490 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.51■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 MS4A1P11836 297 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 SNED1Q8TER0 1413 aa22.5■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 GNAI3P08754 354 aa22.49■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 RASSF7Q02833 373 aa22.49■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 TMC4Q7Z404 712 aa22.49■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.49■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.49■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.49■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.48■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.48■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 PRELPP51888 382 aa22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.47■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 PDE3AQ14432 1141 aa22.46■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.46■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.46■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.46■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.46■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP22.46■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 GRIPAP1Q4V328 841 aa22.46■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 COG6Q9Y2V7 657 aa22.46■■□□□ 1.19
SPNS1-208ENST00000566059 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-208ENST00000566059 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SPNS1-208ENST00000566059 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
SPNS1-208ENST00000566059 MPNDQ8N594 471 aa22.44■■□□□ 1.18
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
SPNS1-208ENST00000566059 PSMD1Q99460 953 aa22.44■■□□□ 1.18
SPNS1-208ENST00000566059 GNAI2P04899 355 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-208ENST00000566059 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.43■■□□□ 1.18
SPNS1-208ENST00000566059 LMNB1P20700 586 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-208ENST00000566059 GPSM2P81274 684 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-208ENST00000566059 C9orf131Q5VYM1 1079 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-208ENST00000566059 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-208ENST00000566059 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-208ENST00000566059 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-208ENST00000566059 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-208ENST00000566059 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-208ENST00000566059 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
SPNS1-208ENST00000566059 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS1-208ENST00000566059 RNF181Q9P0P0 153 aa22.41■■□□□ 1.18
SPNS1-208ENST00000566059 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
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