RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565922.1

CMTM3-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM3, Length 615 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-211ENST00000565922 IGKV5-2P06315 115 aa25.33■■□□□ 1.65
CMTM3-211ENST00000565922 IARSP41252 1262 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
CMTM3-211ENST00000565922 SLFN5Q08AF3 891 aa25.33■■□□□ 1.65
CMTM3-211ENST00000565922 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
CMTM3-211ENST00000565922 NEURL1BA8MQ27 555 aa25.32■■□□□ 1.64
CMTM3-211ENST00000565922 PDE8AO60658 829 aa25.32■■□□□ 1.64
CMTM3-211ENST00000565922 SP8Q8IXZ3 490 aa25.32■■□□□ 1.64
CMTM3-211ENST00000565922 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
CMTM3-211ENST00000565922 SUPT20HQ8NEM7 779 aa25.31■■□□□ 1.64
CMTM3-211ENST00000565922 TOMM70O94826 608 aa25.3■■□□□ 1.64
CMTM3-211ENST00000565922 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
CMTM3-211ENST00000565922 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.3■■□□□ 1.64
CMTM3-211ENST00000565922 MIER1Q8N108 512 aa25.3■■□□□ 1.64
CMTM3-211ENST00000565922 LINS1Q8NG48 757 aa25.3■■□□□ 1.64
CMTM3-211ENST00000565922 JDP2Q8WYK2 163 aa25.3■■□□□ 1.64
CMTM3-211ENST00000565922 SCN4AP35499 1836 aa25.29■■□□□ 1.64
CMTM3-211ENST00000565922 VPS33BQ9H267 617 aa25.29■■□□□ 1.64
CMTM3-211ENST00000565922 RRAGCQ9HB90 399 aa25.29■■□□□ 1.64
CMTM3-211ENST00000565922 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CMTM3-211ENST00000565922 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
CMTM3-211ENST00000565922 MPNDQ8N594 471 aa25.27■■□□□ 1.64
CMTM3-211ENST00000565922 GCKRQ14397 625 aa25.26■■□□□ 1.63
CMTM3-211ENST00000565922 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CMTM3-211ENST00000565922 LARGE2Q8N3Y3 721 aa25.25■■□□□ 1.63
CMTM3-211ENST00000565922 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CMTM3-211ENST00000565922 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CMTM3-211ENST00000565922 SPEF2Q9C093 1822 aa25.24■■□□□ 1.63
CMTM3-211ENST00000565922 H7C1W4 665 aa25.24■■□□□ 1.63
CMTM3-211ENST00000565922 CTSWP56202 376 aa25.24■■□□□ 1.63
CMTM3-211ENST00000565922 RPS8P62241 208 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
CMTM3-211ENST00000565922 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa25.24■■□□□ 1.63
CMTM3-211ENST00000565922 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
CMTM3-211ENST00000565922 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
CMTM3-211ENST00000565922 CDCA7LQ96GN5 454 aa25.24■■□□□ 1.63
CMTM3-211ENST00000565922 FZD9O00144 591 aa25.23■■□□□ 1.63
CMTM3-211ENST00000565922 PPIP5K2O43314 1243 aa25.23■■□□□ 1.63
CMTM3-211ENST00000565922 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CMTM3-211ENST00000565922 F6X3S4 739 aa25.22■■□□□ 1.63
CMTM3-211ENST00000565922 EIF6P56537 245 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CMTM3-211ENST00000565922 NIM1KQ8IY84 436 aa25.22■■□□□ 1.63
CMTM3-211ENST00000565922 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CMTM3-211ENST00000565922 LTBP1Q14766 1721 aa25.22■■□□□ 1.63
CMTM3-211ENST00000565922 RTL9Q8NET4 1388 aa25.21■■□□□ 1.63
CMTM3-211ENST00000565922 PTPRCP08575 1304 aa25.21■■□□□ 1.63
CMTM3-211ENST00000565922 IQCA1LA6NCM1 817 aa25.21■■□□□ 1.63
CMTM3-211ENST00000565922 DDNO94850 711 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CMTM3-211ENST00000565922 ALDH1L2Q3SY69 923 aa25.21■■□□□ 1.63
CMTM3-211ENST00000565922 BEND3Q5T5X7 828 aa25.21■■□□□ 1.63
CMTM3-211ENST00000565922 PLA2G12BQ9BX93 195 aa25.21■■□□□ 1.63
CMTM3-211ENST00000565922 DUOX1Q9NRD9 1551 aa25.21■■□□□ 1.63
CMTM3-211ENST00000565922 COL4A1P02462 1669 aa25.2■■□□□ 1.63
CMTM3-211ENST00000565922 SLC51AQ86UW1 340 aa25.2■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa25.2■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.2■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 COL4A5P29400 1685 aa25.2■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 ZNF541Q9H0D2 1346 aa25.19■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 AOC3Q16853 763 aa25.19■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 GPC2Q8N158 579 aa25.19■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.19■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 ALDH1L1O75891 902 aa25.18■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 KIAA2012Q0VF49 1180 aa25.18■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 FSTL1Q12841 308 aa25.18■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.18■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 SSH1Q8WYL5 1049 aa25.18■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 CASP7P55210 303 aa25.17■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa25.17■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 SMC1BQ8NDV3 1235 aa25.16■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 EYA3Q99504 573 aa25.16■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 POTECB2RU33 542 aa25.15■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 GRM8O00222 908 aa25.15■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 HSPA6P17066 643 aa25.15■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 GREM2Q9H772 168 aa25.15■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.15■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 PODXL2Q9NZ53 605 aa25.15■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 ZNRF3Q9ULT6 936 aa25.15■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 C6orf229H3BNL8 230 aa25.14■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 GPSM2P81274 684 aa25.14■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 WASHC4Q2M389 1173 aa25.14■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.14■■□□□ 1.62
CMTM3-211ENST00000565922 HACL1Q9UJ83 578 aa25.13■■□□□ 1.61
CMTM3-211ENST00000565922 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CMTM3-211ENST00000565922 BCL2L13Q9BXK5 485 aa25.12■■□□□ 1.61
CMTM3-211ENST00000565922 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
CMTM3-211ENST00000565922 GJA3Q9Y6H8 435 aa25.12■■□□□ 1.61
CMTM3-211ENST00000565922 XDHP47989 1333 aa25.12■■□□□ 1.61
CMTM3-211ENST00000565922 CSF1RP07333 972 aa25.11■■□□□ 1.61
CMTM3-211ENST00000565922 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
CMTM3-211ENST00000565922 TBC1D16Q8TBP0 767 aa25.11■■□□□ 1.61
CMTM3-211ENST00000565922 GGA1Q9UJY5 639 aa25.11■■□□□ 1.61
CMTM3-211ENST00000565922 ITGA6P23229 1130 aa25.1■■□□□ 1.61
CMTM3-211ENST00000565922 FAM161AQ3B820 660 aa25.1■■□□□ 1.61
CMTM3-211ENST00000565922 POLLQ9UGP5 575 aa25.1■■□□□ 1.61
CMTM3-211ENST00000565922 UFL1O94874 794 aa25.09■■□□□ 1.61
CMTM3-211ENST00000565922 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.09■■□□□ 1.61
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