RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555063.5

WARS-222, Transcript of tryptophanyl-tRNA synthetase, human

TSL 2

Gene WARS, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
WARS-222	ENST00000555063	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
WARS-222	ENST00000555063	CTSW	P56202	376 aa		18.84	■□□□□ 0.61
WARS-222	ENST00000555063	CCDC93	Q567U6	631 aa		18.84	■□□□□ 0.61
WARS-222	ENST00000555063	GRAP	Q13588	217 aa		18.83	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		18.83	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	UTRN	P46939	3433 aa		18.83	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	SBF1	O95248	1867 aa		18.82	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		18.82	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		18.82	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	SPEF2	Q9C093	1822 aa		18.81	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		18.81	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	TMC4	Q7Z404	712 aa		18.81	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		18.81	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		18.8	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	BBOX1	O75936	387 aa		18.8	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	CASP7	P55210	303 aa		18.8	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	RASSF7	Q02833	373 aa		18.8	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	18.8	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		18.8	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	TRIM27	P14373	513 aa		18.79	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	YY1	P25490	414 aa		18.79	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		18.79	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		18.79	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		18.79	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		18.79	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	RTL9	Q8NET4	1388 aa		18.79	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		18.78	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	NFKBIE	O00221	500 aa		18.78	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		18.78	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	18.78	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		18.78	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		18.78	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		18.78	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	LMNB1	P20700	586 aa		18.77	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		18.77	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	RNF181	Q9P0P0	153 aa		18.77	■□□□□ 0.6
WARS-222	ENST00000555063	UTY	O14607	1347 aa		18.76	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	18.76	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	18.76	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	OLFM4	Q6UX06	510 aa		18.76	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		18.76	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	SP8	Q8IXZ3	490 aa		18.76	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		18.76	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	GREM2	Q9H772	168 aa		18.76	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	FAM161A	Q3B820	660 aa		18.75	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		18.75	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	SUCLG2	Q96I99	432 aa		18.75	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		18.75	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	COL4A1	P02462	1669 aa		18.75	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		18.74	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	CSF1R	P07333	972 aa		18.74	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	ITGA6	P23229	1130 aa		18.74	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	PSMD1	Q99460	953 aa		18.74	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	USP44	Q9H0E7	712 aa		18.74	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	MS4A1	P11836	297 aa		18.73	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	FOXO4	P98177	505 aa		18.73	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		18.73	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	MPND	Q8N594	471 aa		18.73	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	18.73	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	SNED1	Q8TER0	1413 aa		18.73	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		18.72	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		18.72	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		18.72	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		18.72	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	TNN	Q9UQP3	1299 aa		18.72	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	18.72	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	GNAI3	P08754	354 aa		18.71	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		18.71	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		18.71	■□□□□ 0.59
WARS-222	ENST00000555063	LTBP1	Q14766	1721 aa		18.7	■□□□□ 0.58
WARS-222	ENST00000555063	SLC51A	Q86UW1	340 aa		18.7	■□□□□ 0.58
WARS-222	ENST00000555063	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		18.7	■□□□□ 0.58
WARS-222	ENST00000555063	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	18.7	■□□□□ 0.58
WARS-222	ENST00000555063	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
WARS-222	ENST00000555063	MEIS3	Q99687	375 aa		18.69	■□□□□ 0.58
WARS-222	ENST00000555063	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	18.69	■□□□□ 0.58
WARS-222	ENST00000555063	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		18.69	■□□□□ 0.58
WARS-222	ENST00000555063	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	18.69	■□□□□ 0.58
WARS-222	ENST00000555063	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		18.68	■□□□□ 0.58
WARS-222	ENST00000555063	PRELP	P51888	382 aa		18.68	■□□□□ 0.58
WARS-222	ENST00000555063	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	18.68	■□□□□ 0.58
WARS-222	ENST00000555063	KAZALD1	Q96I82	304 aa		18.68	■□□□□ 0.58
WARS-222	ENST00000555063	XDH	P47989	1333 aa		18.68	■□□□□ 0.58
WARS-222	ENST00000555063		A0A1B0GUL6	1792 aa		18.68	■□□□□ 0.58
WARS-222	ENST00000555063	PPIP5K2	O43314	1243 aa		18.67	■□□□□ 0.58
WARS-222	ENST00000555063	GPSM2	P81274	684 aa		18.67	■□□□□ 0.58
WARS-222	ENST00000555063	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		18.67	■□□□□ 0.58
WARS-222	ENST00000555063	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		18.67	■□□□□ 0.58

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