RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 CITED4Q96RK1 184 aa4.64□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 CEP89Q96ST8 783 aa4.64□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 CYLDQ9NQC7 956 aa4.64□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa4.64□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 COMMD10Q9Y6G5 202 aa4.64□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 WDR4P57081 412 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 NNTQ13423 1086 aa4.63□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 MTMR3Q13615 1198 aa4.63□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 WDR78Q5VTH9 848 aa4.63□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 KRBA2Q6ZNG9 492 aa4.63□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa4.63□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 STAG1Q8WVM7 1258 aa4.63□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 TRIM52Q96A61 297 aa4.63□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 C8orf48Q96LL4 319 aa4.63□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 SEPT3Q9UH03 358 aa4.63□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa4.63□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 FGRP09769 529 aa4.62□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 VARSP26640 1264 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP4.62□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 C4orf48Q5BLP8 95 aa4.62□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 ODR4Q5SWX8 454 aa4.62□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 C6orf118Q5T5N4 469 aa4.62□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 CLEC4GQ6UXB4 293 aa4.62□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 SIX5Q8N196 739 aa4.62□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 RELTQ969Z4 430 aa4.62□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 SCYL1Q96KG9 808 aa4.62□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 DMRTB1Q96MA1 342 aa4.62□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 ENAMQ9NRM1 1142 aa4.62□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 DNMT3LQ9UJW3 386 aa4.62□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 CHIC2Q9UKJ5 165 aa4.62□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 WWC3Q9ULE0 1092 aa4.62□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 PLIN1O60240 522 aa4.61□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 ADAMTS2O95450 1211 aa4.61□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 CHMP4BP1P59074 171 aa4.61□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 AMPD3Q01432 767 aa4.61□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 EHHADHQ08426 723 aa4.61□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 DSC3Q14574 896 aa4.61□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 PODNQ7Z5L7 613 aa4.61□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 C11orf96Q7Z7L8 435 aa4.61□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 USP48Q86UV5 1035 aa4.61□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 FERMT3Q86UX7 667 aa4.61□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 SEPT12Q8IYM1 358 aa4.61□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 FAM9BQ8IZU0 186 aa4.61□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 HELQQ8TDG4 1101 aa4.61□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 PKNOX2Q96KN3 472 aa4.61□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 MKNK1Q9BUB5 465 aa4.61□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 KIAA1024Q9UPX6 916 aa4.61□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa4.61□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa4.61□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 TLL2Q9Y6L7 1015 aa4.61□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 ERVH48-1M5A8F1 160 aa4.6□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 KIF3BO15066 747 aa4.6□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 NPR3P17342 541 aa4.6□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 MCCP23508 829 aa4.6□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 RACK1P63244 317 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 UBE4AQ14139 1066 aa4.6□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 ZNF394Q53GI3 561 aa4.6□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 ARSHQ5FYA8 562 aa4.6□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 ALG1LQ6GMV1 187 aa4.6□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.6□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 SIRPGQ9P1W8 387 aa4.6□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 ESPNB1AK53 854 aa4.59□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 CDC45O75419 566 aa4.59□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 DKK1O94907 266 aa4.59□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 LIG1P18858 919 aa4.59□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 SERINC3Q13530 473 aa4.59□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa4.59□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 HS2ST1Q7LGA3 356 aa4.59□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 MPNDQ8N594 471 aa4.59□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 COL26A1Q96A83 441 aa4.59□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 CRELD1Q96HD1 420 aa4.59□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 SENP7Q9BQF6 1050 aa4.59□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 MTA3Q9BTC8 594 aa4.59□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 JADE2Q9NQC1 790 aa4.59□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 RNF19AQ9NV58 838 aa4.59□□□□□ -1.67
CS-232ENST00000552331 SERTAD1Q9UHV2 236 aa4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms